CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G16569
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	Unknown protein
Genome location	ctg24:835866..840803
RNA-Seq Expression	Cucsat.G16569
Synteny	Cucsat.G16569
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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Query:  VVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLADTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
        VVAR+KGMGKKNNLLGLLDSPVLADTMAL D+SSE+SKNGVW GERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
Subjt:  VVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLADTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC

Query:  RISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
        R SGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLI INGEDGPNF+AGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
Subjt:  RISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL

Query:  LKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLTLGLKKVLKVEQRESLMNMFIGICGKDSHSTAAEALGLEIEMY
        LKICHIIQIFPPE+SSPEMEMLTLGLKK LKVEQRESLMNMFIG+CGKDSHSTAAEALGL  +MY
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G43235.1 unknown protein

2.0e-81

43.84

Show/hide

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        FS+P  R         +PR R  RK++ +    T  +    S+SS     D +L   +++ +++  A+  F           + FL S  DAF DL+TLI
Subjt:  FSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSS----SDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFLSSGLDAFDDLRTLI

Query:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKFLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLA
        + DD NR + VSC++ST++FVG +V+L FV  F ++ LV + S L   F S     V+RRDRSLGG+EVVV        R+     K+          +A
Subjt:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKFLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLA

Query:  DTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASV
           A    S+  + + +     LPKWWP ++  ++    ++++YQ EANR+VRA+VDNR SG+D  +DDI+QLR +CRISGV+V+F  +N  DSFYR S+
Subjt:  DTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASV

Query:  DFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLT
        DFVLN  SR P     + I  ED   FIAGLAE+IG+  + AAR+VSAAVAAR RS+FLQAWAL +Q +HSE+ AEL KIC I +IFPP + S EMEM+ 
Subjt:  DFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLT

Query:  LGLKKVLKVEQRESLMNMFIGI-CGKDSHSTAAEALGL
         GL+K++K+E+R+SL+  F+G+ C +DS  +AAEALGL
Subjt:  LGLKKVLKVEQRESLMNMFIGI-CGKDSHSTAAEALGL

Sequences

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CDS sequence

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ATGGACACCACAGCAACCACACTCTGCCTCTTCCTTCCATATCCATTCACTTCCCGTCGCCATAACCTCCATTTCAACCGCCGCTTCTCCTCGCCGGACTCCCGACCACT
CTTCACCCCTGTCTCCTGCTTCAAACCACGTCGTCGTACTCGCCGGAAAAACAGCCTCACCAAACTCCGCACCACCACCCACCATCCCTTCGACTCCTCATCCTCTTCCT
CTGATTCGAACCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCCCGCTCCCACCTCCGCCAGTTTCTG
TCATCGGGATTGGACGCTTTCGACGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGACCAAAATCGAACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGCCA
ATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGTTTTTAGTTGGGATTGTATCTCGTTTGGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTATACGGCCCCTGTAATGAGAA
GGGACCGGAGCCTTGGTGGACGAGAGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGTTGTAGCGCGAAATAAAGGTATGGGGAAGAAAAATAATCTTTTAGGGTTATTGGACAGT
CCCGTGTTAGCGGACACAATGGCTCTGAATGATGTTTCAAGTGAAATTTCGAAGAACGGGGTTTGGGGTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTTCCCCG
ACGGAATGCTACGGCGAATAGGCAAGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGCCCTTGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGACGATATTG
TTCAATTGCGTGAAATATGCAGGATATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTAT
AGCAGGACTCCCATTTACCCACACTTAATTTTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTTATTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATTGAGAATGTCCGTGCTGCCAG
GATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCTGAGTTGTTGAAGATCT
GTCACATTATACAGATATTCCCTCCTGAGAAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAAGTCTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAAT
ATGTTTATTGGTATTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGAAATAGAGATGTATATTCATCTAAGTCATCAAGTATATCTAAAATCCTT
TAGAGACGTGCTACTCGTGCACTTTTATGCTGTCTTTGAAAGGAAATGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MDTTATTLCLFLPYPFTSRRHNLHFNRRFSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSSSDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFL
SSGLDAFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKFLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARNKGMGKKNNLLGLLDS
PVLADTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIY
SRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLTLGLKKVLKVEQRESLMN
MFIGICGKDSHSTAAEALGLEIEMYIHLSHQVYLKSFRDVLLVHFYAVFERK

Cucsat.G16569 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome