; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G17926 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G17926
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionUnknown protein
Genome locationctg3345:1313568..1315050
RNA-Seq ExpressionCucsat.G17926
SyntenyCucsat.G17926
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR040358 - Uncharacterized protein At4g22758-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606010.1 hypothetical protein SDJN03_03327, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.09e-10787.17Show/hide
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XP_022958439.1 uncharacterized protein At4g22758 [Cucurbita moschata]1.09e-10787.17Show/hide
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XP_038902782.1 uncharacterized protein At4g22758 [Benincasa hispida]4.69e-11191.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KES9 Uncharacterized protein9.69e-125100Show/hide
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A0A1S3C8V7 uncharacterized protein At4g227584.39e-11996.81Show/hide
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A0A5A7SQA1 Uncharacterized protein4.39e-11996.81Show/hide
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A0A6J1H539 uncharacterized protein At4g227585.30e-10887.17Show/hide
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A0A6J1K3Z9 uncharacterized protein At4g22758-like1.52e-10787.17Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q56XJ7 Uncharacterized protein At4g227581.1e-0830.06Show/hide
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           V +Y KEGR P L     SAF+LH S FS++ L K E +  LGSR+F++  KK+ +     A  S +  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70780.1 unknown protein9.4e-0832.22Show/hide
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        K  ++L++VT+ GS GP++ +   +  VA ++   ++ Y +EGR P+L  +D + F L+      E+L+  + + +LG+RNF LC K  +
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AT2G27830.1 unknown protein8.1e-4455.98Show/hide
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        +SHR+ KL+EK+ SFHG  +T  +    LRRPKT PEL S    G S + P ++   P++TKLLLNVT+QGSLG VQ+++SPE TV+DL+ A VRQY+KE
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         RRP LP ++PS FDLHYSQFSLES+ ++EKLI+LGSRNFFLC +K +    +    SS SCSKEA++ AK  + F W KF+ F
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AT4G22758.1 unknown protein7.7e-1030.06Show/hide
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AT5G37730.1 unknown protein6.1e-0729.55Show/hide
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        K  KLL++V + GS+GP++ L + +  V+  ++ T++ Y ++GR P+L   D   F  +       +L+ +EK+ ++   NF +C K+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GATCCTTCTGCTTTCGATCTTCATTACTCGCAATTCAGCTTAGAAAGTTTAAACAAGGAAGAGAAGCTGATCGCCTTGGGATCTAGAAACTTCTTTCTGTGTCCTAAAAA
GTCAGACGATAACAACGATTTAATCGCTTCTTCTTCATCTTCTTCGTGCTCGAAAGAAGCTAAAGAAAGCGCGAAGAGTTCCAGCAGTTTCAGTTGGTTTAAATTCATCG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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