; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G18904 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G18904
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionTyrosine decarboxylase
Genome locationctg3419:710003..712994
RNA-Seq ExpressionCucsat.G18904
SyntenyCucsat.G18904
Gene Ontology termsGO:0006587 - serotonin biosynthetic process from tryptophan (biological process)
GO:0030170 - pyridoxal phosphate binding (molecular function)
GO:0036469 - L-tryptophan decarboxylase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002129 - Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase
IPR010977 - Aromatic-L-amino-acid decarboxylase
IPR015421 - Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain
IPR015424 - Pyridoxal phosphate-dependent transferase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152005.1 tyrosine decarboxylase 1 isoform X1 [Cucumis sativus]1.34e-81100Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

XP_008447363.1 PREDICTED: tyrosine decarboxylase 1 isoform X1 [Cucumis melo]9.52e-7997.62Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLRE AHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYL+NLLPESAP NPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

XP_008447366.1 PREDICTED: tyrosine decarboxylase 1 isoform X2 [Cucumis melo]2.80e-7997.62Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLRE AHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYL+NLLPESAP NPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

XP_022963463.1 tyrosine decarboxylase 1 isoform X2 [Cucurbita moschata]9.28e-7996.03Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYK IEDFPVLSQV+PGYL+NLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSP+YFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSW+TSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

XP_031738197.1 tyrosine decarboxylase 1 isoform X3 [Cucumis sativus]1.27e-82100Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBH7 Uncharacterized protein9.17e-82100Show/hide
Query:  DNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEML
        DNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEML
Subjt:  DNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEML

Query:  SAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        SAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  SAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

A0A1S3BGQ0 tyrosine decarboxylase 1 isoform X14.61e-7997.62Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLRE AHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYL+NLLPESAP NPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

A0A1S3BHV9 tyrosine decarboxylase 1 isoform X21.35e-7997.62Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLRE AHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYL+NLLPESAP NPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

A0A6J1HFB9 tyrosine decarboxylase 1 isoform X16.35e-7996.03Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYK IEDFPVLSQV+PGYL+NLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSP+YFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSW+TSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

A0A6J1HHV8 tyrosine decarboxylase 1 isoform X24.49e-7996.03Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYK IEDFPVLSQV+PGYL+NLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSP+YFAYYPSNSSIAGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        LSAAFNVIGFSW+TSPAATELEMIVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A2H5AIY2 Tyrosine decarboxylase 25.1e-5577.78Show/hide
Query:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM
        M+  LKPMDAEQLRE+AHKMVDFIADYYK+IE FPVLSQV+PGYL++LLP+SAP +PESL+ VL+D+++KI PGVTHWQSPNYFAYYPSNSS+AGFLGEM
Subjt:  MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEM

Query:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        +SA FN++GF+W+ SPAATELE+IVL
Subjt:  LSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

O82415 Tyrosine decarboxylase2.8e-4565.83Show/hide
Query:  PMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAAFN
        P+D ++ R   H ++DF+ADYYKN+E +PV SQVEPGYL+  LPESAP NPES++++L+DV   I PG+THWQSPNYFAY+PS+ SIAGFLGEMLS  FN
Subjt:  PMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAAFN

Query:  VIGFSWVTSPAATELEMIVL
        V+GF+W++SPAATELE IV+
Subjt:  VIGFSWVTSPAATELEMIVL

Q7XHL3 Tryptophan decarboxylase 24.8e-5377.87Show/hide
Query:  LKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAA
        L+PMDAEQLRE  H+MVDF+ADYYK+IE FPVLSQV+PGYL+ +LP+SAP  P++L S+ DD+Q+KI PGVTHWQSPNYFAYYPSNSS AGFLGEMLSAA
Subjt:  LKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAA

Query:  FNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        FN++GFSW+TSPAATELE+IVL
Subjt:  FNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

Q8RY79 Phenylacetaldehyde synthase1.8e-5279.51Show/hide
Query:  LKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAA
        LKPMD+EQLRE+ H MVDFIADYYK IEDFPVLSQV+PGYL  LLP+SAP +PE+L  VLDDV+ KI PGVTHWQSP++FAYYPSNSS+AGFLGEMLSA 
Subjt:  LKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAA

Query:  FNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
          ++GFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  FNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

Q9M0G4 Tyrosine decarboxylase 21.8e-4769.29Show/hide
Query:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE
        ++KPMD+E LRE  H MVDFIADYYKN+    +DFPVLSQV+PGYL+++LP+SAP  PESL+ +LDDV KKI PG+THWQSP+YFAYY S++S+AGFLGE
Subjt:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE

Query:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        ML+A  +V+GF+W+TSPAATELE+IVL
Subjt:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20340.1 Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein1.3e-5379.51Show/hide
Query:  LKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAA
        LKPMD+EQLRE+ H MVDFIADYYK IEDFPVLSQV+PGYL  LLP+SAP +PE+L  VLDDV+ KI PGVTHWQSP++FAYYPSNSS+AGFLGEMLSA 
Subjt:  LKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAA

Query:  FNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
          ++GFSWVTSPAATELEMIVL
Subjt:  FNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

AT4G28680.1 L-tyrosine decarboxylase1.3e-4869.29Show/hide
Query:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE
        ++KPMD+E LRE  H MVDFIADYYKN+    +DFPVLSQV+PGYL+++LP+SAP  PESL+ +LDDV KKI PG+THWQSP+YFAYY S++S+AGFLGE
Subjt:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE

Query:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        ML+A  +V+GF+W+TSPAATELE+IVL
Subjt:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

AT4G28680.2 L-tyrosine decarboxylase1.3e-4869.29Show/hide
Query:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE
        ++KPMD+E LRE  H MVDFIADYYKN+    +DFPVLSQV+PGYL+++LP+SAP  PESL+ +LDDV KKI PG+THWQSP+YFAYY S++S+AGFLGE
Subjt:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE

Query:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        ML+A  +V+GF+W+TSPAATELE+IVL
Subjt:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

AT4G28680.3 L-tyrosine decarboxylase1.3e-4869.29Show/hide
Query:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE
        ++KPMD+E LRE  H MVDFIADYYKN+    +DFPVLSQV+PGYL+++LP+SAP  PESL+ +LDDV KKI PG+THWQSP+YFAYY S++S+AGFLGE
Subjt:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE

Query:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        ML+A  +V+GF+W+TSPAATELE+IVL
Subjt:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL

AT4G28680.4 L-tyrosine decarboxylase1.3e-4869.29Show/hide
Query:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE
        ++KPMD+E LRE  H MVDFIADYYKN+    +DFPVLSQV+PGYL+++LP+SAP  PESL+ +LDDV KKI PG+THWQSP+YFAYY S++S+AGFLGE
Subjt:  ELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNI----EDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGE

Query:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL
        ML+A  +V+GF+W+TSPAATELE+IVL
Subjt:  MLSAAFNVIGFSWVTSPAATELEMIVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAATGAATTGAAGCCGATGGATGCTGAGCAACTCAGAGAACATGCTCATAAAATGGTGGATTTCATTGCTGATTATTACAAAAACATCGAGGATTTCCCCGTGCT
CAGCCAAGTAGAGCCTGGTTATCTTCAAAATCTTCTACCAGAATCTGCACCTCTTAATCCAGAATCTCTGCAAAGTGTTCTTGATGATGTCCAGAAAAAGATTTTTCCGG
GTGTAACACATTGGCAGAGTCCCAACTACTTTGCTTATTATCCTTCTAACAGTAGCATTGCTGGATTTCTTGGGGAAATGCTCAGTGCAGCTTTCAATGTGATCGGTTTT
AGTTGGGTAACTTCTCCAGCTGCTACAGAACTTGAGATGATAGTTCTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATAATGAATTGAAGCCGATGGATGCTGAGCAACTCAGAGAACATGCTCATAAAATGGTGGATTTCATTGCTGATTATTACAAAAACATCGAGGATTTCCCCGTGCT
CAGCCAAGTAGAGCCTGGTTATCTTCAAAATCTTCTACCAGAATCTGCACCTCTTAATCCAGAATCTCTGCAAAGTGTTCTTGATGATGTCCAGAAAAAGATTTTTCCGG
GTGTAACACATTGGCAGAGTCCCAACTACTTTGCTTATTATCCTTCTAACAGTAGCATTGCTGGATTTCTTGGGGAAATGCTCAGTGCAGCTTTCAATGTGATCGGTTTT
AGTTGGGTAACTTCTCCAGCTGCTACAGAACTTGAGATGATAGTTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDNELKPMDAEQLREHAHKMVDFIADYYKNIEDFPVLSQVEPGYLQNLLPESAPLNPESLQSVLDDVQKKIFPGVTHWQSPNYFAYYPSNSSIAGFLGEMLSAAFNVIGF
SWVTSPAATELEMIVL