; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G18605 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G18605
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionprotein TIFY 5A-like
Genome locationctg3379:2004125..2005229
RNA-Seq ExpressionCucsat.G18605
SyntenyCucsat.G18605
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR018467 - CO/COL/TOC1, conserved site
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019513.1 Protein TIFY 5A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.69e-3668.91Show/hide
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A0A0A0LX13 Uncharacterized protein1.14e-7298.32Show/hide
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A0A1S3BA64 protein TIFY 5A-like1.16e-5483.47Show/hide
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A0A6J1CG02 protein TIFY 5A-like1.87e-1851.3Show/hide
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A0A6J1EN30 protein TIFY 5A-like1.42e-3568.07Show/hide
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A0A6J1KQP6 protein TIFY 5A-like4.74e-3265.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LBM2 Protein TIFY 5A7.8e-0538.76Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30135.1 jasmonate-zim-domain protein 85.6e-0638.76Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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