; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G18157 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G18157
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptiontranscription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like
Genome locationctg3345:1553361..1555139
RNA-Seq ExpressionCucsat.G18157
SyntenyCucsat.G18157
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0010039 - response to iron ion (biological process)
GO:0034756 - regulation of iron ion transport (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145819.1 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR [Cucumis sativus]2.30e-20699.03Show/hide
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XP_022986352.1 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like [Cucurbita maxima]5.39e-16283.5Show/hide
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XP_038902250.1 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR [Benincasa hispida]3.58e-17187.18Show/hide
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A0A1S3CQB6 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR isoform X14.89e-20697.73Show/hide
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A0A1S4E5Y5 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR isoform X26.37e-15679.61Show/hide
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A0A5A7T764 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR isoform X14.89e-20697.73Show/hide
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A0A6J1FTZ6 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like3.34e-16584.47Show/hide
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A0A6J1J7B0 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like2.61e-16283.5Show/hide
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A0A0N7KIY3 Transcription factor BHLH1563.7e-2234.17Show/hide
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         DR + T T+ V + E D++  +   +KLW+  ALL  GF
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Q0V7X4 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR3.7e-6250.79Show/hide
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        +++IND  EL +F+   NFDQ++NLIRG ++T   + N  LDF  G L       Q+    +D N  + +  + LF  L   +S + E         V  
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          E+++ED N+  ++S++TT    ++K K DR+RTLISERRRRGRMK+KLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYV+ELQ QAKKLK++I+ LE+S+N T
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           + H    +K       +      KIIQ+DV QVEE+GFY+RLVC  GE VA SLYK LESLTSF +Q+SNL+S S D ++LT T++    E  +NLP
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        NLKLW+TG+LLN GFEF
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH351.4e-1332.48Show/hide
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        +E IVD  +    +P+S               ED + D      E++  S  SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKASI
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        + DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V E
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        SL   I+ +SNLTS S     T  I   + E ++
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Q700E3 Transcription factor bHLH274.2e-1031.73Show/hide
Query:  KEVEDEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLES----
        +E+E +    +E  + S E+SS   +    A  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNI+K+DKAS++ D++ Y++EL  Q K L+AEI  LES    
Subjt:  KEVEDEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLES----

Query:  ----------SINETQ----KVHRDQTKKKIIQTSYSD--QFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSASDRF
                  +  ET       + D   KK  Q  YS   Q  P +++++ V  + E+   + + C       + L KVLESL   I+ ++N +S + R 
Subjt:  ----------SINETQ----KVHRDQTKKKIIQTSYSD--QFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSASDRF

Query:  ILTATINV
          T  + V
Subjt:  ILTATINV

Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES1.9e-1025.93Show/hide
Query:  IVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAV
        +V+   V+N    +    ++S +    +++DED+ + +              K  K  + + L++ERRRR ++ ++LYALRSLVP ITK+D+ASI+GDA+
Subjt:  IVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAV

Query:  LYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINETQKVHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKII---------------------QLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVA
         YVKELQ +AK+L+ E+     + + + +     +    + T +         +                     Q+DV Q++ R F+++++C+      
Subjt:  LYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINETQKVHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKII---------------------QLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVA

Query:  MSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVRDCEVDMN
          L + L+SL         +T+A+    L+   NV   E + N
Subjt:  MSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVRDCEVDMN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28160.1 FER-like regulator of iron uptake2.6e-6350.79Show/hide
Query:  MTDINDQFELQDFIHGDNFDQYVNLIRGGNETPIFNNNFDLDFMNGCLIENRVVDQSLEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKE---------VED
        +++IND  EL +F+   NFDQ++NLIRG ++T   + N  LDF  G L       Q+    +D N  + +  + LF  L   +S + E         V  
Subjt:  MTDINDQFELQDFIHGDNFDQYVNLIRGGNETPIFNNNFDLDFMNGCLIENRVVDQSLEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKE---------VED

Query:  EDEDEDEDENESVENSSSTT----SKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINET
          E+++ED N+  ++S++TT    ++K K DR+RTLISERRRRGRMK+KLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYV+ELQ QAKKLK++I+ LE+S+N T
Subjt:  EDEDEDEDENESVENSSSTT----SKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINET

Query:  --QKVHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSAS-DRFILTATINVRDCEVDMNLP
           + H    +K       +      KIIQ+DV QVEE+GFY+RLVC  GE VA SLYK LESLTSF +Q+SNL+S S D ++LT T++    E  +NLP
Subjt:  --QKVHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSAS-DRFILTATINVRDCEVDMNLP

Query:  NLKLWLTGALLNHGFEF
        NLKLW+TG+LLN GFEF
Subjt:  NLKLWLTGALLNHGFEF

AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.2e-1432.34Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDE---DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKAS
        +E IVD  +    +P+S              +++ED + D    +E  S    SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKAS
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDE---DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKAS

Query:  IVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVL
        I+ DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V 
Subjt:  IVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVL

Query:  ESLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVRDCEVDM
        ESL   I+ +SNLTS S     T  I   + E ++
Subjt:  ESLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVRDCEVDM

AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein7.7e-1533.48Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENS--SSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASI
        +E IVD  +    +P+S               ED + D      E++  S  SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKASI
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENS--SSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASI

Query:  VGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLE
        + DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V E
Subjt:  VGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLE

Query:  SLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINV
        SL   I+ +SNLTS S     T  I V
Subjt:  SLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINV

AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.0e-1433.04Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENS--SSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASI
        +E IVD  +    +P+S               ED + D      E++  S  SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKASI
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENS--SSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASI

Query:  VGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLE
        + DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V E
Subjt:  VGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLE

Query:  SLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINV
        SL   I+ +SNLTS S     T  I +
Subjt:  SLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINV

AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.4e-1533.33Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENS--SSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASI
        +E IVD  +    +P+S               ED + D      E++  S  SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKASI
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENESVENS--SSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASI

Query:  VGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLE
        + DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V E
Subjt:  VGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKVHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLE

Query:  SLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVR
        SL   I+ +SNLTS S     T  I +R
Subjt:  SLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCAATTTGGGAGGCATTTAATGACGGACATCAACGATCAATTTGAGCTCCAAGATTTCATCCATGGCGACAACTTTGATCAATATGTGAATCTGATTCGTGGAGG
GAACGAAACTCCGATCTTCAACAATAACTTTGATCTCGATTTCATGAACGGTTGCTTGATCGAGAATCGTGTGGTGGATCAAAGCTTGGAATACATTGTAGATTCAAATA
TGGTGATGAATTCTGATCCAAATTCTCTGTTTAGTACATTGGAGAGTTTCAATAGCATCATGAAAGAAGTTGAAGATGAAGATGAAGATGAAGACGAAGATGAAAACGAG
TCTGTAGAGAATTCTTCTTCCACAACCTCAAAGAAACCTAAGGCAGATAGAACAAGAACTTTGATTTCTGAAAGAAGAAGAAGAGGAAGAATGAAGGAAAAGCTTTATGC
ATTGCGTTCATTGGTTCCAAATATAACTAAGATGGACAAAGCTTCCATTGTTGGAGATGCAGTGTTGTATGTGAAAGAGCTACAAATGCAAGCAAAGAAGCTCAAAGCAG
AAATATCAGTTTTGGAATCTTCAATCAATGAAACACAAAAAGTTCATAGAGATCAAACCAAAAAGAAAATTATTCAAACTTCATATTCTGACCAATTCCTCCCCACCAAA
ATAATTCAGCTGGATGTGTTTCAAGTAGAGGAAAGAGGGTTTTATTTGAGGCTAGTTTGCAAGATGGGTGAAAGAGTAGCCATGTCTCTTTACAAAGTTCTTGAATCTCT
CACCAGCTTCATTATTCAAAGCTCCAATTTGACTTCTGCTTCTGACAGATTCATTCTCACGGCTACAATTAATGTGAGGGATTGTGAGGTGGACATGAATTTGCCAAATC
TGAAGCTTTGGCTAACTGGGGCACTTCTTAACCATGGATTTGAGTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCAATTTGGGAGGCATTTAATGACGGACATCAACGATCAATTTGAGCTCCAAGATTTCATCCATGGCGACAACTTTGATCAATATGTGAATCTGATTCGTGGAGG
GAACGAAACTCCGATCTTCAACAATAACTTTGATCTCGATTTCATGAACGGTTGCTTGATCGAGAATCGTGTGGTGGATCAAAGCTTGGAATACATTGTAGATTCAAATA
TGGTGATGAATTCTGATCCAAATTCTCTGTTTAGTACATTGGAGAGTTTCAATAGCATCATGAAAGAAGTTGAAGATGAAGATGAAGATGAAGACGAAGATGAAAACGAG
TCTGTAGAGAATTCTTCTTCCACAACCTCAAAGAAACCTAAGGCAGATAGAACAAGAACTTTGATTTCTGAAAGAAGAAGAAGAGGAAGAATGAAGGAAAAGCTTTATGC
ATTGCGTTCATTGGTTCCAAATATAACTAAGATGGACAAAGCTTCCATTGTTGGAGATGCAGTGTTGTATGTGAAAGAGCTACAAATGCAAGCAAAGAAGCTCAAAGCAG
AAATATCAGTTTTGGAATCTTCAATCAATGAAACACAAAAAGTTCATAGAGATCAAACCAAAAAGAAAATTATTCAAACTTCATATTCTGACCAATTCCTCCCCACCAAA
ATAATTCAGCTGGATGTGTTTCAAGTAGAGGAAAGAGGGTTTTATTTGAGGCTAGTTTGCAAGATGGGTGAAAGAGTAGCCATGTCTCTTTACAAAGTTCTTGAATCTCT
CACCAGCTTCATTATTCAAAGCTCCAATTTGACTTCTGCTTCTGACAGATTCATTCTCACGGCTACAATTAATGTGAGGGATTGTGAGGTGGACATGAATTTGCCAAATC
TGAAGCTTTGGCTAACTGGGGCACTTCTTAACCATGGATTTGAGTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEQFGRHLMTDINDQFELQDFIHGDNFDQYVNLIRGGNETPIFNNNFDLDFMNGCLIENRVVDQSLEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVEDEDEDEDEDENE
SVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINETQKVHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTK
IIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTSFIIQSSNLTSASDRFILTATINVRDCEVDMNLPNLKLWLTGALLNHGFEF