; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19486 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19486
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationctg4:1077555..1079854
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19486
SyntenyCucsat.G19486
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.27e-22987.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKX6 Uncharacterized protein1.16e-264100Show/hide
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A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like8.78e-26097.98Show/hide
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A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like8.78e-26097.98Show/hide
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A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.24e-22988.18Show/hide
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A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.19e-22687.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 288.9e-2527.48Show/hide
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        D+
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 311.3e-1033.33Show/hide
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         C FGDKCHFAHG+ EL
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Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 562.4e-4634.55Show/hide
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        N   ++ I  +FFKT++C KF+ G C    +CNFAHG+E++R+PPPNWQEIV   E+       +    +                         K + C
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Query:  KCHFAHGQSELQLYIGR----EGEVSTAALNVKPLIVAMEA---SSSLTTNVVPSSAL---------------PEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLD
        KCHFAHG +EL  Y G     +   + A  + K  +V+ +A   +++ +T V+P + +                 GQ +  + KWKGP KI+RIY DW+D
Subjt:  KCHFAHGQSELQLYIGR----EGEVSTAALNVKPLIVAMEA---SSSLTTNVVPSSAL---------------PEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLD

Query:  D
        +
Subjt:  D

Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 127.0e-4633.33Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  +   
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---

Query:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
             G++G     +      N K L          V   A +S  T V    A     +KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 396.7e-8150.59Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +     PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T       + +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYI

Query:  EPSRVTSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTNVVPSSAL-
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T     SS L 
Subjt:  EPSRVTSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTNVVPSSAL-

Query:  PEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
         EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein5.0e-4733.33Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  +   
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLY---

Query:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
             G++G     +      N K L          V   A +S  T V    A     +KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  ----IGREG-----EVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT1G66810.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein1.1e-0632Show/hide
Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ
        R++  R     +IS+ + G   +N    +S ++ S+++S SVS +     ++  G          R    KT+LC KW+ TG C +GD C FAHG  EL+
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein2.1e-0526.17Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R    + +                       K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein6.3e-2627.48Show/hide
Query:  SEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGASCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQK
        +E++ S   + ++    S  +   +  +  I   FFKT++C KF+ G C  + +SC+FAH  E++R    PPPNWQE V                     
Subjt:  SEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGASCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQK

Query:  MKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHC
                                       ++ R RES A+S+G  G                     +V+  L++        WKT++C KW+ TG+C
Subjt:  MKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHC

Query:  PFGDKCHFAHGQSELQLYIG------------------REGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLD
        PFG  CHFAHG SEL  + G                  + G+V T    V P + +   SS++T         P G    +  KWKGP KI+R+Y DW+D
Subjt:  PFGDKCHFAHGQSELQLYIG------------------REGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLD

Query:  DL
        D+
Subjt:  DL

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein4.8e-8250.59Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +     PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T       + +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYI

Query:  EPSRVTSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTNVVPSSAL-
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T     SS L 
Subjt:  EPSRVTSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTTNVVPSSAL-

Query:  PEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
         EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  PEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAATGATATGAGAGCCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCCTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCTAGGAATGATCCATT
TGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTAAATTCTA
GGGGGCAACCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATCTTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGGAATGGTGCTAGTTGT
AACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAA
GATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAGTGCCCCTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATT
CAGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGAACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAATGATTCTTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGTAACTTCTTGT
TCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGGAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGACAAGTG
CCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTCAACGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAGGCATCTT
CGAGTTTGACAACCAATGTAGTTCCATCCTCTGCCTTACCGGAGGGCCAGGAGAAGCCGAGTTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCTGAT
TGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTTTCAATGATATGAGAGCCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCCTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCTAGGAATGATCCATT
TGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTAAATTCTA
GGGGGCAACCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATCTTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGGAATGGTGCTAGTTGT
AACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAA
GATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAGTGCCCCTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATT
CAGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGAACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAATGATTCTTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGTAACTTCTTGT
TCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGGAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGACAAGTG
CCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTCAACGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAGGCATCTT
CGAGTTTGACAACCAATGTAGTTCCATCCTCTGCCTTACCGGAGGGCCAGGAGAAGCCGAGTTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCTGAT
TGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDMRASVIPPPLHSYGSNGDASGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGQPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASC
NFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGNDSSSYIEPSRVTSC
SVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTNVVPSSALPEGQEKPSLLKWKGPKKINRIYAD
WLDDLPLSPSSTSKMEG