; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G17213 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G17213
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionprotodermal factor 1-like isoform X2
Genome locationctg27:559344..560201
RNA-Seq ExpressionCucsat.G17213
SyntenyCucsat.G17213
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647347.1 hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus]2.34e-21793.9Show/hide
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XP_011657562.2 protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus]4.94e-21492.8Show/hide
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XP_022930675.1 protodermal factor 1-like isoform X2 [Cucurbita moschata]5.18e-17482.29Show/hide
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XP_031743089.1 protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus]3.17e-21998.77Show/hide
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XP_038888912.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]2.54e-17783.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGQ1 Uncharacterized protein1.46e-21597.55Show/hide
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A0A6J1ES52 protodermal factor 1-like isoform X15.44e-17180Show/hide
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        DPTPTPSTP    PSGGG   YYSPPS DPTPTPSTP          TPSTPSTP     SGGGYYSPP++DPTPTPSTP TPSTP  S PSGGG YYSP
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        PT DPTPTPSTP+  TPSTPSGGGYYSPPT +PT P++PSTP  STPS GG Y+SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP   PSGG GY+SP
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        P++DP PSTPPSGG          TPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNTRTDG
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A0A6J1EXH4 protodermal factor 1-like isoform X22.51e-17482.29Show/hide
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        TP+  TPSTPSGGGYYSPPT +PT P++PSTP  STPS GG Y+SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP   PSGG GY+SPP++DP PSTP
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A0A6J1JF43 protodermal factor 1-like isoform X16.03e-17077.25Show/hide
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        TPSTP   PSGG GY+SPP++DP PSTPPSGG          TPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PG
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A0A6J1JPJ4 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X23.93e-17077.25Show/hide
Query:  PTP-TPSTPTPSTPSGGG-YYSPPSNDPTPTPSTP-----------TPSTPSTPS------GGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPS------GGGYY
        PTP TPSTPTPS PSGGG YYSPP+ DPTPTPSTP           TPSTPSTP+      GGGYYSPP++DPTPTPSTPTPSTPSTP+      GGGYY
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Query:  SPPTNDPTPTPSTP-----------TPSTPSTP-----SGGGYYSPPTYDPT-PTSPSTP--STPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP
        SPPT DPTPTPSTP           TPSTPSTP     SGGGYYSPPT DPT P++PSTP  STPS GG Y+SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP
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Query:  TPSTP---PSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG----------TPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPG
        TPSTP   PSGG GY+SPP++DP PSTPPSGG          TPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PG
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Query:  FGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        FGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTT++VR+SFVSALSSNKAAAAQA+VFQMANEGRFKPR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P14918 Extensin1.1e-0536.57Show/hide
Query:  PTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPS-TPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSG
        PTP   TP+P  P+      PP+  PTP   TP+P  P+       Y+P    P   P TP P+ P+ TPS      PPT  PTP   TP+P  P+T   
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Query:  GGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP------P
            +PPTY P+P  P+   T         PPTY P+P P TP       +PPTY P+P  PP+      +PPT+ P+P  P    TP   TP      P
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Query:  TTSAPPFVPDPNSPFT
          + P + P P  P T
Subjt:  TTSAPPFVPDPNSPFT

Q9S728 Protodermal factor 11.5e-5048.46Show/hide
Query:  TPSGGGYYSPPSNDPTPT-----PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTP-TPS-TPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS
        +P  G + +PPS+ P  +     P  P+PSTPS P      SPPSH PTP TPS TPTP TPS                    TPTP TP    G    S
Subjt:  TPSGGGYYSPPSNDPTPT-----PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTP-TPS-TPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS

Query:  PPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFV
        PP++  TP+ PSTPS                 PTPS P  GG Y SPP   P   TPPS        P  D  P TP  GG+P   TP   P T   PF+
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Query:  PDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSAL
        P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ PGF   ++L QALSNTR+D +G+LYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ L
Subjt:  PDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSAL

Query:  SSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        SSNKAA  QA  F++ANEGR KPR
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Q9SN46 Leucine-rich repeat extensin-like protein 55.8e-1044.54Show/hide
Query:  PTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGG-------YYSPPSHDPTP-----TPSTPT-----PSTPSTPSGGGYYSPPTNDPT
        P   PS PT  TPS GG  SPPS   +P+P    PS P+TPS GG         SPPS  P+P     +P+TPT     PS+P+TP+ GG  SPP++  T
Subjt:  PTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGG-------YYSPPSHDPTP-----TPSTPT-----PSTPSTPSGGGYYSPPTNDPT

Query:  PTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP--TSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSG-GGGYNSPPTFDPTPST
        PTP    PS+P+TPS GG    P+  P+P  T PS PSTP+  G   SP    P+P+  TPS      SP    PTPSTPP+    G NSPP     P T
Subjt:  PTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP--TSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSG-GGGYNSPPTFDPTPST

Query:  PPS-GGTPFYGTPPTTSAPPFV-PDPNSP
         PS   +P    PP   +PP V P P+SP
Subjt:  PPS-GGTPFYGTPPTTSAPPFV-PDPNSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 11.1e-5148.46Show/hide
Query:  TPSGGGYYSPPSNDPTPT-----PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTP-TPS-TPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS
        +P  G + +PPS+ P  +     P  P+PSTPS P      SPPSH PTP TPS TPTP TPS                    TPTP TP    G    S
Subjt:  TPSGGGYYSPPSNDPTPT-----PSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTP-TPS-TPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS

Query:  PPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFV
        PP++  TP+ PSTPS                 PTPS P  GG Y SPP   P   TPPS        P  D  P TP  GG+P   TP   P T   PF+
Subjt:  PPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTP---PTTSAPPFV

Query:  PDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSAL
        P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ PGF   ++L QALSNTR+D +G+LYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ L
Subjt:  PDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSAL

Query:  SSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR
        SSNKAA  QA  F++ANEGR KPR
Subjt:  SSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPR

AT3G19430.1 late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related2.4e-1145.1Show/hide
Query:  TPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGG
        +P P TPTPS PS     SPP   PTPTPS P+P+ P +P       PP   PTPTPS P+P+ P +P       PP   PTPTPS P+P TP  P+   
Subjt:  TPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGG

Query:  YYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFV
           PP   P P +P TPS P       SPP  D TPTP TPS      SPP   PTP TP        SPP   PTP TPPS  TP       + +PP+V
Subjt:  YYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFV

Query:  PDPN
        P P+
Subjt:  PDPN

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein4.1e-1144.54Show/hide
Query:  PTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGG-------YYSPPSHDPTP-----TPSTPT-----PSTPSTPSGGGYYSPPTNDPT
        P   PS PT  TPS GG  SPPS   +P+P    PS P+TPS GG         SPPS  P+P     +P+TPT     PS+P+TP+ GG  SPP++  T
Subjt:  PTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGG-------YYSPPSHDPTP-----TPSTPT-----PSTPSTPSGGGYYSPPTNDPT

Query:  PTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP--TSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSG-GGGYNSPPTFDPTPST
        PTP    PS+P+TPS GG    P+  P+P  T PS PSTP+  G   SP    P+P+  TPS      SP    PTPSTPP+    G NSPP     P T
Subjt:  PTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTP--TSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSG-GGGYNSPPTFDPTPST

Query:  PPS-GGTPFYGTPPTTSAPPFV-PDPNSP
         PS   +P    PP   +PP V P P+SP
Subjt:  PPS-GGTPFYGTPPTTSAPPFV-PDPNSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATCAACTCCTTCAGGAGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTAACGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATC
AACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTCATGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTG
GATACTACAGCCCTCCAACTAATGATCCCACTCCAACTCCATCAACTCCGACACCATCAACTCCCTCTACCCCATCGGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACATATGAT
CCCACTCCAACGTCACCATCGACTCCATCGACTCCTTCCGGTGGTGGTGGATACTCTAGCCCTCCAACTTATGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGAGG
TGGATATTATAGCCCACCAACTTATGATCCTACTCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCAACACCATCAACTCCTCCTT
CAGGTGGTACACCATTCTATGGGACCCCACCAACCACATCAGCCCCACCTTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCATCCA
GGAATAATATGGGGTTTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAA
CACACGAACTGATGGCCTAGGATCACTTTACCGAGAAGGAGCTGCGGCTTTCCTGAACTCCATGGTCAACAACAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGAAAGTT
TTGTATCGGCATTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCTAACGAGGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATCAACTCCTTCAGGAGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTAACGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATC
AACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCATCTCATGATCCCACTCCAACTCCATCTACTCCAACGCCATCAACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTG
GATACTACAGCCCTCCAACTAATGATCCCACTCCAACTCCATCAACTCCGACACCATCAACTCCCTCTACCCCATCGGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACATATGAT
CCCACTCCAACGTCACCATCGACTCCATCGACTCCTTCCGGTGGTGGTGGATACTCTAGCCCTCCAACTTATGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGAGG
TGGATATTATAGCCCACCAACTTATGATCCTACTCCATCAACTCCTCCATCAGGCGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCAACACCATCAACTCCTCCTT
CAGGTGGTACACCATTCTATGGGACCCCACCAACCACATCAGCCCCACCTTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCATCCA
GGAATAATATGGGGTTTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAA
CACACGAACTGATGGCCTAGGATCACTTTACCGAGAAGGAGCTGCGGCTTTCCTGAACTCCATGGTCAACAACAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGAAAGTT
TTGTATCGGCATTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCTAACGAGGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
DPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYD
PTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHP
GIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT