; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G15197 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G15197
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description50S ribosomal protein L23, chloroplastic
Genome locationctg197:756497..758215
RNA-Seq ExpressionCucsat.G15197
SyntenyCucsat.G15197
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001014 - Ribosomal protein L23/L25, conserved site
IPR005633 - Ribosomal protein L23/L25, N-terminal
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR012678 - Ribosomal protein L23/L15e core domain superfamily
IPR013025 - Ribosomal protein L25/L23
IPR019985 - Ribosomal protein L23


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600068.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.93e-9992.86Show/hide
Query:  FLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMK
        F   +V +SG GSSAMAPKADSSKKADPKAQALK AKAVK+GPTFK KAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMK
Subjt:  FLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMK

Query:  KIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        KIEDNNTLVFIVDIRANKK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  KIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

KAG6601015.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.85e-9692.9Show/hide
Query:  SISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTE
        S+SP  SS+V +SG GSSAMAPKAD+ KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTE
Subjt:  SISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTE

Query:  SAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        SAMKKIEDNNTLVFIVDIRA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  SAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

KAG7031627.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.77e-10293.6Show/hide
Query:  SISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTE
        S+SP  SS+V +SG GSSAMAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTE
Subjt:  SISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTE

Query:  SAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        SAMKKIEDNNTLVFIVDIRA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  SAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_004147702.1 60S ribosomal protein L23a [Cucumis sativus]2.41e-98100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_038891458.1 60S ribosomal protein L23a [Benincasa hispida]5.66e-9799.35Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIK AVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS61 50S ribosomal protein L23, chloroplastic6.50e-123100Show/hide
Query:  LLKAISNSSILETLIRPQPSISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISV
        LLKAISNSSILETLIRPQPSISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISV
Subjt:  LLKAISNSSILETLIRPQPSISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISV

Query:  TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A1S3CFM9 50S ribosomal protein L23, chloroplastic1.17e-98100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A5A7U4W7 50S ribosomal protein L23, chloroplastic1.17e-98100Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A5D3C5W3 50S ribosomal protein L23, chloroplastic6.45e-9697.39Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS+KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKK+RNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1K8U2 50S ribosomal protein L23, chloroplastic2.25e-9698.04Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22644 60S ribosomal protein L23A4.9e-6588.31Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP A  +KK D KAQALK AKAVKSG  T +KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS  PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IK AVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALD+ANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q07761 60S ribosomal protein L23a2.6e-6688.96Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP KAD SKK+DPKAQA K AKAVKSG T KKK++KIRT VTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS   RNKLDQY ILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        +A+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q8LD46 60S ribosomal protein L23a-18.3e-6587.01Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9AT35 60S ribosomal protein L23a3.0e-6790.26Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KK+D KAQALKTAKAVKSG T  KK KKIRTSVTFHRP+TL KDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RANKK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9M3C3 60S ribosomal protein L23a-29.2e-6486.36Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39460.1 ribosomal protein L23AA5.9e-6687.01Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT2G39460.2 ribosomal protein L23AA5.9e-6687.01Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.1 ribosomal protein L23AB6.5e-6586.36Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.2 ribosomal protein L23AB6.5e-6586.36Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.3 ribosomal protein L23AB1.5e-6183.77Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALK AKAVKSG        KIRT VTFHRPKTL   R PKYP+IS TPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CTATTGAAGGCCATATCTAATAGCTCCATTTTAGAAACCCTAATTCGGCCGCAGCCTTCCATCTCGCCATTCCTCTCTTCGCAGGTAAGTTTTTCTGGTCAAGGATCTTC
AGCAATGGCACCTAAAGCTGATAGTAGCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCTAAGGCAGTCAAGTCTGGCCCAACTTTCAAGAAGAAGGCTAAGA
AGATTAGAACTTCAGTCACATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCTAGAATCAGTGTTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCAGTATCAA
ATTCTGAAATATCCATTGACCACAGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAGGACAATAACACCCTCGTCTTTATTGTTGACATTCGTGCCAACAAGAAAAATATTAAAGATGC
TGTGAAGAAGATGTATGATATTCAGACCAAGAAAGTTAACACTTTAATCAGACCCGACGGAACGAAGAAGGCATATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTTGATG
TGGCGAACAAGATTGGTATCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTATTGAAGGCCATATCTAATAGCTCCATTTTAGAAACCCTAATTCGGCCGCAGCCTTCCATCTCGCCATTCCTCTCTTCGCAGGTAAGTTTTTCTGGTCAAGGATCTTC
AGCAATGGCACCTAAAGCTGATAGTAGCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCTAAGGCAGTCAAGTCTGGCCCAACTTTCAAGAAGAAGGCTAAGA
AGATTAGAACTTCAGTCACATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCTAGAATCAGTGTTACTCCAAGGAACAAGTTGGATCAGTATCAA
ATTCTGAAATATCCATTGACCACAGAGTCTGCAATGAAGAAGATTGAGGACAATAACACCCTCGTCTTTATTGTTGACATTCGTGCCAACAAGAAAAATATTAAAGATGC
TGTGAAGAAGATGTATGATATTCAGACCAAGAAAGTTAACACTTTAATCAGACCCGACGGAACGAAGAAGGCATATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTTGATG
TGGCGAACAAGATTGGTATCATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LLKAISNSSILETLIRPQPSISPFLSSQVSFSGQGSSAMAPKADSSKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISVTPRNKLDQYQ
ILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRANKKNIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII