; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G15233 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G15233
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description17.8 kDa class I heat shock protein
Genome locationctg197:1557226..1558889
RNA-Seq ExpressionCucsat.G15233
SyntenyCucsat.G15233
Gene Ontology termsGO:0006457 - protein folding (biological process)
GO:0009408 - response to heat (biological process)
GO:0009651 - response to salt stress (biological process)
GO:0042542 - response to hydrogen peroxide (biological process)
GO:0051259 - protein complex oligomerization (biological process)
GO:0043621 - protein self-association (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002068 - Alpha crystallin/Hsp20 domain
IPR008978 - HSP20-like chaperone
IPR031107 - Small heat shock protein HSP20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF3774074.1 heat shock protein [Nymphaea thermarum]2.45e-4956.86Show/hide
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        MS+I    G   RR+  FDPF L+ WD  +          ASAF   Q+DWKETP AH+FKADLPGLK EEV +++ E ++L++SGER +ET+E+ E+WH
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        R+ER SGKFLRRFRLPEN KVED+  SME+G+LTV VPK+E  KP+++SI IS
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XP_004150237.2 18.1 kDa class I heat shock protein [Cucumis sativus]1.91e-130100Show/hide
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        DLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
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XP_022139109.1 18.1 kDa class I heat shock protein-like [Momordica charantia]1.18e-4956.79Show/hide
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        MSLI  + GGRR  +  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEV ++V E ++L++SGER KE
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         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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XP_031490427.1 17.8 kDa class I heat shock protein-like [Nymphaea colorata]2.51e-4957.79Show/hide
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        PMS+I    G   RR+  FDPF L+ WD  +  A        SAF   Q+DWKETP AH+FKADLPGLK EEV +++ E ++L++SGER +ET+E+ E+W
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        HRVER SGKFLRRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPE++SI IS
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XP_038892902.1 17.8 kDa class I heat shock protein-like [Benincasa hispida]2.88e-7177.93Show/hide
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        MSLIRRMTGGRRR N+++DPF LE+W+  EET SAFM T+IDWKETPNAHIFKADLPG+K  EV M+V E +ILELSGER KE +EESE+W+RVERRSGK
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        FLRRFRLPENVKVED+N SMEDG+LTV +PKIE +KPEIKSIAIS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP16 SHSP domain-containing protein9.26e-131100Show/hide
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        MDNDGIHYQDKHGGTETFKTTVPTQLIPFPPYLLQSSVRRRFKERPMSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKA
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        DLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
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A0A1S3CQK2 17.6 kDa class I heat shock protein 3-like2.16e-4957.5Show/hide
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        MSLI  + GGRR  +  FDPF L+ WD               SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEV ++V E ++L++SGER KE +
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Query:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        E++++WHRVER SGKF RRFRLPEN KVE++  +ME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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A0A5D3DH18 17.6 kDa class I heat shock protein 3-like2.16e-4957.5Show/hide
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        MSLI  + GGRR  +  FDPF L+ WD               SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEV ++V E ++L++SGER KE +
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Query:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        E++++WHRVER SGKF RRFRLPEN KVE++  +ME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
Subjt:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS

A0A6J1CC00 18.1 kDa class I heat shock protein-like5.70e-5056.79Show/hide
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        MSLI  + GGRR  +  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AHIFKADLPG+K EEV ++V E ++L++SGER KE
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         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
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A0A6J1CEM2 17.3 kDa class I heat shock protein-like1.62e-4955.56Show/hide
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        MSLI  + GGRR  +  FDPF L+ WD                 SS    SAF  T+IDWKETP AH+FKADLPG+K EEV ++V E ++L++SGER +E
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Query:  TKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
         +E++++WHR+ER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+LTV VPK+E  KPEIKSI IS
Subjt:  TKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82011 17.7 kDa class I heat shock protein4.3e-3854.55Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEE---------TASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEW
        MSLI R+ G RR  +M FDPF ++ +D   E           SAF  T+IDWKETP AH+FKADLPGLK+EEV ++V E ++L++SGER  E ++++++W
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         RVER SGKF+RRFRLPEN K++ +  SME+G+LTV VPK E  KP++KSI IS
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P05478 18.5 kDa class I heat shock protein3.3e-3851.85Show/hide
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        MSLI    GG  RRN  FDPF L+ WD  ++                   SAF+ T++DWKETP AH+FKAD+PGLK EEV + + + K+L++SGER  E
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Query:  TKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
         +++++ WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE +  SME+G+LTV VPK E  KP++K+I IS
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P19036 17.4 kDa class I heat shock protein1.5e-3852.23Show/hide
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        MSL+    GGRR     FDPF L+ WD  E            +  +AF   ++DW+ETP AH+FKAD+PGLK EEV ++V +  IL++SGER  E +E+S
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Query:  EEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        + WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+L+V VPK++  KPE+KS+ IS
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P19037 18.1 kDa class I heat shock protein3.3e-3851.25Show/hide
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        MSLI  + GG  RR+  FDPF  + WD               S+    +AF   ++DWKETP AH+FKADLPGLK EEV ++V +  +L++SGER KE +
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Query:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        E++++WHRVER SGKF+RRFRLPEN K+E++  +ME+G+LTV+VPK    KP++KSI IS
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P27396 17.8 kDa class I heat shock protein2.3e-3954.72Show/hide
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        MS+I    GG  RR+  FDPF L+ WD                +ETA AF+ T IDWKETP AH+FKADLPGLK EEV +++ E K+L++SGER KE +E
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Query:  ESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        ++++WHRVER SGKFLRRFRLPEN KV+++  +M +G++TV VPK+E  KPE+K+I IS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07400.1 HSP20-like chaperones superfamily protein1.2e-3549.36Show/hide
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        MSLI    G  RR N  FDPF L+ WD  +E           SA    ++DWKET  AH+FKADLPG+K EEV +++ +  +L++SGER  E +E+ + W
Subjt:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEE---------TASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEW

Query:  HRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGV--KPEIKSIAIS
        HRVER SG+F R+F+LPENVK++ +  SME+G+LTV VPK+E    K ++KSI IS
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AT1G53540.1 HSP20-like chaperones superfamily protein2.2e-3751.9Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSE-------------ETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEE
        MSLI  + GGRR     FDPF L+ +D  E                +AF   ++DW+ETP AH+FKADLPGL+ EEV ++V +  IL++SGER  E +E+
Subjt:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSE-------------ETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEE

Query:  SEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        +++WHRVER SGKF RRFRLPEN K+E+I  SME+G+L+V VPK+   KPE+KSI IS
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AT2G29500.1 HSP20-like chaperones superfamily protein3.2e-3650.33Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEETA--------SAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWH
        MS+I       RR N+ FDPF L+ WD  +E          SA +  ++DW+ETP AH+FKADLPGLK EEV +++ E  +L++SGER  E +++++ WH
Subjt:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEETA--------SAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWH

Query:  RVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        RVER SG+F RRFRLPENVK++ +  +ME+G+LTV VPK E  K ++KSI IS
Subjt:  RVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS

AT3G46230.1 heat shock protein 17.41.1e-3952.23Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSE------------ETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEES
        MSL+    GGRR     FDPF L+ WD  E            +  +AF   ++DW+ETP AH+FKAD+PGLK EEV ++V +  IL++SGER  E +E+S
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Query:  EEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        + WHRVER SGKF+RRFRLPEN KVE++  SME+G+L+V VPK++  KPE+KS+ IS
Subjt:  EEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS

AT5G59720.1 heat shock protein 18.22.4e-3951.25Show/hide
Query:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWD---------------SSEETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETK
        MSLI  + GG  RR+  FDPF  + WD               S+    +AF   ++DWKETP AH+FKADLPGLK EEV ++V +  +L++SGER KE +
Subjt:  MSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWD---------------SSEETASAFMVTQIDWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETK

Query:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS
        E++++WHRVER SGKF+RRFRLPEN K+E++  +ME+G+LTV+VPK    KP++KSI IS
Subjt:  EESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGACCTTGCAGATTGGATATTTCTATCTGCCAGAAAATGAGATCCGTTCATGTCCATCACACATTATGGACAACGACGGTATCCATTACCAAGATAAACACGGAGG
CACAGAGACATTTAAAACAACAGTACCAACCCAACTCATTCCATTTCCACCATATTTACTCCAAAGCAGTGTACGAAGGAGGTTTAAAGAAAGACCCATGTCACTGATTC
GGCGAATGACCGGCGGGAGGCGGCGAAGAAACATGTTCTTCGACCCCTTCGTATTGGAGAATTGGGATTCATCTGAAGAAACAGCCTCTGCTTTCATGGTCACTCAAATC
GACTGGAAAGAGACGCCAAATGCTCACATCTTCAAGGCGGATCTTCCTGGTTTGAAAATAGAAGAAGTGAACATGGATGTTAATGAAGCCAAAATTCTGGAGTTGAGTGG
TGAGAGAATGAAGGAGACAAAGGAGGAGAGCGAAGAGTGGCACAGAGTGGAGCGGAGGAGTGGTAAGTTCTTGAGGAGATTCAGATTGCCGGAGAATGTCAAAGTGGAGG
ACATAAATGTAAGCATGGAGGATGGGATTTTGACGGTGATTGTGCCCAAAATTGAAGGCGTAAAGCCTGAAATCAAATCCATTGCAATCTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGACCTTGCAGATTGGATATTTCTATCTGCCAGAAAATGAGATCCGTTCATGTCCATCACACATTATGGACAACGACGGTATCCATTACCAAGATAAACACGGAGG
CACAGAGACATTTAAAACAACAGTACCAACCCAACTCATTCCATTTCCACCATATTTACTCCAAAGCAGTGTACGAAGGAGGTTTAAAGAAAGACCCATGTCACTGATTC
GGCGAATGACCGGCGGGAGGCGGCGAAGAAACATGTTCTTCGACCCCTTCGTATTGGAGAATTGGGATTCATCTGAAGAAACAGCCTCTGCTTTCATGGTCACTCAAATC
GACTGGAAAGAGACGCCAAATGCTCACATCTTCAAGGCGGATCTTCCTGGTTTGAAAATAGAAGAAGTGAACATGGATGTTAATGAAGCCAAAATTCTGGAGTTGAGTGG
TGAGAGAATGAAGGAGACAAAGGAGGAGAGCGAAGAGTGGCACAGAGTGGAGCGGAGGAGTGGTAAGTTCTTGAGGAGATTCAGATTGCCGGAGAATGTCAAAGTGGAGG
ACATAAATGTAAGCATGGAGGATGGGATTTTGACGGTGATTGTGCCCAAAATTGAAGGCGTAAAGCCTGAAATCAAATCCATTGCAATCTCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METLQIGYFYLPENEIRSCPSHIMDNDGIHYQDKHGGTETFKTTVPTQLIPFPPYLLQSSVRRRFKERPMSLIRRMTGGRRRRNMFFDPFVLENWDSSEETASAFMVTQI
DWKETPNAHIFKADLPGLKIEEVNMDVNEAKILELSGERMKETKEESEEWHRVERRSGKFLRRFRLPENVKVEDINVSMEDGILTVIVPKIEGVKPEIKSIAIS