; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G18177 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G18177
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionglucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like
Genome locationctg3345:1967225..1968973
RNA-Seq ExpressionCucsat.G18177
SyntenyCucsat.G18177
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008456350.1 PREDICTED: PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like [Cucumis melo]4.94e-14291.29Show/hide
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XP_038900831.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.34e-11384.51Show/hide
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XP_038900832.1 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.85e-12884.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDA3 X8 domain-containing protein1.47e-126100Show/hide
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A0A1S4E1R5 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like2.39e-14291.29Show/hide
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A0A5A7ULQ0 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 5-like1.26e-10792.61Show/hide
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A0A6J1FWZ7 major pollen allergen Ole e 10-like1.39e-10780.53Show/hide
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        MDG F C+TLILFLF  IH   PGSSRADPTQKQGK +RAAS   ST QKDITTPITTVPTINIPT       +SNPD+VSP +TTPSFTP+TT +GGSS
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        WCIAS  ASQA LQLALDYACG+GGADCS+IQ GG+CYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPS+G+CEYPSTSTSSS+LNTTNSS
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        GSTVFGA PSGPS+SSS+   SSSAL
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A0A6J1JFA6 major pollen allergen Ole e 10-like1.51e-10981.94Show/hide
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        MDG F C+TLILFLF  IH F PGSSRADPTQKQGK +RAAS   ST QKDITTPITTVPTINIPT       +SNPD+VSP +TTPSFTP+TT +GGSS
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Query:  WCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVLNTTNSS
        WCIA+  ASQAALQLALDYACG+GGADCS+IQ GG CYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPS+G+CEYPSTSTSSSVLNTTNSS
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        GSTVFGAVPSGPS+SSS    SSSSAL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 15.3e-1644.64Show/hide
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        ++CIA        LQ ALD+ACG G ++CS IQ G +CY PN+V+ HAS+AFNSYYQK      SC+F G A+IT+T+PS G+C +P +    +   T  
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Query:  SSGSTVFGAVPS
        +S     G   S
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P52409 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase2.4e-1642.02Show/hide
Query:  IINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPN-SCNFG
        ++   +S   T SP   +P+ +P    SGG  WC+A   A+   LQ  ++YACG    DC  IQ GG C++PNS++ HASY  N+YYQ N   + +C+F 
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Query:  GTAVITSTNPSTGTCEYPS
        GT ++TS++PS G C+Y S
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Q84V39 Major pollen allergen Ole e 101.3e-1741.73Show/hide
Query:  TINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQ-KNP
        T  +P  P+  P  S P + SP        P     G   WC+    A+ A LQ  +DY C   G DC  IQ  G C+NPN+VR HASYA NS+YQ K  
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Query:  LPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPS
            C+F GT  ITS++PS G+C + S
Subjt:  LPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPS

Q9M069 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 71.1e-1647.06Show/hide
Query:  TTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNP-LPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCE
        ++ S TPS  ++  S WC+  + A+   LQ +LD+ACG  G DC +IQ GG C+ PN+V  HA+YA N Y+QK+P  P  C+F  TA +TS NPS   C 
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Query:  YP
        YP
Subjt:  YP

Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 36.2e-1743.97Show/hide
Query:  SWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQK-NPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVL-NTT
        ++CIA +   +  LQ ALD+ACG G  DCS++  G +CY P+ V  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+T+PS GTC +P ++ S+  L N T
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Query:  N----SSGSTVFGAVP
        +    S+ ST  G +P
Subjt:  N----SSGSTVFGAVP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.8e-2845.6Show/hide
Query:  TQKDITTPITTVP----------TINIPTI------PIINPASSNPDTVS--------PAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGI
        T   I  P+TT+P          TI  PT+      P+ NP +  P T          P +  P  + S ++S G SWC+A   ASQ +LQ ALDYACGI
Subjt:  TQKDITTPITTVP----------TINIPTI------PIINPASSNPDTVS--------PAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGI

Query:  GGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVL--NTTNSSGST
          ADCS +Q GGNCY+P S++ HAS+AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +TNPSTG+C Y + S++S+ +   TT  + ST
Subjt:  GGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVL--NTTNSSGST

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein8.9e-2750.77Show/hide
Query:  GGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVLNT
        G   WCIA  +AS  +LQ+ALDYACG GGADC  IQ G  CY PN++RDHAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TST+PS G+C +            
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Query:  TNSSGSTVFGAVPSGPSSSSSSSSSALIFP
         +SS  TV  + PS  S    SS  +  +P
Subjt:  TNSSGSTVFGAVPSGPSSSSSSSSSALIFP

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.5e-4253.97Show/hide
Query:  QKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHAS
        +KDITTP+ T PT   PT  + N  S      +  +T PS        G  SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACGIGGADCS IQ GGNCYNPNS+R HAS
Subjt:  QKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHAS

Query:  YAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVLNTTNSSGSTVFGAVPSGPS---SSSSSSSSALIFPSTQYFSLF
        +AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S +PS G+C +PSTSTS S+LN T+  G  +FG +PS P+    +S+SSS  LI  S  YF  F
Subjt:  YAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVLNTTNSSGSTVFGAVPSGPS---SSSSSSSSALIFPSTQYFSLF

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.2e-3356.92Show/hide
Query:  QKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHAS
        +KDITTP+ T PT   PT  + N  S      +  +T PS        G  SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACGIGGADCS IQ GGNCYNPNS+R HAS
Subjt:  QKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHAS

Query:  YAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPS
        +AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S +PS
Subjt:  YAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPS

AT5G55180.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein2.5e-2148.28Show/hide
Query:  PASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPL-PNSCNFGGTA
        P + N + V P    PS         G +WC+A+   ++  LQ  LDYACG GGADC  IQ G  CYNP S+  HASYAFNSYYQKN     +CNFGG A
Subjt:  PASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAALQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPL-PNSCNFGGTA

Query:  VITSTNPSTGTCEYPS
         + S  P  G CE+P+
Subjt:  VITSTNPSTGTCEYPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGGAGGTTCCTTTGTAGCACTCTAATTCTATTCCTATTCATTCACTGGTTTTGCCCAGGTTCATCAAGGGCAGATCCTACACAAAAACAGGGGAAGCAATTCAG
AGCAGCATCAAGAAAATCTTCTACAACTCAAAAGGACATCACGACCCCAATAACAACAGTCCCAACAATCAACATCCCAACCATCCCCATCATAAACCCTGCCAGTTCCA
ACCCCGATACCGTCTCCCCAGCCATGACGACCCCAAGCTTTACACCGTCAACCACCATCAGCGGTGGCTCCAGCTGGTGCATTGCGAGTCAGAGTGCGTCGCAGGCGGCG
CTGCAATTAGCTTTGGACTATGCGTGTGGCATAGGAGGCGCCGATTGCTCGTCGATTCAAGGCGGAGGAAACTGCTACAATCCTAATTCGGTTCGAGACCATGCTTCTTA
CGCGTTCAATAGCTATTATCAGAAGAATCCGCTTCCGAATAGCTGTAATTTTGGAGGCACTGCCGTGATTACTAGCACCAATCCCAGCACTGGCACGTGCGAGTACCCAT
CAACAAGCACAAGTTCATCGGTTTTGAACACTACAAATTCAAGTGGCTCCACCGTGTTCGGCGCCGTTCCTTCCGGCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATCGGCA
CTCATTTTTCCTTCTACCCAATATTTTTCCTTATTTACAAATTTTCTTCTTTTTATTGCTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGGGAGGTTCCTTTGTAGCACTCTAATTCTATTCCTATTCATTCACTGGTTTTGCCCAGGTTCATCAAGGGCAGATCCTACACAAAAACAGGGGAAGCAATTCAG
AGCAGCATCAAGAAAATCTTCTACAACTCAAAAGGACATCACGACCCCAATAACAACAGTCCCAACAATCAACATCCCAACCATCCCCATCATAAACCCTGCCAGTTCCA
ACCCCGATACCGTCTCCCCAGCCATGACGACCCCAAGCTTTACACCGTCAACCACCATCAGCGGTGGCTCCAGCTGGTGCATTGCGAGTCAGAGTGCGTCGCAGGCGGCG
CTGCAATTAGCTTTGGACTATGCGTGTGGCATAGGAGGCGCCGATTGCTCGTCGATTCAAGGCGGAGGAAACTGCTACAATCCTAATTCGGTTCGAGACCATGCTTCTTA
CGCGTTCAATAGCTATTATCAGAAGAATCCGCTTCCGAATAGCTGTAATTTTGGAGGCACTGCCGTGATTACTAGCACCAATCCCAGCACTGGCACGTGCGAGTACCCAT
CAACAAGCACAAGTTCATCGGTTTTGAACACTACAAATTCAAGTGGCTCCACCGTGTTCGGCGCCGTTCCTTCCGGCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATCGGCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGRFLCSTLILFLFIHWFCPGSSRADPTQKQGKQFRAASRKSSTTQKDITTPITTVPTINIPTIPIINPASSNPDTVSPAMTTPSFTPSTTISGGSSWCIASQSASQAA
LQLALDYACGIGGADCSSIQGGGNCYNPNSVRDHASYAFNSYYQKNPLPNSCNFGGTAVITSTNPSTGTCEYPSTSTSSSVLNTTNSSGSTVFGAVPSGPSSSSSSSSSA
LIFPSTQYFSLFTNFLLFIAF