CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G1364
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	RAB6-interacting golgin
Genome location	ctg1:12351216..12352117
RNA-Seq Expression	Cucsat.G1364
Synteny	Cucsat.G1364
Gene Ontology terms	GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domains	IPR007033 - RAB6-interacting golgin

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0033596.1 hypothetical protein E6C27_scaffold239G00290 [Cucumis melo var. makuwa]

3.67e-161

97.27

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQ+EEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV  MGGAQNSRVSDSS VATTTETGAK NENVPNQTTSDAA
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

KAG6574142.1 hypothetical protein SDJN03_28029, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

7.81e-134

85.33

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSH---DVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTT
        WEAASKVVQ+EEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    +  TMG AQNSRV+DSSGVAT+TE TGAK NE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSH---DVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTT

Query:  SDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

XP_008439146.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484029 [Cucumis melo]

2.84e-134

93.89

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQ+EEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV  MGGAQNSRVSDSS VATTTETGAK NENVPNQTTSDAA
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGK
        PVINGQNQKPPSETEGRGK+K  F   G+
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGK

XP_011651127.1 uncharacterized protein LOC101210795 [Cucumis sativus]

5.93e-167

100

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

XP_038898541.1 uncharacterized protein LOC120086143 [Benincasa hispida]

1.59e-155

93.75

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIE+STERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQ+EEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNS+RVSTS+SHDV TMGGAQNSR +DSSGVAT+TETGAK +ENVPN    D A
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L8J1 RAB6-interacting golgin

3.26e-148

92.58

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP                   IIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

A0A1S3AY16 RAB6-interacting golgin

1.37e-134

93.89

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQ+EEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV  MGGAQNSRVSDSS VATTTETGAK NENVPNQTTSDAA
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGK
        PVINGQNQKPPSETEGRGK+K  F   G+
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGK

A0A5D3DFA0 RAB6-interacting golgin

1.78e-161

97.27

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA
        WEAASKVVQ+EEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV  MGGAQNSRVSDSS VATTTETGAK NENVPNQTTSDAA
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

A0A6J1G2D4 uncharacterized protein LOC111450054

3.78e-134

85.33

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSH---DVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTT
        WEAASKVVQ+EEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    +  TMG AQNSRV+DSSGVAT+TET GAK NE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSH---DVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTT

Query:  SDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

A0A6J1HV58 uncharacterized protein LOC111467736

6.25e-133

84.94

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLP IGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSH---DVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTT
        WEAASKVVQ+EEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    +  TM  AQNSRV+DSSGVAT+TET GAK NE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSH---DVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTT

Query:  SDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G51840.1 unknown protein

6.3e-63

59.14

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        M SDP L   IG DGLAREAPVIAYTEKIIEE  +QLRK I+EN +KIRDVERE  NL+ME+KLT+GPKKAA+E LRKKIE+STER+ AAKLKEE+A+K 
Subjt:  MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTTSDA
        +EAASKVV++EEA KQ LCEDLN LVQ+SSN Q  RLEELKRR+EALN +R STS+      +   +   V DS+  A   +T   KP  N  N+     
Subjt:  WEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTTSDA

Query:  APVINGQNQKP-PSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
                Q+P  +E E + KKK Q  GRG+GIG + KGR     GWTG+GFDVDGR
Subjt:  APVINGQNQKP-PSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGTTCCGATCCCTCTCTTTTGCCTGTGATCGGCCCTGATGGACTTGCCAGGGAAGCTCCTGTCATTGCTTACACTGAGAAGATAATCGAAGAAGGGAGTCTTCAATT
GAGAAAATGTATTGATGAAAATTTATCTAAAATTCGGGATGTTGAACGGGAATTGGCAAATCTTACAATGGAGATGAAACTCACATCTGGGCCTAAAAAAGCAGCTCTTG
AACTTTTGCGGAAGAAAATAGAAATGTCAACTGAGAGAGTACGTGCAGCTAAGTTGAAGGAAGAACAAGCAAAGAAGGTTTGGGAAGCAGCATCAAAGGTAGTGCAAGAA
GAGGAAGCAGCTAAGCAAAAATTGTGTGAAGACTTGAATCATCTGGTTCAAGAAAGCAGTAACTTCCAGTTGACAAGACTTGAAGAACTAAAAAGGCGCATGGAAGCGTT
GAATTCAAGTCGAGTATCAACCTCTGTTTCTCATGATGTCATGACAATGGGAGGTGCTCAGAATAGCAGAGTGTCAGATTCTTCTGGAGTTGCTACAACAACAGAAACTG
GTGCAAAACCAAATGAAAATGTCCCCAATCAAACAACCAGTGATGCAGCTCCAGTGATAAATGGGCAAAATCAAAAGCCCCCTTCTGAGACAGAAGGAAGAGGAAAAAAG
AAAAATCAGTTTCATGGAAGAGGGAAGGGAATTGGAGCAGTGCCTAAAGGAAGAAGCTCTGCAGACTCTGGCTGGACTGGGTCTGGATTTGATGTGGATGGTAGAGCATG
A

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGSDPSLLPVIGPDGLAREAPVIAYTEKIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQE
EEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGAQNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKK
KNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

Cucsat.G1364 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome