; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G18548 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G18548
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationctg3379:640077..641974
RNA-Seq ExpressionCucsat.G18548
SyntenyCucsat.G18548
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAF7148267.1 hypothetical protein RHSIM_Rhsim03G0129000 [Rhododendron simsii]1.81e-88100Show/hide
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XP_004144630.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucumis sativus]8.89e-89100Show/hide
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XP_014518151.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Vigna radiata var. radiata]2.55e-8899.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CPB7 40S ribosomal protein S15a-14.30e-89100Show/hide
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A0A5A7SSH5 40S ribosomal protein S15a-14.30e-89100Show/hide
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A0A6A4L076 Uncharacterized protein (Fragment)8.69e-8999.23Show/hide
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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-11.23e-8899.23Show/hide
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Q9SBL9 Wrp15a4.30e-89100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-36.2e-6490Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-12.9e-6996.92Show/hide
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Q00332 40S ribosomal protein S15a8.4e-6996.15Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a7.1e-6895.38Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-43.8e-6996.92Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A2.1e-7096.92Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A2.1e-7096.92Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein4.4e-6590Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D2.7e-7096.92Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein2.1e-7096.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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