CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G17760
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	protein SCAI
Genome location	ctg31:436565..443096
RNA-Seq Expression	Cucsat.G17760
Synteny	Cucsat.G17760
Gene Ontology terms	GO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process) GO:0045892 - negative regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0003714 - transcription corepressor activity (molecular function)
InterPro domains	IPR022709 - Protein SCAI

Homology

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Query:  LSSPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTA
            AGTDLGCESINNA++IDKTKSPCSQVEGGYKGLQS CLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSP+A
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Query:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT
         +HAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCR+VLT Y PT
Subjt:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT

Query:  LGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
        LGKKEY+PRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
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A0A1S3C668 protein SCAI isoform X1

0.0

88.82

Show/hide

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        MSQPGNPANS+T NSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERN YDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVE GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMR
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        TSEASYLSESYVFYEAI+TREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF
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Query:  MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP
        MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP T+TTR LRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP
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Query:  SNPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNF
        SNPRKSILYRPSVTHFLAV                                                      LATICEEMASDGVLLIYLSAAGSG NF
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Query:  LSSPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTA
        LSSPAGTDLGCESINNA++IDKTKSPCSQVEGGYKGLQS CLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSP+A
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Query:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT
         +HAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCR+VLT Y PT
Subjt:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT

Query:  LGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
        LGKKEY+PRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
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A0A5A7T841 Protein SCAI isoform X1

0.0

88.82

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        MSQPGNPANS+T NSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERN YDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVE GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMR
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Query:  TSEASYLSESYVFYEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF
        TSEASYLSESYVFYEAI+TREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF
Subjt:  TSEASYLSESYVFYEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF

Query:  MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP
        MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP T+TTR LRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP
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Query:  SNPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNF
        SNPRKSILYRPSVTHFLAV                                                      LATICEEMASDGVLLIYLSAAGSG NF
Subjt:  SNPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNF

Query:  LSSPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTA
        LSSPAGTDLGCESINNA++IDKTKSPCSQVEGGYKGLQS CLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSP+A
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Query:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT
         +HAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCR+VLT Y PT
Subjt:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT

Query:  LGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
        LGKKEY+PRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
Subjt:  LGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN

A0A5D3BA86 Protein SCAI isoform X2

0.0

87.13

Show/hide

Query:  MSQPGNPANSTTINSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMR
        MSQPGNPANS+T NSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERN YDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVE GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMR
Subjt:  MSQPGNPANSTTINSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMR

Query:  TSEASYLSESYVFYEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF
        TSEASYLSESYVFYEAI+TREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF
Subjt:  TSEASYLSESYVFYEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAF

Query:  MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP
        MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP T+TTR LRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP
Subjt:  MNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLP

Query:  SNPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNF
        SNPRKSILYRPSVTHFLAV                                                      LATICEEMASDGVLLIYLSAA      
Subjt:  SNPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNF

Query:  LSSPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTA
            AGTDLGCESINNA++IDKTKSPCSQVEGGYKGLQS CLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSP+A
Subjt:  LSSPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTA

Query:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT
         +HAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCR+VLT Y PT
Subjt:  ITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPT

Query:  LGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILG
        LGKKEY+PRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILG
Subjt:  LGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILG

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q54YY1 Protein SCAI homolog

6.1e-59

28.38

Show/hide

Query:  SQPGNPANSTTINSS--------IPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEA---GLKRWEIGEIASRI
        S P N   +TT ++S          + + +  L+ K+ R F  +RDLP + R ++  +F K F++YT+LWKFQQ+ R  L +    GLKR EIGEIAS+I
Subjt:  SQPGNPANSTTINSS--------IPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEA---GLKRWEIGEIASRI

Query:  AQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAILTREYFKD-GLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQE
         QLY+  Y+RTS+ +YL+ESY+FYEAI  R YFKD  L +   +  KQLR+ +RF++VCL+LN++++V  L+ +L   +++  + ++ +D +EW LV+QE
Subjt:  AQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAILTREYFKD-GLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQE

Query:  IMKFLKAD-------------------------TAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLT-PVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLE
        I  FL+AD                          +  N      + V     + L  P PP        LQ AIL     N++KFSE+TLD FRM QSLE
Subjt:  IMKFLKAD-------------------------TAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLT-PVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLE

Query:  WEPSGSFYRPN----------NRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPS-------------------------NPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIH
        +EP       +           +  Q         N   D  + T+PS                         NP K +LYRP+++  L     S   + 
Subjt:  WEPSGSFYRPN----------NRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPS-------------------------NPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIH

Query:  LKPIVPFVILTCSSTD--------FRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLAT--ICEEMASDGVLL--------IYLSAAGSGKNF--------LS
            +   I     T+         +P  + +   +  L+ ++   +  T    AT  +  ++ + G+ L        I      +  N          +
Subjt:  LKPIVPFVILTCSSTD--------FRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLAT--ICEEMASDGVLL--------IYLSAAGSGKNF--------LS

Query:  SPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAIT
        +   T++  ++       + T +  +     YK  ++    F T+    +  +YP DL+PF R+PF L+++S  S+ F  +      +P   LLSP +I 
Subjt:  SPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAIT

Query:  HAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYA-PTL
          + ++  + G+LFT FL  P+ AFC +    G+ +   TF+    +  +SL    +LL     L   ++  L D F+R  ++RFIFC A  TFY     
Subjt:  HAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYA-PTL

Query:  GKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFV-FSEN-LLLSEN
            Y  +  P LP  +    + L+S + ++ + L VS  F+  +EN L++ EN
Subjt:  GKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFV-FSEN-LLLSEN

Q8C8N2 Protein SCAI

2.0e-73

32.64

Show/hide

Query:  LVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEA-GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAILTREYFK
        L+DK+ + F+ +RDLP Y + ++ +YF + F VYT+LWKFQQ++RQ L    GLKRW+IGEIAS+I QLY+  Y+RTSE SYL+E++ FY AI  R Y+ 
Subjt:  LVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEA-GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAILTREYFK

Query:  DGLFQD-VSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP
            +D   L  K+LR+ +RF++VCL+LN+ ++V  LV +L   +++    F   D  EW LV+QE+  F++AD     +     ++V+  +  + T  P
Subjt:  DGLFQD-VSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP

Query:  ---PTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPSVTHFLAVS
             +    L L DA++    +N+VKFSELT+D FRM+Q+LE EP             N  +  ++    +    PT   NP K +LY+P+ +      
Subjt:  ---PTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPSVTHFLAVS

Query:  MISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGT-DLGCESINNADN
                                                             LA   +E+ ++ VLLIYLSA G      S   G  D G    N+  +
Subjt:  MISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGT-DLGCESINNADN

Query:  IDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAITHAVATDYSRHGSLFTLF
        I                +    +    +    + C++P DL PFTR+P  +V+DS  S A++       G+P   LLSPTA   A+  D S+ GSLFTLF
Subjt:  IDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAITHAVATDYSRHGSLFTLF

Query:  LTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVD
        L  PL AF  + G+  S +    + K +  L     +  QLL  S S+DQ + Q   D F+R LL RF+FC A +  +      + Y P   P LP    
Subjt:  LTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVD

Query:  PTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSEN
             LQ  ++++A+IL V    +F EN
Subjt:  PTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSEN

Q8N9R8 Protein SCAI

3.3e-73

32.86

Show/hide

Query:  LVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEA-GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAILTREYFK
        L+DK+ + F+ +RDLP Y + ++ +YF + F VYT+LWKFQQ++RQ L    GLKRW+IGEIAS+I QLY+  Y+RTSE SYL+E++ FY AI  R Y+ 
Subjt:  LVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEA-GLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAILTREYFK

Query:  DGLFQD-VSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP
            +D   L  K+LR+ +RF++VCL+LN+ ++V  LV +L   +++    F   D  EW LV+QE+  F++AD     +     ++V+  +  + T  P
Subjt:  DGLFQD-VSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLTPVP

Query:  ---PTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPSVTHFLAVS
             +    L L DA++    +N+VKFSELT+D FRM+Q+LE EP     + N    Q     P+R              NP K +LY+P+ +      
Subjt:  ---PTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPSVTHFLAVS

Query:  MISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGT-DLGCESINNADN
                                                             LA   +E+ ++ VLLIYLSA G      S   G  D G    N+  +
Subjt:  MISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGT-DLGCESINNADN

Query:  IDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAITHAVATDYSRHGSLFTLF
        I                +    +    +    + C++P DL PFTR+P  +++DS  S A++       G+P   LLSPTA   A+  D S+ GSLFTLF
Subjt:  IDKTKSPCSQVEGGYKGLQSGCLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAITHAVATDYSRHGSLFTLF

Query:  LTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVD
        L  PL AF  + G+  S +    + K +  L     +  QLL  S S+DQ + Q   D F+R LL RFIFC A +  +      + Y P   P LP    
Subjt:  LTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVD

Query:  PTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLL
             LQ  ++++A+IL V    VF EN +
Subjt:  PTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G03570.1 Protein of unknown function (DUF3550/UPF0682)

8.4e-197

56.84

Show/hide

Query:  NSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVF
        N++IP+SE YWSLV+KAD+KFSKIRDLP+YER+RY+ YF K FKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLY+G YMRTS+A YLSESYVF
Subjt:  NSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVF

