; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G14872 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G14872
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionAspergillus nuclease S(1)
Genome locationctg1869:6523380..6526005
RNA-Seq ExpressionCucsat.G14872
SyntenyCucsat.G14872
Gene Ontology termsGO:0006308 - DNA catabolic process (biological process)
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GO:0090502 - RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
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GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0004521 - endoribonuclease activity (molecular function)
GO:0008309 - double-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity (molecular function)
GO:0016891 - endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters (molecular function)
GO:0043765 - T/G mismatch-specific endonuclease activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003154 - S1/P1 nuclease
IPR008947 - Phospholipase C/P1 nuclease domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584021.1 Endonuclease 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.32e-16577.29Show/hide
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XP_023000814.1 endonuclease 1 [Cucurbita maxima]1.63e-16577.29Show/hide
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XP_038895329.1 LOW QUALITY PROTEIN: endonuclease 1-like [Benincasa hispida]7.35e-17881.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LUG7 Aspergillus nuclease S(1)1.95e-181100Show/hide
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A0A1S3B4B0 Aspergillus nuclease S(1)2.25e-20791.72Show/hide
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A0A5D3DSP7 Aspergillus nuclease S(1)2.25e-20791.72Show/hide
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A0A6J1KL07 Aspergillus nuclease S(1)7.90e-16677.29Show/hide
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C3VEY2 Aspergillus nuclease S(1)1.10e-227100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JJL0 Endonuclease 44.9e-8054.1Show/hide
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        E C     +C N +A ES  LACK+AY     G TL ++Y+ SRLPIV +RLAQGG+RLA  LNR+F+
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F4JJL3 Endonuclease 58.4e-7248.08Show/hide
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        L  +S L++     G   W K+GH   C++A+     +   AV+ LLPES  GG L+  C WPD+I+  S+++W S LHY NTP+  C++ Y RDCH+  
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Query:  GQPDMCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLL
           D CV GAI N+T QL +      +  H NLTEALLFLSH++GD+HQPLH GF  D GGNTI V W+  KSNLHHVWD  II  AL  YY+     ++
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          L   L  G WSNDV  W+ C     +C N +A ES  LACK+AY     G TL +EY+ SRLP+V +RLAQGG+RLA  LNR+F+
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Q8LDW6 Endonuclease 32.1e-7048.06Show/hide
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        +S L++     G   W   GH   C+IAQ     +   AV+ LLPESA G L+A+C WPD+I+   ++RW S LH+A+TPD  C++ Y RDC       D
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         CV GAI N+T QL +         H NLTEAL+FLSH++GDIHQPLH GF  D GGN I+V W+ +++NLH VWD  II  AL  YY+     ++ EL 
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          L  G WSNDV  WE C     +C N +A ES  LACK+AY    AG TL + Y+ SRLP+V +RLAQGG+RLA  LNR+F+
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Q9C9G4 Endonuclease 21.7e-8552.65Show/hide
Query:  LVVLIFISFLLVLPCAQGWSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESAGGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPDSCSFVYKRDCHNDAGQ
        ++++I +  L   P   GW KEGH + C+IAQ  L   AA+AV++LLPESA G+LS++C+W D+++   +Y W+SPLHY NTPD+CS+ Y RDC +++G+
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Query:  PDMCVAGAIRNFTTQLTTYRT-QGFDSPHNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDE
           CVAGAI N+TTQL +Y+T     S +NLTEALLF+SHF+GDIHQPLHV + SD GGNTIEV W+ RK+NLHH+WD +II  A  D Y+     ++D 
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Query:  LNRNLTQGIWSNDVSEWERCSTVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVF
        L +N+T   W++ V  WE C+   +C + +A E    AC WAY+GV  G TL +EY+ SRLPIV +RLAQGGVRLA  LNR+F
Subjt:  LNRNLTQGIWSNDVSEWERCSTVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVF

Q9SXA6 Endonuclease 11.6e-9958.39Show/hide
Query:  LVVLIFISFLLVLPCAQGWSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESAGGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPD-SCSFVYKRDCHNDAG
        L++++ I  L  +   + WSKEGHILTC IAQ LL    A  V++LLP+   G+LSA+CVWPDQIR   KYRW S LHY +TPD +CS+ Y RDCH+  G
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Query:  QPDMCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPHNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDE
          DMCV GAI+NFT+QL  Y     D  +N+TEALLFLSHF+GDIHQP+HVGF SD GGNTI++RW++ KSNLHHVWDR+IIL AL + YDK+  LL ++
Subjt:  QPDMCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPHNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDE

Query:  LNRNLTQGIWSNDVSEWERCSTVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFAED
        L +N+T G+W +D+S W  C+ + +C +++A ES  LACKW Y+GV++G TLSEEY+++RLPIVM+R+ QGGVRLAM+LNRVF++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11190.1 bifunctional nuclease i1.2e-10058.39Show/hide
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        L++++ I  L  +   + WSKEGHILTC IAQ LL    A  V++LLP+   G+LSA+CVWPDQIR   KYRW S LHY +TPD +CS+ Y RDCH+  G
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Query:  QPDMCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPHNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDE
          DMCV GAI+NFT+QL  Y     D  +N+TEALLFLSHF+GDIHQP+HVGF SD GGNTI++RW++ KSNLHHVWDR+IIL AL + YDK+  LL ++
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Query:  LNRNLTQGIWSNDVSEWERCSTVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFAED
        L +N+T G+W +D+S W  C+ + +C +++A ES  LACKW Y+GV++G TLSEEY+++RLPIVM+R+ QGGVRLAM+LNRVF++D
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AT1G68290.1 endonuclease 21.2e-8652.65Show/hide
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        ++++I +  L   P   GW KEGH + C+IAQ  L   AA+AV++LLPESA G+LS++C+W D+++   +Y W+SPLHY NTPD+CS+ Y RDC +++G+
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Query:  PDMCVAGAIRNFTTQLTTYRT-QGFDSPHNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDE
           CVAGAI N+TTQL +Y+T     S +NLTEALLF+SHF+GDIHQPLHV + SD GGNTIEV W+ RK+NLHH+WD +II  A  D Y+     ++D 
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Query:  LNRNLTQGIWSNDVSEWERCSTVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVF
        L +N+T   W++ V  WE C+   +C + +A E    AC WAY+GV  G TL +EY+ SRLPIV +RLAQGGVRLA  LNR+F
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AT4G21585.1 endonuclease 43.5e-8154.1Show/hide
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        W KEGH   C+IA+     E   AV+ LLP+SA G+L+++C WPD+I+   ++RW SPLHY +TPD  C++ Y RDCH+     D CV GAI N+T QL 
Subjt:  WSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESAGGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPD-SCSFVYKRDCHNDAGQPDMCVAGAIRNFTTQLT

Query:  TYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDELNRNLTQGIWSNDVSEW
        +         H NLTEAL+FLSHF+GDIHQPLHVGF  D GGNTI VRW+RRK+NLHHVWD  II  AL  YY+K   L+++ L  NLT   WSNDV  W
Subjt:  TYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDELNRNLTQGIWSNDVSEW

Query:  ERCS-TVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFA
        E C     +C N +A ES  LACK+AY     G TL ++Y+ SRLPIV +RLAQGG+RLA  LNR+F+
Subjt:  ERCS-TVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFA

AT4G21590.1 endonuclease 31.5e-7148.06Show/hide
Query:  ISFLLVLPCAQG---WSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESAGGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPD-SCSFVYKRDCHNDAGQPD
        +S L++     G   W   GH   C+IAQ     +   AV+ LLPESA G L+A+C WPD+I+   ++RW S LH+A+TPD  C++ Y RDC       D
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Query:  MCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDELN
         CV GAI N+T QL +         H NLTEAL+FLSH++GDIHQPLH GF  D GGN I+V W+ +++NLH VWD  II  AL  YY+     ++ EL 
Subjt:  MCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDELN

Query:  RNLTQGIWSNDVSEWERCS-TVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFA
          L  G WSNDV  WE C     +C N +A ES  LACK+AY    AG TL + Y+ SRLP+V +RLAQGG+RLA  LNR+F+
Subjt:  RNLTQGIWSNDVSEWERCS-TVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFA

AT4G21600.1 endonuclease 56.0e-7348.08Show/hide
Query:  LIFISFLLVLPCAQG---WSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESA-GGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPD-SCSFVYKRDCHNDA
        L  +S L++     G   W K+GH   C++A+     +   AV+ LLPES  GG L+  C WPD+I+  S+++W S LHY NTP+  C++ Y RDCH+  
Subjt:  LIFISFLLVLPCAQG---WSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESA-GGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPD-SCSFVYKRDCHNDA

Query:  GQPDMCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLL
           D CV GAI N+T QL +      +  H NLTEALLFLSH++GD+HQPLH GF  D GGNTI V W+  KSNLHHVWD  II  AL  YY+     ++
Subjt:  GQPDMCVAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPH-NLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLL

Query:  DELNRNLTQGIWSNDVSEWERCS-TVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFA
          L   L  G WSNDV  W+ C     +C N +A ES  LACK+AY     G TL +EY+ SRLP+V +RLAQGG+RLA  LNR+F+
Subjt:  DELNRNLTQGIWSNDVSEWERCS-TVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACAGGAGCTACTGATTCCAGAGGCAGCAGAGGCAGTTCAAGATCTGTTACCTGAAAGTGCCGGAGGAAATCTATCGGCTATGTGCGTATGGCCGGACCAAATCCGACTCC
AGTCTAAGTACCGCTGGGCCAGTCCCCTTCACTACGCCAACACCCCCGACTCTTGTTCTTTCGTCTACAAAAGGGATTGTCATAATGACGCCGGACAGCCGGACATGTGC
GTCGCCGGTGCCATTCGAAATTTCACCACTCAGCTCACAACCTACCGAACACAAGGCTTCGACAGTCCTCATAACTTGACCGAGGCCTTGCTCTTTCTATCGCATTTCGT
TGGGGATATTCATCAGCCATTGCATGTGGGGTTCGAGAGTGATGCGGGAGGAAACACCATAGAAGTACGATGGTTCCGTCGTAAATCAAACCTCCATCACGTGTGGGATA
GAGACATTATTCTTGAAGCTCTAGGAGATTATTACGACAAAGACGGTGGCCTTCTCTTAGATGAACTTAACCGGAATTTAACTCAGGGAATTTGGAGCAATGACGTTTCG
GAATGGGAGCGTTGTTCTACTGTTAATTCATGTGTTAATAGGTGGGCTGATGAGAGTACAGGGTTGGCTTGCAAGTGGGCATATGAAGGAGTTGAAGCTGGTATTACTTT
ATCAGAGGAATACTACGATTCAAGGTTGCCAATTGTGATGGAACGATTAGCTCAAGGTGGGGTCCGGTTGGCAATGCTCTTGAACCGGGTTTTTGCTGAAGATGCTACAC
GAGGATTTGCCTATTCATCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GAGGATTTGCCTATTCATCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKLVFLVVLIFISFLLVLPCAQGWSKEGHILTCEIAQELLIPEAAEAVQDLLPESAGGNLSAMCVWPDQIRLQSKYRWASPLHYANTPDSCSFVYKRDCHNDAGQPDMC
VAGAIRNFTTQLTTYRTQGFDSPHNLTEALLFLSHFVGDIHQPLHVGFESDAGGNTIEVRWFRRKSNLHHVWDRDIILEALGDYYDKDGGLLLDELNRNLTQGIWSNDVS
EWERCSTVNSCVNRWADESTGLACKWAYEGVEAGITLSEEYYDSRLPIVMERLAQGGVRLAMLLNRVFAEDATRGFAYSS