; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G1760 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G1760
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptiontranscription factor SPATULA
Genome locationctg1002:1745780..1749597
RNA-Seq ExpressionCucsat.G1760
SyntenyCucsat.G1760
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A0A1S3B0R8 transcription factor SPATULA1.15e-27894.22Show/hide
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A0A5D3CR49 Transcription factor SPATULA5.91e-27294.09Show/hide
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A0A6J1GF25 transcription factor SPATULA-like isoform X13.60e-20781.23Show/hide
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A0A6J1ILN5 transcription factor SPATULA-like isoform X14.08e-20981.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JNI9 Transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR-LIKE 156.3e-2573.56Show/hide
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Q6AT90 Transcription factor APG1.4e-2138.08Show/hide
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        T  A A ++++S+ P  +   + Q       S P FS      L  P PS         RA  PP    PPP  P      + +A  ++      PS   
Subjt:  TLPAPALSSSSSSPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFS------LLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGV

Query:  LHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGAS--------------DHNENDEFDCESEEGLEALVEELP--TKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKAL
                P + PP A++T+  +S              D + N   +  + +    L +EL    + +   SSKRSR AEVHNLSE+RRR RINEKM+AL
Subjt:  LHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGAS--------------DHNENDEFDCESEEGLEALVEELP--TKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKAL

Query:  QNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPGSLQYLQLSHMRM
        Q LIPN NK DKASML+EAIEYLK LQLQVQM+SM  G+ + PM LP +   +Q  HM+M
Subjt:  QNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPGSLQYLQLSHMRM

Q8GZM7 Transcription factor PIF13.4e-2348.99Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

Q9FHA2 Transcription factor ALC5.9e-2344.86Show/hide
Query:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE
        P PS   EL+  +R     T    P      + P + + V S+E F  S S G +               SS   G S+  + D++  E +         
Subjt:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE

Query:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLP
          +    R+S KR+  A+ HNLSEK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ L++ NGL L+PM LP
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Q9FUA4 Transcription factor SPATULA1.5e-4245.25Show/hide
Query:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------
        S  D+IS FL+ I  RS          SP PS +S  T    A     H    P+            P ++V       D SE      S          
Subjt:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------

Query:  --HDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK
           +       S     SS+SVGAS  NE DE+DCESEEG EA+V+E P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDK
Subjt:  --HDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK

Query:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL
        ASMLDEAIEYLKQLQLQVQML+MRNG++LHP+ LPG +L  LQLS +R              E  N   L+  +Q A++ + P M      N   + + L
Subjt:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL

Query:  VPPIQAHLVPFYLSES
         P I++H  PF L  S
Subjt:  VPPIQAHLVPFYLSES

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20180.1 phytochrome interacting factor 3-like 52.4e-2448.99Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

AT2G20180.2 phytochrome interacting factor 3-like 52.4e-2448.99Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

AT2G20180.3 phytochrome interacting factor 3-like 52.4e-2448.99Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+QM+SM  G  
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLS

Query:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        + PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  LHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

AT4G36930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-4345.25Show/hide
Query:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------
        S  D+IS FL+ I  RS          SP PS +S  T    A     H    P+            P ++V       D SE      S          
Subjt:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------

Query:  --HDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK
           +       S     SS+SVGAS  NE DE+DCESEEG EA+V+E P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDK
Subjt:  --HDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK

Query:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL
        ASMLDEAIEYLKQLQLQVQML+MRNG++LHP+ LPG +L  LQLS +R              E  N   L+  +Q A++ + P M      N   + + L
Subjt:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL

Query:  VPPIQAHLVPFYLSES
         P I++H  PF L  S
Subjt:  VPPIQAHLVPFYLSES

AT5G67110.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.2e-2444.86Show/hide
Query:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE
        P PS   EL+  +R     T    P      + P + + V S+E F  S S G +               SS   G S+  + D++  E +         
Subjt:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE

Query:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLP
          +    R+S KR+  A+ HNLSEK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ L++ NGL L+PM LP
Subjt:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCATTCTGTTCCCAACAACTGCGATCGAAATGCATGTTCTTCTTCGACGTGGACTCTCCCCGCCCCAGCCCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCACCTCCCGACGATAT
CTCTCTGTTTCTTCAACAGATTTTGCGGCGTTCCTCTTCCTCTGCTCCTCACTTCTCTCTTCTCTCTCCCTCTCCCTCCATCTTTTCCGAGCTCACCTGCAACATTAGAG
CCTTCACCCCCCCAACCCATAACCTTCCCCCTCCATACGGACCGCCCAATGCAGTGCCGGACGAGATCTCCGCCGTCGATTCCTCAGAACAATTTGCTAATTCCCCATCA
TCCGGTGTACTACATGATCCCTTGCGCACTTTTCCCACATCCATTCCACCCAACGCGTCTTCTACGTCGGTCGGAGCTAGTGATCATAACGAAAACGATGAATTTGACTG
CGAAAGTGAGGAGGGTCTGGAGGCATTGGTTGAAGAGCTGCCTACAAAGCCCAATCCTCGCAGCTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCTGAAGTTCATAATTTGTCTGAAA
AGAGAAGGAGGAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCGCTGCAAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACTGACAAGGCCTCGATGCTAGACGAAGCAATTGAATATCTG
AAGCAGCTTCAACTTCAAGTTCAGATGCTGTCGATGAGAAATGGCTTGAGTTTGCATCCTATGAACTTGCCTGGAAGTTTGCAATATCTCCAACTTTCTCACATGAGAAT
GGACTTTGGTGAAGAAAACAGGTCAATTTCTTCTGACCAAGAAAGACCTAACCAGATCTTTCTCAGTTTGCCTGACCAAAAGGCTGCCTCCATCCATCCTTTCATGTCAG
ACATTGGAAGAACTAATGCAGCTGAAACTCCATTTGAATTGGTCCCGCCCATCCAGGCTCACCTAGTCCCTTTTTACTTGAGTGAGTCCTCCAAATCTAAGGAGATTTGC
AGCAGAGATTTACTGCGAGATGATCACCAGGCGGTGAATGTGAATGTGAGCCAATCGGAGACAACTCCCTTAGTATCATGCCCCTATAACATACCAGAGACTCCTGATTT
ACAAGGATTACAGAATGGCCTCTCAGTGGAACCGTGCATCATTGAAGGAAATCGGTCTGGCGTGCTTCTGAATTACACCCCAGAGCACAGCCTCGTATTCCCTTCCCCTT
TTAATGGCATCAAACAAGAAGACCGACTGAAACAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCATTCTGTTCCCAACAACTGCGATCGAAATGCATGTTCTTCTTCGACGTGGACTCTCCCCGCCCCAGCCCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCACCTCCCGACGATAT
CTCTCTGTTTCTTCAACAGATTTTGCGGCGTTCCTCTTCCTCTGCTCCTCACTTCTCTCTTCTCTCTCCCTCTCCCTCCATCTTTTCCGAGCTCACCTGCAACATTAGAG
CCTTCACCCCCCCAACCCATAACCTTCCCCCTCCATACGGACCGCCCAATGCAGTGCCGGACGAGATCTCCGCCGTCGATTCCTCAGAACAATTTGCTAATTCCCCATCA
TCCGGTGTACTACATGATCCCTTGCGCACTTTTCCCACATCCATTCCACCCAACGCGTCTTCTACGTCGGTCGGAGCTAGTGATCATAACGAAAACGATGAATTTGACTG
CGAAAGTGAGGAGGGTCTGGAGGCATTGGTTGAAGAGCTGCCTACAAAGCCCAATCCTCGCAGCTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCTGAAGTTCATAATTTGTCTGAAA
AGAGAAGGAGGAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCGCTGCAAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACTGACAAGGCCTCGATGCTAGACGAAGCAATTGAATATCTG
AAGCAGCTTCAACTTCAAGTTCAGATGCTGTCGATGAGAAATGGCTTGAGTTTGCATCCTATGAACTTGCCTGGAAGTTTGCAATATCTCCAACTTTCTCACATGAGAAT
GGACTTTGGTGAAGAAAACAGGTCAATTTCTTCTGACCAAGAAAGACCTAACCAGATCTTTCTCAGTTTGCCTGACCAAAAGGCTGCCTCCATCCATCCTTTCATGTCAG
ACATTGGAAGAACTAATGCAGCTGAAACTCCATTTGAATTGGTCCCGCCCATCCAGGCTCACCTAGTCCCTTTTTACTTGAGTGAGTCCTCCAAATCTAAGGAGATTTGC
AGCAGAGATTTACTGCGAGATGATCACCAGGCGGTGAATGTGAATGTGAGCCAATCGGAGACAACTCCCTTAGTATCATGCCCCTATAACATACCAGAGACTCCTGATTT
ACAAGGATTACAGAATGGCCTCTCAGTGGAACCGTGCATCATTGAAGGAAATCGGTCTGGCGTGCTTCTGAATTACACCCCAGAGCACAGCCTCGTATTCCCTTCCCCTT
TTAATGGCATCAAACAAGAAGACCGACTGAAACAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDHSVPNNCDRNACSSSTWTLPAPALSSSSSSPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNLPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPS
SGVLHDPLRTFPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYL
KQLQLQVQMLSMRNGLSLHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIHPFMSDIGRTNAAETPFELVPPIQAHLVPFYLSESSKSKEIC
SRDLLRDDHQAVNVNVSQSETTPLVSCPYNIPETPDLQGLQNGLSVEPCIIEGNRSGVLLNYTPEHSLVFPSPFNGIKQEDRLKQ