; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G15437 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G15437
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT22-like
Genome locationctg2009:4911603..4913585
RNA-Seq ExpressionCucsat.G15437
SyntenyCucsat.G15437
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060358.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Cucumis melo var. makuwa]3.03e-18596.34Show/hide
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XP_038903319.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Benincasa hispida]4.14e-13577.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBR7 Homeobox domain-containing protein1.79e-238100Show/hide
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A0A1S3BNL6 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like5.12e-18696.7Show/hide
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A0A6J1FR71 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.13e-12173.57Show/hide
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A0A6J1KP81 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like3.96e-12272.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XE76 Homeobox-leucine zipper protein HOX196.6e-4950.84Show/hide
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A2Z1U1 Homeobox-leucine zipper protein HOX119.5e-4854.29Show/hide
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        QK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQKE+ EL+A+K   P YM +   TL++CPSCERV +  +   A  +S
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              + PP
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P46603 Homeobox-leucine zipper protein HAT94.1e-6755.59Show/hide
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Query:  VELERACWRVSDE--DDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDEN
         E E    RV  +  +D+   + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DEN
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         RLQKE+QELK +KL +P YM M  +TLT CPSCER+G GG G    G            S  K  FS+   P F+NPF+NPSAAC
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P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT222.1e-7156.54Show/hide
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        MG DD   TGLVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  S   G++++          + RQ S H S + S  SG+VKRER++S   
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        TLTDENRRLQKE+Q+LKA+KL++P YM M  ATLT+CPSCER+G GG GG   A      K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
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Q8GRL4 Homeobox-leucine zipper protein HOX196.6e-4950.84Show/hide
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        SGGGG  H                S  S +V ++ +  VKRER   +EE + ER     +  DDD   +TRKKLRL+K+QSALLE+ F+++STLNPKQK 
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Query:  GLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLA----------------KPVYMQMSGATLTICPSCERV
         LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQ+E+QEL+A+K A                 P YMQ+  ATLTICPSCERV
Subjt:  GLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLA----------------KPVYMQMSGATLTICPSCERV

Query:  GTGGHGGVADGNSNPKPKFSMPPNPFFYNPFSNPSAAC
        G              K          F+NPF++ SAAC
Subjt:  GTGGHGGVADGNSNPKPKFSMPPNPFFYNPFSNPSAAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22800.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.9e-6855.59Show/hide
Query:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDTHRKVIDHVGPHHLYRQASPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEE
        MGFDD   TGLVLGLG S + ++  +T+++      SS    EP  LTL  S   GD    V+   G   L RQ S HS     S    VKRERD   E 
Subjt:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDTHRKVIDHVGPHHLYRQASPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEE

Query:  VELERACWRVSDE--DDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDEN
         E E    RV  +  +D+   + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DEN
Subjt:  VELERACWRVSDE--DDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDEN

Query:  RRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADG-----------NSNPKPKFSMPPNPFFYNPFSNPSAAC
         RLQKE+QELK +KL +P YM M  +TLT CPSCER+G GG G    G            S  K  FS+   P F+NPF+NPSAAC
Subjt:  RRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADG-----------NSNPKPKFSMPPNPFFYNPFSNPSAAC

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 31.5e-4353.49Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERACWRV---SDEDDDVCN---NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL
        S  +S V S  SGK K ER+L +          E+ E+ERA   +   SD++D   N   ++RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK++STLNPKQK  LA+QLNL
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERACWRV---SDEDDDVCN---NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL

Query:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERVG-TGGHGGVADGNSNPKPKFSMP
          RQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE LTDENRRLQKEV EL+A+KL+  +YM M    TLT+CPSCERV  T     VA    N       P
Subjt:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERVG-TGGHGGVADGNSNPKPKFSMP

Query:  PNPFFYNPFSNPSAA
         +P+   P     AA
Subjt:  PNPFFYNPFSNPSAA

AT4G16780.1 homeobox protein 22.5e-4360.87Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERACWRVSDEDDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART
        S  +S V SS   + +RE D   +          +SD++D   +N+RKKLRLSK QSA+LEE+FK +STLNPKQKQ LA+QL L  RQVEVWFQNRRART
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERACWRVSDEDDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART

Query:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERV
        K+KQTEVDCE L++CCE LT+ENRRLQKEV EL+A+KL+   YM MS   TLT+CPSCE V
Subjt:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERV

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.5e-7256.54Show/hide
Query:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDTHRKVIDHVGPHHLYRQASPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS---
        MG DD   TGLVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  S   G++++          + RQ S H S + S  SG+VKRER++S   
Subjt:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDTHRKVIDHVGPHHLYRQASPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS---

Query:  ----SEEVELERACWRVSDE-DDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCE
            +EE      C RVSD+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCE
Subjt:  ----SEEVELERACWRVSDE-DDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCE

Query:  TLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGG--VADGNSNPKPKFSMPPNPFFYNPFSNPSAAC
        TLTDENRRLQKE+Q+LKA+KL++P YM M  ATLT+CPSCER+G GG GG   A      K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
Subjt:  TLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGG--VADGNSNPKPKFSMPPNPFFYNPFSNPSAAC

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana1.2e-4871.53Show/hide
Query:  ELERACWRVSDED-DDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR
        E+ER+  R S+ED DD   +TRKKLRLSK QSA LE+SFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE+LT+ENRR
Subjt:  ELERACWRVSDED-DDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR

Query:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGT
        LQKEV+EL+ +K + P YMQ+   TLT+CPSCERV T
Subjt:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTAACTAGATTCTTTTGTGTTCTCAATTTCTTTTCTTTTCGATTAATAATCGTACCCAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTTTTTCTCTCTTCTTAAAAAC
CTTTCATATTAGTTTCTTATTGTTCACAAGTTTCGCTTTTTCCAGGTTCCCATCCACAATTATTATTTCCCTCTCACCCGAGATGGGTTTTGATGATTTTTCTAAAACAG
GGTTGGTCTTGGGATTAGGGCTCTCGGAATTAGCTGACGATCAAAGGACGACATTAAAGAAGAAACCTGCACCTTGCTCCTCCAGTTCACTTGATTTTGAGCCTTGTGTT
TTGACTTTGGGATTTTCCGGTGGTGGTGGCGACACTCATCGGAAAGTTATTGATCATGTGGGTCCTCATCATTTGTATCGCCAAGCATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTG
TTCTTCGTTCTCGGGTAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAATTGGAGAGAGCTTGTTGGAGAGTTAGTGATGAAGATGACGATGTTTGTAATA
ATACTAGAAAGAAGCTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGTTTCAAACAGAATAGCACGCTCAATCCTAAGCAAAAACAAGGGTTAGCAAGACAG
CTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACAAAAGTGAAGCAAACAGAAGTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGAC
GTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCAATAAAGCTGGCAAAACCGGTATACATGCAGATGTCAGGGGCGACATTAACCATATGCC
CCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGCGGACGGTAATTCTAATCCCAAACCCAAATTTTCAATGCCTCCTAACCCTTTCTTTTACAATCCCTTC
TCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTAACTAGATTCTTTTGTGTTCTCAATTTCTTTTCTTTTCGATTAATAATCGTACCCAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTTTTTCTCTCTTCTTAAAAAC
CTTTCATATTAGTTTCTTATTGTTCACAAGTTTCGCTTTTTCCAGGTTCCCATCCACAATTATTATTTCCCTCTCACCCGAGATGGGTTTTGATGATTTTTCTAAAACAG
GGTTGGTCTTGGGATTAGGGCTCTCGGAATTAGCTGACGATCAAAGGACGACATTAAAGAAGAAACCTGCACCTTGCTCCTCCAGTTCACTTGATTTTGAGCCTTGTGTT
TTGACTTTGGGATTTTCCGGTGGTGGTGGCGACACTCATCGGAAAGTTATTGATCATGTGGGTCCTCATCATTTGTATCGCCAAGCATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTG
TTCTTCGTTCTCGGGTAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAATTGGAGAGAGCTTGTTGGAGAGTTAGTGATGAAGATGACGATGTTTGTAATA
ATACTAGAAAGAAGCTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGTTTCAAACAGAATAGCACGCTCAATCCTAAGCAAAAACAAGGGTTAGCAAGACAG
CTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACAAAAGTGAAGCAAACAGAAGTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGAC
GTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCAATAAAGCTGGCAAAACCGGTATACATGCAGATGTCAGGGGCGACATTAACCATATGCC
CCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGCGGACGGTAATTCTAATCCCAAACCCAAATTTTCAATGCCTCCTAACCCTTTCTTTTACAATCCCTTC
TCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLTRFFCVLNFFSFRLIIVPRSLSLSLSLCFSLFLKTFHISFLLFTSFAFSRFPSTIIISLSPEMGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCV
LTLGFSGGGGDTHRKVIDHVGPHHLYRQASPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERACWRVSDEDDDVCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQ
LNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADGNSNPKPKFSMPPNPFFYNPF
SNPSAAC