; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G17165 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G17165
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionDNA-binding protein BIN4 isoform X2
Genome locationctg2699:134363..135606
RNA-Seq ExpressionCucsat.G17165
SyntenyCucsat.G17165
Gene Ontology termsGO:0042023 - DNA endoreduplication (biological process)
GO:0048731 - system development (biological process)
GO:0051276 - chromosome organization (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0009330 - DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR033246 - DNA-binding protein BIN4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK02024.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]7.01e-7090.28Show/hide
Query:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLN
        SSS    +CL   + GTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLN
Subjt:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLN

Query:  TKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        TKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  TKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

XP_004147326.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Cucumis sativus]3.55e-7393.01Show/hide
Query:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNT
        SSS    +CL   + GTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNT
Subjt:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNT

Query:  KSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        KSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  KSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

XP_008460818.1 PREDICTED: DNA-binding protein BIN4 isoform X4 [Cucumis melo]1.27e-7096.92Show/hide
Query:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
        SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
Subjt:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK

Query:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        RVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

XP_016902630.1 PREDICTED: DNA-binding protein BIN4 isoform X3 [Cucumis melo]3.17e-7096.92Show/hide
Query:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
        SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
Subjt:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK

Query:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        RVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

XP_031736567.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X3 [Cucumis sativus]1.27e-7393.01Show/hide
Query:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNT
        SSS    +CL   + GTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNT
Subjt:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNT

Query:  KSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        KSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  KSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CDA8 DNA-binding protein BIN4 isoform X25.14e-7090.28Show/hide
Query:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLN
        SSS    +CL   + GTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLN
Subjt:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLN

Query:  TKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        TKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  TKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

A0A1S3CDB0 DNA-binding protein BIN4 isoform X17.72e-7096.92Show/hide
Query:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
        SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
Subjt:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK

Query:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        RVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

A0A1S3CEH7 DNA-binding protein BIN4 isoform X46.17e-7196.92Show/hide
Query:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
        SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
Subjt:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK

Query:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        RVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

A0A1S4E3S5 DNA-binding protein BIN4 isoform X31.53e-7096.92Show/hide
Query:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
        SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK
Subjt:  SGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRK

Query:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        RVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  RVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

A0A5D3BS94 DNA-binding protein BIN4 isoform X23.39e-7090.28Show/hide
Query:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLN
        SSS    +CL   + GTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLN
Subjt:  SSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLN

Query:  TKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
        TKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
Subjt:  TKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FLU1 DNA-binding protein BIN41.7e-2150Show/hide
Query:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-
        ++  + GT+Y++ I+PSRTFC+V+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA 
Subjt:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-

Query:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
           E   G+KR +     Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G24630.1 double-stranded DNA binding1.2e-2250Show/hide
Query:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-
        ++  + GT+Y++ I+PSRTFC+V+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA 
Subjt:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-

Query:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
           E   G+KR +     Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

AT5G24630.2 double-stranded DNA binding1.2e-2250Show/hide
Query:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-
        ++  + GT+Y++ I+PSRTFC+V+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA 
Subjt:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-

Query:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
           E   G+KR +     Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

AT5G24630.3 double-stranded DNA binding1.2e-2250Show/hide
Query:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-
        ++  + GT+Y++ I+PSRTFC+V+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA 
Subjt:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-

Query:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
           E   G+KR +     Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

AT5G24630.4 double-stranded DNA binding1.2e-2250Show/hide
Query:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-
        ++  + GT+Y++ I+PSRTFC+V+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA 
Subjt:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-

Query:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
           E   G+KR +     Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK

AT5G24630.5 double-stranded DNA binding1.2e-2250Show/hide
Query:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-
        ++  + GT+Y++ I+PSRTFC+V+ GQ+EAKIE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA 
Subjt:  LWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA-

Query:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK
           E   G+KR +     Q P    KK + S  K  K+KK
Subjt:  ---EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTGACTTTCTCTTACCATTCTTTCTGATCATGTTGGACTATTTCAAAGACATTTGTATGTCTAGTAGTTGTGGGGTAATTATTTGTCTATGGTTCTCTGTTTCAGG
CACACTTTACAGAGCGGTAATAGTTCCTTCAAGGACATTTTGCATCGTTAGCTTTGGTCAGTCAGAGGCTAAGATAGAATCTATCATGAACGATTTCATTCAGTTGAAGG
CACTGTCCAAAGTTGATGAGGCTGAAACTATGGTTGAAGGCACATTAGATGGATTCTCGTTTGATTCTGAAGACGACGCTGAGAAAATAACTAAAGCTGCTTCTCCAGCT
GACCAAAATGAGCCGGTAGAAGGGCTCAACACAAAATCCAAAAACAAAGCCGAGAAATCATCAGGGCGGAAGCGTGTTAAAACTGGAGGAAGGCTGCAGGCTCCGAAGAA
AACAAGGAAGAAAGTTCAAGGTTCTAAAACTAAAAATGCAAAAAGCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTGACTTTCTCTTACCATTCTTTCTGATCATGTTGGACTATTTCAAAGACATTTGTATGTCTAGTAGTTGTGGGGTAATTATTTGTCTATGGTTCTCTGTTTCAGG
CACACTTTACAGAGCGGTAATAGTTCCTTCAAGGACATTTTGCATCGTTAGCTTTGGTCAGTCAGAGGCTAAGATAGAATCTATCATGAACGATTTCATTCAGTTGAAGG
CACTGTCCAAAGTTGATGAGGCTGAAACTATGGTTGAAGGCACATTAGATGGATTCTCGTTTGATTCTGAAGACGACGCTGAGAAAATAACTAAAGCTGCTTCTCCAGCT
GACCAAAATGAGCCGGTAGAAGGGCTCAACACAAAATCCAAAAACAAAGCCGAGAAATCATCAGGGCGGAAGCGTGTTAAAACTGGAGGAAGGCTGCAGGCTCCGAAGAA
AACAAGGAAGAAAGTTCAAGGTTCTAAAACTAAAAATGCAAAAAGCAAGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFDFLLPFFLIMLDYFKDICMSSSCGVIICLWFSVSGTLYRAVIVPSRTFCIVSFGQSEAKIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPA
DQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK