; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G17239 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G17239
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationctg27:958450..961278
RNA-Seq ExpressionCucsat.G17239
SyntenyCucsat.G17239
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647333.1 hypothetical protein Csa_003353 [Cucumis sativus]4.50e-6271.88Show/hide
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        GRGGK +GEI G GG   G+  G GG       G GG+ +G   GRG    G   GRGVG G   G GG   G   +GGGGGRGDGGGGGGG
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TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]2.14e-7369.31Show/hide
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        RG  A G+I GRGG+  G+IL RGGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGG+A GEI+GRGGEA+GE +GRGG+A+GEI GRGG+AMGEILGRGGE +GE +GR
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        GGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +GRGGKAI             GEIFGRGG+AIGEI GRGV +GAMLGRGG + G +IGG
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XP_011658456.2 chromatin target of PRMT1 protein [Cucumis sativus]2.90e-8097.76Show/hide
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        GRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGE  G
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XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]2.38e-6977.91Show/hide
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        G+IL RGGEA GE IGRGGEA+GEI GRGGKA GEILGRGGEA+GE +GRGGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +GRGGKAIGEI GRGG A+G
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        EI GRG       +GRGGKAIGEIFGRGG+AIGEI GRGV +GAMLGRGGKVVG I GGGGG G G GGGGG
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XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]2.05e-10291.1Show/hide
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        M RG  A G+IFGRGG+  G+IL RGGE LGET+GRGG+A+GEIFGRGG+A GEILGRGGE LGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETM
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        GRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGGNAIGEIVGRGVGVGAMLGRGGKVVGEIIGGGGGRGDGGGGGGG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein1.39e-8380Show/hide
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        M RG  A G+IFGRGG+  G++L RGGE LGET+GRGG+A+GEIFGRGG+A GEILGRGGE LGETMGRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETM
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        GRGGKAIGEIFGRGGRAMGEILGRGGETLGETMGRGGKAIGEIFGRGG A+GEI+GRG   +G  +GRGGK +GEI G        GGGGRG GGGGGGG
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A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like1.15e-6977.91Show/hide
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        EI GRG       +GRGGKAIGEIFGRGG+AIGEI GRGV +GAMLGRGGKVVG I GGGGG G G GGGGG
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A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like6.89e-3759.24Show/hide
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        +  RGG+  GE  GRG + +GE   RGGK  GE   RGG+ +GE  GRG K IGE  GRG  A+GEILGR GE +GE  GRGG+A+GEI GR G AMGEI
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        LGRGGE LGE +GRGG+AIGEI GRGG A+GEI+GRG  +G ++  G ++ G +IGG
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A0A5D3BMR9 Glycine-rich cell wall structural protein 1-like3.71e-3878.02Show/hide
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        +GEI GRGGKA GEILGRGGEA+GE +GRGGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +GRGGKAIGEI GRGG A+GEI GRGG+  GE
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A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.03e-7369.31Show/hide
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        RG  A G+I GRGG+  G+IL RGGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGG+A GEI+GRGGEA+GE +GRGG+A+GEI GRGG+AMGEILGRGGE +GE +GR
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        GGK IGEIFGRGG AMGEI GRGGE +GE +GRGGKAI             GEIFGRGG+AIGEI GRGV +GAMLGRGG + G +IGG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P10495 Glycine-rich cell wall structural protein 1.04.8e-0441.15Show/hide
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        G +G   G GG   G  +E GG   GE  G GGE  G  +G  G   G   G GG   G   G G     GK  GE +G GG   G   G GG   G   
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        G GG   G   G G  A G   G GG   G   G GG   G   G  GG A G   G G G GA  G GG        GGGGRG GGGGGGG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23450.1 unknown protein3.0e-0942.78Show/hide
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        +G G  G I G+GG V G I + GG  +G  IG+GG  +G   G+GG   G I G+GG  +G  +G+GG  +G  FG+GG  +G  +G+GG  +G   G+
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        GG  +G   G+GG  +G  +G+GG  +G  +G+GG  IG   G+GG  IG  +G+G G+G  +G+GG + G I     IGGG G+G G GGGGG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGACGAGGTGATGGGGCTCATGGTAAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGTTACAGGCAAAATATTGGAACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATTGGGCGAGG
TGGTGAAGCTCTTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTACAGGCGAAATATTAGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTA
TTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATACTGGGACGAGGGGGTGAAACTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATA
TTTGGACGGGGTGGTAGAGCTATGGGCGAAATACTGGGACGAGGGGGTGAAACTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTATTGGTGAGATATTTGGACGGGG
TGGTAATGCTATTGGTGAAATAGTTGGACGAGGTGTTGGTGTTGGTGCAATGCTAGGACGTGGAGGTAAAGTTGTCGGTGAAATAATTGGTGGAGGAGGAGGACGTGGTG
ACGGGGGAGGAGGAGGAGGAGGGGCGTGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGACGAGGTGATGGGGCTCATGGTAAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGTTACAGGCAAAATATTGGAACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATTGGGCGAGG
TGGTGAAGCTCTTGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTACAGGCGAAATATTAGGACGAGGGGGTGAAGCTCTTGGTGAAACAATGGGACGAGGTGGTAAAGCTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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