| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6579070.1 hypothetical protein SDJN03_23518, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.75e-125 | 96.15 | Show/hide |
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| KAG7032688.1 hypothetical protein SDJN02_06738, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.69e-126 | 97.24 | Show/hide |
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| A0A2I4HHD1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.33e-124 | 98.3 | Show/hide |
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| A0A6J1E6V3 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like | 9.33e-125 | 98.86 | Show/hide |
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| A0A6J1FGH6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 isoform X1 | 7.16e-125 | 96.13 | Show/hide |
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|
| A0A6J1JSG6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like | 9.33e-125 | 98.86 | Show/hide |
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P38421 DNA-directed RNA polymerase II subunit 7 | 2.7e-92 | 92.61 | Show/hide |
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|
|
| P46279 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 8.9e-96 | 97.13 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPR+FGRNLR+NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVA+TGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAE
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+
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|
|
| P62487 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.9e-53 | 54.65 | Show/hide |
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +IF IG++ DD+LG+++
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|
|
| Q5E9B8 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.9e-53 | 54.65 | Show/hide |
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +IF IG++ DD+LG+++
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|
|
| Q7ZW41 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.9e-53 | 55.23 | Show/hide |
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D V IQ+D E+RLKI+GTRVD +IF IG++ DD+LG+++
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06790.1 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 5.7e-05 | 29.89 | Show/hide |
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MF+ LE ++++ P L + + S L G V+I I+++ G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
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|
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| AT1G06790.2 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 5.7e-05 | 29.89 | Show/hide |
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MF+ LE ++++ P L + + S L G V+I I+++ G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
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| AT3G22900.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 3.0e-14 | 34.38 | Show/hide |
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G+++ T +ENIG+G I++ TG + FPV + + F+ FKGEI+ VV V+K G F ++GP +I +H+ EF G+ P + S +IQ + V
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Query: RLKIIGT--RVDATEIFCIGTIKDDFLG
R ++ T R + + +I D LG
Subjt: RLKIIGT--RVDATEIFCIGTIKDDFLG
|
|
| AT4G14660.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 2.3e-14 | 32.58 | Show/hide |
Query: GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
G+ VA+T ++ IG+G IR+ TG V FPV + + F+ FKGEI+ VV V K G F GP++ ++ D ++ G+ P + S +IQ ++ V
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Query: RLKIIGTR--VDATEIFCIGTIKDDFLGVIND
R+ +IG + E + +++ D+LG +++
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|
|
| AT5G59180.1 DNA-directed RNA polymerase II | 1.9e-93 | 92.61 | Show/hide |
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AGPVQIFVS HLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT IFC+GTIKDDFLGVINDP+AA
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