; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G16533 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G16533
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionlate embryogenesis abundant protein At5g17165-like
Genome locationctg24:174652..181641
RNA-Seq ExpressionCucsat.G16533
SyntenyCucsat.G16533
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039291 - Late embryogenesis abundant protein At5g17165-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004146886.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165 [Cucumis sativus]8.14e-91100Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

XP_008453829.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494437 [Cucumis melo]2.08e-7792.54Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTC-DPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAA
        MAANSRS GAIAGLGKRITDQIWT  D LRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAA D YWAPHPQTGVFGP SDNPAAVAAA
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTC-DPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAA

Query:  ANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
         NRAAD GNYSA EEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  ANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

XP_022984594.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Cucurbita maxima]2.44e-7184.21Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRS GAIAGL KRITDQIWT DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN +EQVRPSIVPDDVIQPQ+A D YWAPHPQTGVFGPA+ NP  +AA A
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        N  ADGGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG 
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

XP_023552006.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.66e-7285.07Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNP-AAVAAA
        MAANSRS GAIAGL KRITDQIW  DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN +EQVRPSIVPDDVIQPQ+A D YWAPHPQTGVFGPA+ NP AAVAA 
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNP-AAVAAA

Query:  ANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        AN  ADGGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG 
Subjt:  ANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

XP_038901450.1 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like [Benincasa hispida]2.37e-7890.98Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRS G IAGLGKRITDQIWT DPLRNSVISSSAPK RRAAHTS YDKNP+EQVRPS+VPDDVIQ QAA D YWAPHPQTGVFGPASDNPAA  AAA
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BYE5 uncharacterized protein LOC1034944371.01e-7792.54Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTC-DPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAA
        MAANSRS GAIAGLGKRITDQIWT  D LRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAA D YWAPHPQTGVFGP SDNPAAVAAA
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTC-DPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAA

Query:  ANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
         NRAAD GNYSA EEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
Subjt:  ANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

A0A6J1CHE9 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like5.95e-6982.58Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRS GAIAGLGKRIT+QIWT DPLRNS ISSSAPKFRRAAHTSVYDKNP+EQ RPSIVPD+VIQPQ   D YWAPHPQTGVFGP +D+P A AA  
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
         +AA+GG+Y AVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG

A0A6J1E3E9 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like6.56e-6981.95Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRS GAIAGL KRITDQIW  DPLRNS ISS+APKFRRAAH+S YDKN +EQVRPSIVPDDVIQPQ+A D YWAP+PQTGVFGPA+ NP  VAA A
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        N  A+GGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG 
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

A0A6J1FNH5 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like isoform X12.62e-6579.7Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRS GAIAGLGKRIT+QIWT D    S ISSSA KFRRAAHTS YDKNP+EQVRPSIVPDDVIQPQAA + YWAPHP TGVFGP +D P   AAA 
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        +RAADGGN++A EEEKAWFRPTSLEDSEKPHG 
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

A0A6J1JAZ8 late embryogenesis abundant protein At5g17165-like1.18e-7184.21Show/hide
Query:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA
        MAANSRS GAIAGL KRITDQIWT DPLRNS ISS+APKFRRAAHTS YDKN +EQVRPSIVPDDVIQPQ+A D YWAPHPQTGVFGPA+ NP  +AA A
Subjt:  MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAA

Query:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL
        N  ADGGNYS VEEEKAWFRPTSLEDSEKPHG 
Subjt:  NRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4KFM8 Late embryogenesis abundant protein At5g171654.8e-1955.56Show/hide
Query:  RAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        R  HTS YDKN EE+++PS VPD++I+P   +D YW+PHPQTGVFGP+S      +  A     GG   +V EEKAWFRPTSLED +K H
Subjt:  RAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G03150.1 unknown protein5.8e-2052.75Show/hide
Query:  RRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        RR+ H+S YDKN E+++  S VPD+VI+P   +D YW+PHP+TGVFGP++   +A A  A++       +AV EE AWFRPTSLEDS+K H
Subjt:  RRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH

AT5G17165.1 unknown protein3.4e-2055.56Show/hide
Query:  RAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH
        R  HTS YDKN EE+++PS VPD++I+P   +D YW+PHPQTGVFGP+S      +  A     GG   +V EEKAWFRPTSLED +K H
Subjt:  RAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYSAVEEEKAWFRPTSLEDSEKPH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCTAATTCGAGGAGCGTAGGAGCGATCGCCGGCTTGGGGAAACGAATCACTGACCAGATCTGGACCTGTGATCCACTTCGTAACTCTGTGATCTCTTCCTCTGC
TCCGAAGTTCAGGAGAGCAGCTCACACCTCAGTGTATGACAAGAACCCAGAGGAGCAAGTTCGACCATCCATAGTCCCAGATGATGTGATTCAACCTCAAGCAGCAGCTG
ACAACTACTGGGCTCCTCATCCACAAACCGGAGTTTTTGGACCGGCCTCAGACAATCCTGCTGCAGTGGCGGCGGCAGCCAACCGTGCAGCCGATGGTGGCAACTACTCT
GCTGTGGAGGAGGAAAAAGCTTGGTTCCGACCAACAAGTCTGGAGGATTCGGAGAAGCCCCACGGGTTATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGCTAATTCGAGGAGCGTAGGAGCGATCGCCGGCTTGGGGAAACGAATCACTGACCAGATCTGGACCTGTGATCCACTTCGTAACTCTGTGATCTCTTCCTCTGC
TCCGAAGTTCAGGAGAGCAGCTCACACCTCAGTGTATGACAAGAACCCAGAGGAGCAAGTTCGACCATCCATAGTCCCAGATGATGTGATTCAACCTCAAGCAGCAGCTG
ACAACTACTGGGCTCCTCATCCACAAACCGGAGTTTTTGGACCGGCCTCAGACAATCCTGCTGCAGTGGCGGCGGCAGCCAACCGTGCAGCCGATGGTGGCAACTACTCT
GCTGTGGAGGAGGAAAAAGCTTGGTTCCGACCAACAAGTCTGGAGGATTCGGAGAAGCCCCACGGGTTATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAANSRSVGAIAGLGKRITDQIWTCDPLRNSVISSSAPKFRRAAHTSVYDKNPEEQVRPSIVPDDVIQPQAAADNYWAPHPQTGVFGPASDNPAAVAAAANRAADGGNYS
AVEEEKAWFRPTSLEDSEKPHGL