; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G1814 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G1814
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptiontranscription factor bHLH93
Genome locationctg1002:2701927..2703046
RNA-Seq ExpressionCucsat.G1814
SyntenyCucsat.G1814
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
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InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3B0U8 transcription factor bHLH93 isoform X21.31e-22588.47Show/hide
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A0A1S3B204 transcription factor bHLH93 isoform X13.51e-22888.74Show/hide
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A0A6J1GCM1 transcription factor bHLH93-like isoform X12.74e-20279.62Show/hide
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A0A6J1IRY6 transcription factor bHLH93-like isoform X16.43e-20179.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S44 Transcription factor BHLH36.6e-5039.21Show/hide
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                       T+FDVE R    TRI+ICC   PG+LLSTV+ LE LGLEI+QCV+SCF+DF MQASC ++   ++ V S+D+IK+ LFR+AGYGG
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Query:  KCL
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Q336V8 Basic helix-loop-helix protein 0043.0e-4250.95Show/hide
Query:  GQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGKSN-EVQVRNSPKVSGFIVI
        G PSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLR++VP+ISKMDRTSILGDTI YVKEL++RI NL+ E  TG  S+        S E  S  ++     P  S     
Subjt:  GQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGKSN-EVQVRNSPKVSGFIVI

Query:  VCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEK-ETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALF
           S  ++ +++          T+F+VER+E   TRI++ CA  P LL ST+  LEALG+EI+QCVISCF+DF+MQASC +    ++    +++IK+ LF
Subjt:  VCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEK-ETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALF

Query:  RNAGYGGKCL
        R+AGYG  CL
Subjt:  RNAGYGGKCL

Q9LSE2 Transcription factor ICE12.6e-3042.24Show/hide
Query:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF
        EIN S      +      K KK +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L  E E+   G        F
Subjt:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF

Query:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM
        + ++   ++   +V+          +   SL      +  VE  L         R+ +   I + C  RPGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN F++
Subjt:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM

Query:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG
            AEQ    + +   D IK  LF  AGY G
Subjt:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG

Q9LSL1 Transcription factor bHLH931.1e-6043.07Show/hide
Query:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNFTSF-------DENPQMASSTFSNFPTIQTPNDFSFADQQLYSNFLEGFAMP
        MELS Q    EELL  T   +        S++ GF    + FF NG+N           DEN  +  S+F +  + Q P         L          P
Subjt:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNFTSF-------DENPQMASSTFSNFPTIQTPNDFSFADQQLYSNFLEGFAMP

Query:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIETETAPSVCKVEMEQMGVREINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR
         L SS+        PF+ + +E+ + ++  PP+ ++  +E  F    + PS     ME    +  +    G    G+ +  K+KK+EGQPSKNLMAERRR
Subjt:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIETETAPSVCKVEMEQMGVREINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR

Query:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFFNGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVK
        RKRLNDRLSMLR+IVPKISKMDRTSILGD IDY+KELL++IN L++EE+   +SN  H     G  K+  +NE  VRNSPK                   
Subjt:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFFNGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVK

Query:  LMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
                    F+++R++++TR+DICC+ +PGLLLSTVNTLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC+E G+ Q+   +S+DIK+ALFRNAGYGG CL
Subjt:  LMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL

Q9LXA9 Transcription factor bHLH617.5e-5443.12Show/hide
Query:  PNDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIET------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINGS
        PND++F D   ++N L+     +  SSS   N  ++ PP + Q    +      P      +  F+E          P +     E       + E + S
Subjt:  PNDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIET------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINGS

Query:  IMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGK
         + + E  K+ SN  KK+EGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLS+LR+IVPKI+KMDRTSILGD IDY+KELL++IN L+E+E+    ++H+           
Subjt:  IMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGK

Query:  SNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQG
        +NE  VRNS K                               F+V+++E  T IDICC T+PGL++STV+TLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC E G
Subjt:  SNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQG

Query:  SAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
          Q+ + +S+  K+AL RNAGYGG+CL
Subjt:  SAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26744.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.9e-3142.24Show/hide
Query:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF
        EIN S      +      K KK +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L  E E+   G        F
Subjt:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF

Query:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM
        + ++   ++   +V+          +   SL      +  VE  L         R+ +   I + C  RPGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN F++
Subjt:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM

Query:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG
            AEQ    + +   D IK  LF  AGY G
Subjt:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG

AT3G26744.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.9e-3142.24Show/hide
Query:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF
        EIN S      +      K KK +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L  E E+   G        F
Subjt:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF

Query:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM
        + ++   ++   +V+          +   SL      +  VE  L         R+ +   I + C  RPGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN F++
Subjt:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM

Query:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG
            AEQ    + +   D IK  LF  AGY G
Subjt:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG

AT3G26744.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.9e-3142.24Show/hide
Query:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF
        EIN S      +      K KK +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLR++VPKISKMDR SILGD IDY+KELL+RIN+L  E E+   G        F
Subjt:  EINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEET---GLDSNHVGFF

Query:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM
        + ++   ++   +V+          +   SL      +  VE  L         R+ +   I + C  RPGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN F++
Subjt:  NGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSM

Query:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG
            AEQ    + +   D IK  LF  AGY G
Subjt:  QASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGG

AT5G10570.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.4e-5543.12Show/hide
Query:  PNDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIET------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINGS
        PND++F D   ++N L+     +  SSS   N  ++ PP + Q    +      P      +  F+E          P +     E       + E + S
Subjt:  PNDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKN--NETPPFVSQEEMSNKNNGYPPVAMEEEELGFIET------ETAPSVCKVEMEQMG----VREINGS

Query:  IMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGK
         + + E  K+ SN  KK+EGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLS+LR+IVPKI+KMDRTSILGD IDY+KELL++IN L+E+E+    ++H+           
Subjt:  IMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGK

Query:  SNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQG
        +NE  VRNS K                               F+V+++E  T IDICC T+PGL++STV+TLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC E G
Subjt:  SNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQG

Query:  SAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
          Q+ + +S+  K+AL RNAGYGG+CL
Subjt:  SAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL

AT5G65640.1 beta HLH protein 937.7e-6243.07Show/hide
Query:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNFTSF-------DENPQMASSTFSNFPTIQTPNDFSFADQQLYSNFLEGFAMP
        MELS Q    EELL  T   +        S++ GF    + FF NG+N           DEN  +  S+F +  + Q P         L          P
Subjt:  MELS-QHGFLEELLASTPWTS--------SYSNGF----NDFFQNGWNFTSF-------DENPQMASSTFSNFPTIQTPNDFSFADQQLYSNFLEGFAMP

Query:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIETETAPSVCKVEMEQMGVREINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR
         L SS+        PF+ + +E+ + ++  PP+ ++  +E  F    + PS     ME    +  +    G    G+ +  K+KK+EGQPSKNLMAERRR
Subjt:  ELDSSSYTKNNETPPFV-SQEEMSNKNNGYPPVAMEE-EELGFIETETAPSVCKVEMEQMGVREINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRR

Query:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFFNGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVK
        RKRLNDRLSMLR+IVPKISKMDRTSILGD IDY+KELL++IN L++EE+   +SN  H     G  K+  +NE  VRNSPK                   
Subjt:  RKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERINNLKEEEETGLDSN--HVGFFNGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVK

Query:  LMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL
                    F+++R++++TR+DICC+ +PGLLLSTVNTLE LGLEI+QCVISCF+DFS+QASC+E G+ Q+   +S+DIK+ALFRNAGYGG CL
Subjt:  LMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVISCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTCAGTCAACATGGTTTCTTAGAGGAGTTATTAGCTTCAACACCTTGGACTTCTTCATACTCAAACGGGTTCAATGATTTTTTTCAAAATGGCTGGAATTTCAC
TTCTTTTGATGAAAATCCCCAAATGGCTTCTTCCACTTTCTCCAATTTTCCCACTATCCAAACACCTAATGATTTTTCTTTCGCCGATCAACAACTCTACAGCAATTTTC
TCGAAGGGTTTGCGATGCCGGAGCTCGATTCCTCGTCCTACACTAAGAACAACGAAACCCCACCATTTGTTTCGCAAGAAGAAATGAGTAATAAGAACAATGGTTACCCT
CCCGTGGCGATGGAGGAGGAAGAACTTGGTTTTATCGAGACTGAAACAGCTCCAAGTGTTTGTAAAGTGGAAATGGAGCAAATGGGTGTTCGTGAAATTAATGGTTCTAT
AATGGGTGTCGCAGAATTGGGAAAAAGAAGCAGCAACAAAGCTAAGAAGATTGAAGGACAGCCTTCAAAGAATTTAATGGCGGAAAGAAGAAGAAGGAAGCGGTTGAATG
ATCGGCTTTCAATGCTCAGAGCCATAGTCCCTAAAATAAGCAAGATGGATAGAACGTCTATACTTGGAGACACAATCGATTATGTGAAAGAGCTGCTAGAAAGAATCAAT
AACTTGAAAGAAGAAGAGGAAACTGGTTTAGATTCAAATCACGTGGGTTTCTTCAATGGGATCTCTAAGGAAGGGAAGTCCAATGAGGTTCAAGTGAGAAATTCTCCAAA
GGTATCTGGTTTCATTGTTATTGTTTGTTACAGTTTAGTTAAATCTGCCATTGTTAAGCTAATGGTTGAAGCTTTGTTGTTGTTCGTTACACAGTTCGATGTTGAAAGGA
AGGAGAAGGAGACTCGAATCGACATTTGCTGTGCAACAAGGCCAGGATTATTGCTGTCTACAGTCAACACATTAGAAGCATTGGGTCTTGAGATTCAGCAGTGTGTTATT
AGCTGCTTCAATGATTTTTCAATGCAAGCTTCTTGTGCAGAGCAGGGAAGTGCTCAGAAAGCTGTGGCAAGTTCTGATGATATAAAGGAAGCACTGTTCAGAAATGCAGG
ATATGGAGGAAAGTGCTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCTCAGTCAACATGGTTTCTTAGAGGAGTTATTAGCTTCAACACCTTGGACTTCTTCATACTCAAACGGGTTCAATGATTTTTTTCAAAATGGCTGGAATTTCAC
TTCTTTTGATGAAAATCCCCAAATGGCTTCTTCCACTTTCTCCAATTTTCCCACTATCCAAACACCTAATGATTTTTCTTTCGCCGATCAACAACTCTACAGCAATTTTC
TCGAAGGGTTTGCGATGCCGGAGCTCGATTCCTCGTCCTACACTAAGAACAACGAAACCCCACCATTTGTTTCGCAAGAAGAAATGAGTAATAAGAACAATGGTTACCCT
CCCGTGGCGATGGAGGAGGAAGAACTTGGTTTTATCGAGACTGAAACAGCTCCAAGTGTTTGTAAAGTGGAAATGGAGCAAATGGGTGTTCGTGAAATTAATGGTTCTAT
AATGGGTGTCGCAGAATTGGGAAAAAGAAGCAGCAACAAAGCTAAGAAGATTGAAGGACAGCCTTCAAAGAATTTAATGGCGGAAAGAAGAAGAAGGAAGCGGTTGAATG
ATCGGCTTTCAATGCTCAGAGCCATAGTCCCTAAAATAAGCAAGATGGATAGAACGTCTATACTTGGAGACACAATCGATTATGTGAAAGAGCTGCTAGAAAGAATCAAT
AACTTGAAAGAAGAAGAGGAAACTGGTTTAGATTCAAATCACGTGGGTTTCTTCAATGGGATCTCTAAGGAAGGGAAGTCCAATGAGGTTCAAGTGAGAAATTCTCCAAA
GGTATCTGGTTTCATTGTTATTGTTTGTTACAGTTTAGTTAAATCTGCCATTGTTAAGCTAATGGTTGAAGCTTTGTTGTTGTTCGTTACACAGTTCGATGTTGAAAGGA
AGGAGAAGGAGACTCGAATCGACATTTGCTGTGCAACAAGGCCAGGATTATTGCTGTCTACAGTCAACACATTAGAAGCATTGGGTCTTGAGATTCAGCAGTGTGTTATT
AGCTGCTTCAATGATTTTTCAATGCAAGCTTCTTGTGCAGAGCAGGGAAGTGCTCAGAAAGCTGTGGCAAGTTCTGATGATATAAAGGAAGCACTGTTCAGAAATGCAGG
ATATGGAGGAAAGTGCTTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELSQHGFLEELLASTPWTSSYSNGFNDFFQNGWNFTSFDENPQMASSTFSNFPTIQTPNDFSFADQQLYSNFLEGFAMPELDSSSYTKNNETPPFVSQEEMSNKNNGYP
PVAMEEEELGFIETETAPSVCKVEMEQMGVREINGSIMGVAELGKRSSNKAKKIEGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRAIVPKISKMDRTSILGDTIDYVKELLERIN
NLKEEEETGLDSNHVGFFNGISKEGKSNEVQVRNSPKVSGFIVIVCYSLVKSAIVKLMVEALLLFVTQFDVERKEKETRIDICCATRPGLLLSTVNTLEALGLEIQQCVI
SCFNDFSMQASCAEQGSAQKAVASSDDIKEALFRNAGYGGKCL