; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G16111 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G16111
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionMADS-box transcription factor
Genome locationctg2194:91281..98535
RNA-Seq ExpressionCucsat.G16111
SyntenyCucsat.G16111
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BZF2 MADS-box transcription factor 23 isoform X47.11e-14490.95Show/hide
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A0A6J1E9F1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X31.25e-14189.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL162.9e-5954.17Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 275.9e-6860.44Show/hide
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          F +  + ++P        PQ+++
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 572.3e-5956.09Show/hide
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        SS+   F I    +M P+L+L Q Q +  E
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR15.5e-6661.44Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL214.1e-6156.33Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 443.9e-6761.44Show/hide
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 176.7e-5954.67Show/hide
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        H LQE +RQL G EL+GLSVK+LQN+ESQLEMSL+G+R+K+E+ L++EI EL +K N +H EN+EL +++    +EN EL  K  AYG    +       
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        H LQE HRQ+MGEELSGLSV+ LQNLE+QLE+SL+GVR+KK++ L +EI  L ++GN +HQEN++L+K++++  ++N EL  K       E++    +++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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