Query:  YEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLE
        YEAILTREYFKDGLFQD+++ANKQLRFL+RFLMVCLVL RREMVHQLV+Q K L+DECKRTFQETDF+EWK+V QEI++FLK+DTAFMNIRP RYS+VL+
Subjt:  YEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLE

Query:  PHPDSLTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNN-RSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPS
        P+ D+ TP      +R LRL DAILSSY  NEVK+SELTLD+FRM+Q LEWEPSGS Y+    + GQN   G +R N SQ + DPTLP NPRK++LYRPS
Subjt:  PHPDSLTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNN-RSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPS

Query:  VTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGTDLGCE
        +THFLA                                                      VLATICEE+ S G+LL+YLSA+G      SSP        
Subjt:  VTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGTDLGCE

Query:  SINN------ADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQ--------SGC-LSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLS
           N      +  I +   P  Q+    + L+        + C LSFG+ G  G S IYPSDLVPFTR+P  ++IDSD S  F+ I GAEKGEPAA+LLS
Subjt:  SINN------ADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQ--------SGC-LSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLS

Query:  PTAITHAVATDYSRH--GSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLT
        P+     ++ D+SR   GSLFT+FLT+P+ AFCLL  IS SD+E D F+KAE +LSSS++EW   L TS++L  VW+QIL DPF+RRLLLRFIFCRAVL 
Subjt:  PTAITHAVATDYSRH--GSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLT

Query:  FYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN
         Y P    K+  P C PSLP  + PT   +QS V ++AN+ G +  F   +++ + E+
Subjt:  FYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN

AT4G40050.1 Protein of unknown function (DUF3550/UPF0682)

7.0e-135

42.09

Show/hide

Query:  VSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAIL
        VS  + +LV+ ADRKF+++RDLP + R +   YF K FK Y +LW +QQ +R KLVE+GL RWEIGEIASRI QLYF QYMRTSEA +L E++VFYEAIL
Subjt:  VSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSESYVFYEAIL

Query:  TREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDS
         R YF +   +D+    K+LRF +RFL+V L+++R++M+  L ++L++L+D     F+ET+F+EW+LVVQEI +F+++DT    +RP RY  +L+ +P S
Subjt:  TREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDS

Query:  LTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGG--------TGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYR
         T +      +  + +DA+L+SY+ NEVK++E+TLDT+RM+Q LEWEPSGSFY+      +  G        +G    N + D+ DP+LP NPRK+ILYR
Subjt:  LTPVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGG--------TGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYR

Query:  PSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGTDLG
        P+V+H LA                                                      VLA IC+E++ + V+L+YLSA+G       +     +G
Subjt:  PSVTHFLAVSMISILSIHLKPIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGTDLG

Query:  CESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKG------------LQSGCLSFGTR-GKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLS
            + +    K  +  SQ +  YK                  L  G R G  G + +YP DL+PFTR+P  L+IDSD S AF+ + GAE+GEP AMLLS
Subjt:  CESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKG------------LQSGCLSFGTR-GKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLS

Query:  PTAIT-HAVATDYSR--HGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVL
        P   +    +TD +   +GS FT FLTAPL AFC +LG+S +  + +   +AE++LS+S SEW  +L+TS+ L+ VWAQ+L DPF+RRL+LRFIFCR+VL
Subjt:  PTAIT-HAVATDYSR--HGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVLSSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVL

Query:  TFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFS
        T ++ T     Y+P+C P+LP ++   +  +QS V ++A  LGV++SF F+
Subjt:  TFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFS

Sequences

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CDS sequence

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ATGTCGCAGCCGGGAAATCCGGCCAATAGCACCACCATCAACAGTAGCATTCCAGTGAGCGAAGCCTACTGGTCTCTTGTTGACAAAGCTGACCGGAAGTTCTCCAAGAT
CAGGGACCTGCCTTATTACGAGCGCAATAGGTACGATGCGTATTTCCACAAGGCGTTCAAAGTGTACACACAGTTATGGAAGTTTCAGCAAGAGAATCGTCAGAAGTTGG
TCGAGGCAGGGCTAAAGAGATGGGAGATTGGCGAGATTGCTTCACGAATTGCTCAGCTTTACTTTGGGCAATACATGAGGACCAGTGAAGCGAGCTATTTGTCTGAGTCT
TACGTATTTTATGAAGCAATATTGACTCGAGAGTACTTCAAGGATGGATTGTTTCAAGATGTCAGTCTTGCGAACAAGCAGTTGAGATTCCTGTCCAGATTTCTGATGGT
GTGCCTGGTTCTGAATCGAAGAGAAATGGTGCACCAGTTGGTTAATCAGCTCAAAATGTTGCTCGATGAGTGTAAGAGAACATTCCAGGAAACGGACTTTAGAGAATGGA
AGCTGGTAGTTCAGGAAATAATGAAATTTTTGAAAGCAGACACAGCCTTTATGAATATCAGGCCTTTCAGATATAGTGTTGTGTTAGAGCCTCATCCAGATTCTCTAACA
CCTGTTCCTCCAACGCTTACAACGAGATACCTGAGGTTACAGGATGCTATTCTGAGTAGCTACAATCATAATGAGGTCAAGTTTTCTGAGCTCACGCTAGACACTTTCAG
GATGATCCAGAGCCTGGAGTGGGAGCCCAGTGGTTCCTTTTATCGACCAAATAATAGAAGTGGGCAGAATGGTGGTACTGGGCCAAGCCGCAGTAACTTCTCACAGGATA
TAGTTGATCCTACTCTCCCATCTAATCCTCGGAAGTCAATTTTATACCGTCCTTCAGTGACACATTTTTTAGCAGTTAGTATGATAAGCATACTGTCTATACACCTGAAA
CCCATTGTTCCATTTGTTATATTGACTTGTTCAAGTACTGATTTTAGACCGTGGCATGCTTCTGAAAATATCTACTTGGGAATACTAGTTGGTAATAATCTCAAGTATGT
GAGATTTACTTTGCAGGTTCTAGCTACAATTTGTGAGGAGATGGCAAGTGATGGGGTTCTCTTGATATATTTGTCAGCTGCAGGCAGTGGAAAGAATTTTTTATCTTCCC
CAGCTGGCACTGATCTAGGGTGTGAGTCTATCAACAATGCGGACAATATTGATAAAACCAAGTCTCCTTGCAGTCAGGTTGAAGGAGGTTACAAAGGTCTCCAAAGTGGT
TGCTTATCATTTGGCACTCGTGGAAAAGGAGGATTAAGCTGCATATATCCAAGTGATTTGGTTCCATTTACTAGAAGACCATTTCTTTTAGTTATTGATAGTGACGGCAG
TGAAGCATTTGAGACTATTCATGGAGCAGAAAAGGGAGAGCCAGCTGCAATGCTGTTATCCCCCACTGCTATTACTCATGCTGTTGCTACCGATTATTCCCGTCATGGAA
GCCTTTTCACCCTCTTTCTCACAGCTCCTCTGCATGCTTTCTGTCTATTGCTTGGTATCTCAGGCTCTGATGTTGAAATGGATACATTTAGTAAAGCTGAGAACGTGCTA
TCCTCGTCATTAAGTGAGTGGGGGCAGTTATTGGTGACATCAGAGAGCCTTGACCAAGTTTGGGCACAGATTTTGAATGATCCATTCATAAGGCGACTTCTCTTGAGATT
TATATTCTGTCGTGCTGTGTTAACATTCTACGCACCAACCTTGGGTAAGAAGGAATATATTCCGAGGTGTGTGCCATCTCTGCCCTCCGTCGTCGATCCGACAACAGCAA
CATTGCAATCTGTAGTCATGAAGATAGCAAATATCCTTGGTGTAAGCCGCAGTTTCGTCTTCTCAGAAAACCTGCTACTTTCTGAAAACTAG

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSQPGNPANSTTINSSIPVSEAYWSLVDKADRKFSKIRDLPYYERNRYDAYFHKAFKVYTQLWKFQQENRQKLVEAGLKRWEIGEIASRIAQLYFGQYMRTSEASYLSES
YVFYEAILTREYFKDGLFQDVSLANKQLRFLSRFLMVCLVLNRREMVHQLVNQLKMLLDECKRTFQETDFREWKLVVQEIMKFLKADTAFMNIRPFRYSVVLEPHPDSLT
PVPPTLTTRYLRLQDAILSSYNHNEVKFSELTLDTFRMIQSLEWEPSGSFYRPNNRSGQNGGTGPSRSNFSQDIVDPTLPSNPRKSILYRPSVTHFLAVSMISILSIHLK
PIVPFVILTCSSTDFRPWHASENIYLGILVGNNLKYVRFTLQVLATICEEMASDGVLLIYLSAAGSGKNFLSSPAGTDLGCESINNADNIDKTKSPCSQVEGGYKGLQSG
CLSFGTRGKGGLSCIYPSDLVPFTRRPFLLVIDSDGSEAFETIHGAEKGEPAAMLLSPTAITHAVATDYSRHGSLFTLFLTAPLHAFCLLLGISGSDVEMDTFSKAENVL
SSSLSEWGQLLVTSESLDQVWAQILNDPFIRRLLLRFIFCRAVLTFYAPTLGKKEYIPRCVPSLPSVVDPTTATLQSVVMKIANILGVSRSFVFSENLLLSEN

Cucsat.G17760 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome