CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G18283
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	ctg3345:4694115..4702494
RNA-Seq Expression	Cucsat.G18283
Synteny	Cucsat.G18283
Gene Ontology terms	GO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process) GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0005643 - nuclear pore (cellular component) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

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XP_008459731.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]

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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_031743587.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus]

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        VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEED
Subjt:  VSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEED

Query:  AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT
        AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT
Subjt:  AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT

Query:  EGPAADRELLGQKLWMS
        EGPAADRELLGQKLWMS
Subjt:  EGPAADRELLGQKLWMS

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

0.0

95.54

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Query:  MSGFGFGSSTSQSSS--PFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGA
        MSGFGFGSSTSQSSS  PFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSS NPTSSSSPFPNPTSNP  SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGA
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSS--PFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNP--SSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGA

Query:  SSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
        SSSS PSS+A SASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA LFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
Subjt:  SSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA

Query:  APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP
        APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS LFGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Subjt:  APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP

Query:  FQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTS
        FQS+LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTS
Subjt:  FQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTS

Query:  LSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP
        LSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQP FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP
Subjt:  LSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP

Query:  ASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
        ASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Subjt:  ASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN

Query:  RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGG
        RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGG
Subjt:  RDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGG

Query:  ELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
        ELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Subjt:  ELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS

A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP62

3.48e-254

81.85

Show/hide

Query:  FGAAPSSGSSVAPSFGAL-----SSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSG
        FGAA ++GSS    FGA      +SSAG+SS  LFGAAPSAGAS APSLFGG SSAT+SS PLFG+SA  A+ GS L GAS AASGS   LFGT A+SSG
Subjt:  FGAAPSSGSSVAPSFGAL-----SSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSG

Query:  STGSGLFGS----SPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLS---TSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPS-GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLAST
        S GS LFG+    + FG+++ GT    S+S LFASS+S   TS FQ++ SSSSSQ+L+SSSPF AS S GFSFPT SLSKTT+    SSSSS  LT AST
Subjt:  STGSGLFGS----SPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLS---TSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPS-GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLAST

Query:  SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPS
        SSSSFSFGTPASS+SQSSFGFS +NAAST  S+AP TTATKPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQP FSVPAFS SSSAATT+S AASS PS
Subjt:  SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPS

Query:  AASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL
        AASSGA SSFTGFGVT++ASSSS I SLSLPTKT TAASSSQ PASFGFPSL SASTAATT+SGFSA SQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSA VS+TPKL
Subjt:  AASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL

Query:  PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGL
        PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVEEDAERIYKDERGL
Subjt:  PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGL

Query:  LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLG
        LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AAT+GPAADRELLG
Subjt:  LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLG

Query:  QKLWMS
        QK WMS
Subjt:  QKLWMS

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

1.03e-300

77.54

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Query:  MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQ   SSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS F N TSNP SS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA----GSLPAPSFGAAPSSGSSVAP
        ASS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA  FGAA              S+SGTS   LFG+    GS P PSFGAAP SGSSVAP
Subjt:  ASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA----GSLPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGALSSS-------------AGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS
         FG+  SS             AG+SS+P FGAAPSAG +SAPSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA  AS GS +FGAS AASGS  SLF            
Subjt:  SFGALSSS-------------AGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGS

Query:  GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT
           GS+PF +SS     S STSNLF   +SS ST+PFQ++ SSSSSQNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT  SSSSS  LT ASTSSSSFSFGT
Subjt:  GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGT

Query:  PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSS
        PASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP FS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSGA SS
Subjt:  PASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSS

Query:  FTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV
        FTGFGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTV
Subjt:  FTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTV

Query:  EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
        EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
Subjt:  EEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST

Query:  RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
        RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQK WMS
Subjt:  RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

2.86e-300

76.33

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Query:  MSGFGFGSSTSQSSS---PFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQSSS   PFSSTTGFSFGST+ FSFGSSP    LS SSSSSSNP+SSSS F N TSNP SS+ FGF SSSF +S SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSS---PFSSTTGFSFGSTN-FSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSS-FGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA----GSLPAPSFGAAPSSGSSVAP
        ASS         S S+LF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA  FGAA              S+SGTS   LFG+    GS P PSFGAAP+SGSSVAP
Subjt:  ASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAA--------------SSSGTSSTSLFGA----GSLPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGAL---------------------------SSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS
         FG+                            +SS+G+SS+P FGAAPS G +SAPSLFGG SSA TTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS  S
Subjt:  SFGAL---------------------------SSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSA-TTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVS

Query:  LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSL
        LF               GS+ F +SSSGTLSS STSNLF   +SS ST+PFQ++ SSSSSQNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT  SSSSS  L
Subjt:  LFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLF---ASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSL

Query:  TLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAA
        T ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF+I+NAAS  GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP FS+PAFS SSSAATTLSIAA
Subjt:  TLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAA

Query:  SSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS
        SSAPSA SSGA SSFTGFG+TS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS
Subjt:  SSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS

Query:  STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYK
        +TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYK
Subjt:  STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYK

Query:  DERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAAD
        DERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAAD
Subjt:  DERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAAD

Query:  RELLGQKLWMS
        RELLGQK WMS
Subjt:  RELLGQKLWMS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

G0SBQ3 Nucleoporin NSP1

2.3e-09

29.94

Show/hide

Query:  SFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPS-SGSSVAPSFG-ALS
        SF+    ST  +S  + +S A ++  LFG   S+TG ++  F   ++S   S SLFG A++     TSLFG  S   P+   A S  G S + S G +L 
Subjt:  SFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPS-SGSSVAPSFG-ALS

Query:  SSAGTSSAPLFG-----AAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT
         +A   S  LFG     AA S+  +  PSLF G+ +ATTS+     T A+ A SGS LFG++ A          T   SS  T +GLFG S    +S   
Subjt:  SSAGTSSAPLFG-----AAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT

Query:  LSSASTSNLFASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAA
          S +T     S   T+P +    S  S     + P  A+ +   F   S   TT  +  +   S+S T    SS+      PA +S+ ++      + A
Subjt:  LSSASTSNLFASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAA

Query:  STGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFTGFG----VTSS
        +T  +SAP STT T     +L++S     ++ +T +ASTPAA   T+P F   A +S+  ++TT +     + + A +AA+  + ++ T FG     T++
Subjt:  STGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFTGFG----VTSS

Query:  ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSA-TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIK
        A++SS   + S P+   +  +S+ APAS G P+  +A   ++A  TT+    S  S T+S       +  TT+ + A TV    +LP  +  KT++EII 
Subjt:  ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSA-TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIK

Query:  EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRD
         W  +L +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    ++AA     R+
Subjt:  EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRD

Query:  AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG
          Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Subjt:  AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

2.3e-110

51.67

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSS
        MSGF FG S        +S  GFSFGS         S  + SSS+SS+++P S S    N +SNPSS+ FGFGSS  ST  SS       + S G  +SS
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSS

Query:  APS----SAATSASSLFGVSSS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA-PS---FGALSSSAG
         PS    S+A+S++  FG  SS     ++   SFGFG ++SS+  + SLFG    S T++ S    GS P   FG   SS SS A PS   FGA +SSA 
Subjt:  APS----SAATSASSLFGVSSS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA-PS---FGALSSSAG

Query:  TSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST
        T S+  FGAAP++G++    S+PSLF   SSA+ S++ LFG S+SAA+S S LFGA             +++A GS  S+FG   +S         SGS+
Subjt:  TSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST

Query:  GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSTLSSSSSQNLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLAS
         S  G  GSSPF  SSS   S+ ST +LFASS       S SPF  ST +SSS+ N +  S+SPF AS +GFSF   + S TTS T  S+   +     +
Subjt:  GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSTLSSSSSQNLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLAS

Query:  TSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAP
        +SSSSFSFGT A+S      GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P  S PA + +  +    S A ++ P
Subjt:  TSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAP

Query:  SAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST
          ASS A  S TGFG+ SS  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T + LVV SSS   TST  A V+ +
Subjt:  SAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST

Query:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDE
        PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DE
Subjt:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDE

Query:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRE
        R  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G   DRE
Subjt:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRE

Query:  LLGQKLWMS
        L+  K WMS
Subjt:  LLGQKLWMS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

1.6e-111

51.67

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Query:  MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSS
        MSGF FG S        +S  GFSFGS         S  + SSS+SS+++P S S    N +SNPSS+ FGFGSS  ST  SS       + S G  +SS
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSS

Query:  APS----SAATSASSLFGVSSS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA-PS---FGALSSSAG
         PS    S+A+S++  FG  SS     ++   SFGFG ++SS+  + SLFG    S T++ S    GS P   FG   SS SS A PS   FGA +SSA 
Subjt:  APS----SAATSASSLFGVSSS-----STGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA-PS---FGALSSSAG

Query:  TSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST
        T S+  FGAAP++G++    S+PSLF   SSA+ S++ LFG S+SAA+S S LFGA             +++A GS  S+FG   +S         SGS+
Subjt:  TSSAPLFGAAPSAGAS----SAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS---------SGST

Query:  GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSTLSSSSSQNLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLAS
         S  G  GSSPF  SSS   S+ ST +LFASS       S SPF  ST +SSS+ N +  S+SPF AS +GFSF   + S TTS T  S+   +     +
Subjt:  GS--GLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASS------LSTSPF-QSTLSSSSSQNLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLAS

Query:  TSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAP
        +SSSSFSFGT A+S      GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P  S PA + +  +    S A ++ P
Subjt:  TSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAP

Query:  SAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST
          ASS A  S TGFG+ SS  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T + LVV SSS   TST  A V+ +
Subjt:  SAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSST

Query:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDE
        PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DE
Subjt:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDE

Query:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRE
        R  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G   DRE
Subjt:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRE

Query:  LLGQKLWMS
        L+  K WMS
Subjt:  LLGQKLWMS

Sequences

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CDS sequence

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ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCAACTTTTCCTTCGGATCATCCCCTTC
CCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACGTCCAATCCTTCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCT
CTTCCTCTTTCTCCACCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCGCAGCAACTTCAGCTTCG
TCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCCTCGTCAGCAAACTCCTCTGCTTCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTC
CGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTTACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCT
CATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCA
CCATTGTTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCCGCCGCTTCCGGTTCTGGTGTTTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATC
TTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTATCTTCGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCA
CTTCTCCATTCCAGAGCACCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCT
AAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCA
ATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCGTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCAC
CTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATTCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACT
ACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGG
TTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTTTGGCATCCGCTTCTACGGCTGCTACCACCACAT
CCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTTTCTTCTACACCAAAA
TTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGA
GTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCG
AAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGGTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGACGAGGCTGCATCTACA
AGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACT
TGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTA
TTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTGTGGATGTCTTAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MSGFGFGSSTSQSSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSAS
SLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSASLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSA
PLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLS
KTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPFFSVPAFSSSSSAAT
TLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPK
LPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAAST
RDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS

Cucsat.G18283 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome