; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G18873 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G18873
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionribokinase isoform X1
Genome locationctg3419:615488..618699
RNA-Seq ExpressionCucsat.G18873
SyntenyCucsat.G18873
Gene Ontology termsGO:0019252 - starch biosynthetic process (biological process)
GO:0044281 - small molecule metabolic process (biological process)
GO:0046835 - carbohydrate phosphorylation (biological process)
GO:0016773 - phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor (molecular function)
GO:0019200 - carbohydrate kinase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011611 - Carbohydrate kinase PfkB
IPR029056 - Ribokinase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037911.1 ribokinase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]7.86e-7393.98Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPLPPLLSSNKL  HSSPT +L SKSIRPTMSSSTTSS SISFPENRVVLGVG+V+VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVS
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVS
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVS

XP_004152009.1 ribokinase isoform X1 [Cucumis sativus]8.38e-91100Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

XP_008447353.1 PREDICTED: ribokinase isoform X1 [Cucumis melo]1.90e-8193.96Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPLPPLLSSNKL  HSSPT +L SKSIRPTMSSSTTSS SISFPENRVVLGVG+V+VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVV+EGGISPFTYIIVDNKT
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

XP_031738611.1 ribokinase isoform X2 [Cucumis sativus]8.77e-92100Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

XP_038888957.1 ribokinase isoform X1 [Benincasa hispida]3.31e-7486.58Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPL   +SS  L LHSSPTF+ FSKS RP MSSST+SS  IS PENRVVLGVG+ +VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADG+DTSFLVVSEGG SPFTYIIVDNKT
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BH76 ribokinase isoform X26.74e-6796.61Show/hide
Query:  MSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLV
        MSSSTTSS SISFPENRVVLGVG+V+VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLV
Subjt:  MSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLV

Query:  VSEGGISPFTYIIVDNKT
        V+EGGISPFTYIIVDNKT
Subjt:  VSEGGISPFTYIIVDNKT

A0A1S3BH87 ribokinase isoform X19.22e-8293.96Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPLPPLLSSNKL  HSSPT +L SKSIRPTMSSSTTSS SISFPENRVVLGVG+V+VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVV+EGGISPFTYIIVDNKT
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

A0A5A7T8H5 Ribokinase isoform X13.80e-7393.98Show/hide
Query:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
        MTPLPPLLSSNKL  HSSPT +L SKSIRPTMSSSTTSS SISFPENRVVLGVG+V+VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT
Subjt:  MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLT

Query:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVS
        PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVS
Subjt:  PRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVS

A0A6J1HGB8 ribokinase-like isoform X25.36e-6778.67Show/hide
Query:  PLPPLLSSNKL---PLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGL
        PLP  +SS  L   PL  +  F+      RP +SSST+SS SIS P+NRVVLGVGS  VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGL
Subjt:  PLPPLLSSNKL---PLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGL

Query:  TPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        TPRIISKVADDSQGRSI+EELEADG+DTSFLVV+EGG+SPFTYIIVDNKT
Subjt:  TPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

A0A6J1HH81 ribokinase-like isoform X15.80e-6778.67Show/hide
Query:  PLPPLLSSNKL---PLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGL
        PLP  +SS  L   PL  +  F+      RP +SSST+SS SIS P+NRVVLGVGS  VDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGL
Subjt:  PLPPLLSSNKL---PLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGL

Query:  TPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        TPRIISKVADDSQGRSI+EELEADG+DTSFLVV+EGG+SPFTYIIVDNKT
Subjt:  TPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
E9AD19 Ribokinase4.0e-0630Show/hide
Query:  VLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        +L VGS  +D++  V   P   + + + S     GG   N   +A RLG    ++S V  D  G   I+ELE +GV T++++ +    +    I+VD K+
Subjt:  VLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

P36945 Ribokinase2.0e-0531.33Show/hide
Query:  RVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFL
        R +  +GS ++D +      P   + +  TS +   GG   N   +AARLG    ++ KV DD  G +I+  L+A+GV T ++
Subjt:  RVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFL

P50053 Ketohexokinase5.2e-0629.41Show/hide
Query:  ENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIV
        E + +L VG V +D ++ V  YP  D +IR  S + Q GGN  N+ T  + LG     +  +A       ++ +    GVD S +     G +P +  I+
Subjt:  ENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIV

Query:  DN
        +N
Subjt:  DN

P97328 Ketohexokinase7.5e-0529.41Show/hide
Query:  ENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIV
        E + +L VG V +D +  V  YP  D   R  S + Q GGN  N+ T  + LG     +  +A       ++ +    GVD S +     G +P +  IV
Subjt:  ENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIV

Query:  DN
        +N
Subjt:  DN

Q5RD71 Ketohexokinase7.5e-0529.41Show/hide
Query:  ENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIV
        E + +L VG V +D ++ V  YP  D +IR  S + Q GGN  N+ T  + LG     +  +A       ++ +    GVD S +     G +P +  I+
Subjt:  ENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIV

Query:  DN
        +N
Subjt:  DN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G28706.1 pfkB-like carbohydrate kinase family protein8.2e-3960.54Show/hide
Query:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR
        P  PL S++ + L +S  F       R  MSSS++       P+N +VLG G +AVDFLA V SYP  DDKIR+TSLKVQGGGN  NALT AARLGL  R
Subjt:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR

Query:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        +ISKVA+DSQG+ ++EELEADGVDTSF+VVS+ G SPFTYI+VDN+T
Subjt:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

AT4G28706.2 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.1e-3961.22Show/hide
Query:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR
        P  PL S++ + L +S  F     S R  MSSS++       P+N +VLG G +AVDFLA V SYP  DDKIR+TSLKVQGGGN  NALT AARLGL  R
Subjt:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR

Query:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        +ISKVA+DSQG+ ++EELEADGVDTSF+VVS+ G SPFTYI+VDN+T
Subjt:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

AT4G28706.3 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.1e-3961.22Show/hide
Query:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR
        P  PL S++ + L +S  F     S R  MSSS++       P+N +VLG G +AVDFLA V SYP  DDKIR+TSLKVQGGGN  NALT AARLGL  R
Subjt:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR

Query:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        +ISKVA+DSQG+ ++EELEADGVDTSF+VVS+ G SPFTYI+VDN+T
Subjt:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

AT4G28706.4 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.1e-3961.22Show/hide
Query:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR
        P  PL S++ + L +S  F     S R  MSSS++       P+N +VLG G +AVDFLA V SYP  DDKIR+TSLKVQGGGN  NALT AARLGL  R
Subjt:  PLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPR

Query:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT
        +ISKVA+DSQG+ ++EELEADGVDTSF+VVS+ G SPFTYI+VDN+T
Subjt:  IISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT

AT5G43910.2 pfkB-like carbohydrate kinase family protein1.1e-3059.81Show/hide
Query:  SFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTY
        + P   +VLG G + +D+L  VAS+P PD KIR TS KVQGGGN GNALT  ARLGL  RI++KVADDS GR ++EELE+ GVDTSF + ++ G S F Y
Subjt:  SFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADDSQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTY

Query:  IIVDNKT
        +IVDN+T
Subjt:  IIVDNKT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGCCATTGCCACCTCTCCTTTCAAGCAATAAGCTTCCTCTTCATTCTTCTCCAACCTTTATTCTCTTCTCTAAATCAATCAGGCCGACAATGTCATCGTCAACCAC
CTCCTCGCGTTCCATTTCATTTCCTGAAAATCGAGTGGTTCTTGGTGTTGGTTCTGTTGCTGTTGATTTTTTGGCGGCAGTGGCTTCTTATCCAAATCCTGATGACAAAA
TTAGAACCACGAGCTTAAAGGTACAAGGTGGAGGAAATGTAGGAAATGCTTTAACTTCTGCAGCTCGGTTGGGTTTAACACCAAGGATAATTTCCAAGGTTGCAGATGAT
AGTCAAGGAAGGAGCATAATTGAGGAGCTAGAAGCCGATGGCGTAGATACATCTTTTCTTGTGGTTTCTGAAGGGGGCATTTCACCATTTACCTATATTATTGTGGATAA
TAAAACG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACGCCATTGCCACCTCTCCTTTCAAGCAATAAGCTTCCTCTTCATTCTTCTCCAACCTTTATTCTCTTCTCTAAATCAATCAGGCCGACAATGTCATCGTCAACCAC
CTCCTCGCGTTCCATTTCATTTCCTGAAAATCGAGTGGTTCTTGGTGTTGGTTCTGTTGCTGTTGATTTTTTGGCGGCAGTGGCTTCTTATCCAAATCCTGATGACAAAA
TTAGAACCACGAGCTTAAAGGTACAAGGTGGAGGAAATGTAGGAAATGCTTTAACTTCTGCAGCTCGGTTGGGTTTAACACCAAGGATAATTTCCAAGGTTGCAGATGAT
AGTCAAGGAAGGAGCATAATTGAGGAGCTAGAAGCCGATGGCGTAGATACATCTTTTCTTGTGGTTTCTGAAGGGGGCATTTCACCATTTACCTATATTATTGTGGATAA
TAAAACG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTPLPPLLSSNKLPLHSSPTFILFSKSIRPTMSSSTTSSRSISFPENRVVLGVGSVAVDFLAAVASYPNPDDKIRTTSLKVQGGGNVGNALTSAARLGLTPRIISKVADD
SQGRSIIEELEADGVDTSFLVVSEGGISPFTYIIVDNKT