; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G17898 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G17898
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionmultiprotein-bridging factor 1b
Genome locationctg3345:849810..851725
RNA-Seq ExpressionCucsat.G17898
SyntenyCucsat.G17898
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149278.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucumis sativus]1.72e-85100Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_008448251.1 PREDICTED: multiprotein-bridging factor 1b [Cucumis melo]7.01e-8599.3Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022149711.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Momordica charantia]1.93e-8296.48Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022943574.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucurbita moschata]5.53e-8295.77Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSST+LNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_038902723.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Benincasa hispida]5.76e-8498.59Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGV6 HTH cro/C1-type domain-containing protein8.34e-86100Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A1S3BIN6 multiprotein-bridging factor 1b3.40e-8599.3Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A5A7V8Z5 Multiprotein-bridging factor 1b3.40e-8599.3Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1D976 multiprotein-bridging factor 1b-like9.34e-8396.48Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1JEZ7 multiprotein-bridging factor 1b2.68e-8295.77Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSST+LNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3T0V7 Endothelial differentiation-related factor 14.2e-2957.89Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G ++ET KK AAG NK    S T NT KLD ETE L HDRV  E+ K I   R  K LTQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog3.2e-2957.89Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK AAG NK      T NT KLD ETE L HDRVP E+ K I   R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c4.9e-3051.8Show/hide
Query:  GPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--TLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE  + DRV  E++  I  AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--TLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b1.1e-5884.51Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AGSNK+ASS T+LNT+KLD++TENLSHDRVPTELKKAIM AR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a1.8e-5680.99Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AG+NK+ASS T+LNT+ LD++TENL+H+RVPTELKKAIM ART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A1.3e-5780.99Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AG+NK+ASS T+LNT+ LD++TENL+H+RVPTELKKAIM ART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C3.5e-3151.8Show/hide
Query:  GPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--TLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE  + DRV  E++  I  AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--TLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C2.4e-1144.94Show/hide
Query:  GPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--TLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHAR
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE  + DRV  E++  +   R
Subjt:  GPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--TLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B8.0e-6084.51Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AGSNK+ASS T+LNT+KLD++TENLSHDRVPTELKKAIM AR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATCGGACCACTTTCACAGGACTGGGAACCGGTTGTCATCAGGAAGAAGGCACCTAACGCCGCCGCAAAGAAGGATGAGAAGGCTGTTAATGCTGCACGCCG
AGCCGGGGCGGAGATTGAAACCATAAAGAAATCTGCTGCTGGGTCGAACAAATCTGCCTCCAGCAGCACTACTTTGAATACTAGGAAGCTTGACGAAGAGACGGAGAACC
TTTCTCATGATCGTGTTCCAACTGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCATGCTCGAACAGAGAAGAAGCTTACACAGTCTCAACTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAA
GTTATCCAGGAGTACGAATCTGGAAAAGCTATTCCAAATCAACAAATAATAACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGAGCGAAATTGCGTGGGAAGAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGAATCGGACCACTTTCACAGGACTGGGAACCGGTTGTCATCAGGAAGAAGGCACCTAACGCCGCCGCAAAGAAGGATGAGAAGGCTGTTAATGCTGCACGCCG
AGCCGGGGCGGAGATTGAAACCATAAAGAAATCTGCTGCTGGGTCGAACAAATCTGCCTCCAGCAGCACTACTTTGAATACTAGGAAGCTTGACGAAGAGACGGAGAACC
TTTCTCATGATCGTGTTCCAACTGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCATGCTCGAACAGAGAAGAAGCTTACACAGTCTCAACTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAA
GTTATCCAGGAGTACGAATCTGGAAAAGCTATTCCAAATCAACAAATAATAACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGAGCGAAATTGCGTGGGAAGAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGIGPLSQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTTLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMHARTEKKLTQSQLAQLINEKPQ
VIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK