; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19527 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19527
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionReticulon-like protein
Genome locationctg4:1731404..1737354
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19527
SyntenyCucsat.G19527
Gene Ontology termsGO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003388 - Reticulon
IPR044647 - Reticulon-like protein B17/18/21


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063564.1 reticulon-like protein B21 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]9.72e-29895.3Show/hide
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        KRLVPF+N+LLQNLKALF GDPSATMK+GV LFVLA+WGSFITLWNV+K GFIGVFTLPKLITHGE WL LCGSSWKLCSHK+ V +A+FF+VW+FSSTL
Subjt:  KRLVPFVNELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTL

Query:  YRVWAAFIVLVSFRYYQESPERDVWVKNGEVASRNKTMSTSSKLKKQY
        YRVWA F V VSFRYYQE       VKNGEVA +N T+S SSKLK+QY
Subjt:  YRVWAAFIVLVSFRYYQESPERDVWVKNGEVASRNKTMSTSSKLKKQY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q56X72 Reticulon-like protein B217.6e-5347.71Show/hide
Query:  FPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFV
        F  ++ KLQ+L+DL+MWRD SRS LVFG G  +II S +  ++N S IS++++MGL+YL  +FV  S+  R    +   + + V EED+ R  + ++P++
Subjt:  FPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFV

Query:  NELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSST
        NE L  L+ALF GDPS T+K+GV+LFVLA+ GS ITLWN+ K GF+G FT+PK+          +G  W++    +W+ C+HK+ V +A+F LVWN SS 
Subjt:  NELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSST

Query:  LYRVWAAFIVLVSFRYYQ
          RVWAAF++LV+FRYYQ
Subjt:  LYRVWAAFIVLVSFRYYQ

Q6DR04 Reticulon-like protein B176.9e-3034.91Show/hide
Query:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK
        + + DL+MWRD ++S L FG G L  + SCF K +N S+ S +S++GL+ L   F+ +++  R+   +       V E+D++R A+R++P  N  +    
Subjt:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK

Query:  ALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF
         LF G+PS T+KV   L + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +   H +           G +W +CSHK+ +  +     WN +S   R++A F
Subjt:  ALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF

Query:  IVLVSFRYYQES
        I+LV FRY +++
Subjt:  IVLVSFRYYQES

Q8LDS3 Reticulon-like protein B185.7e-2426.45Show/hide
Query:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNSSPNKPVQVSGEKIERNSTRKKTDQSRKSAVGLTKPPTNGIGKTSSEKSFKESNECREKVISSSTSQDFFDAFEEEI
        SSP +  E    SP+P R+ R+  S    ++ +   +    ++ K  Q             NG+  + S ++F+ S    E ++ +  + +      +E 
Subjt:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNSSPNKPVQVSGEKIERNSTRKKTDQSRKSAVGLTKPPTNGIGKTSSEKSFKESNECREKVISSSTSQDFFDAFEEEI

Query:  EKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISLISLISHMGLLYLTT
        ++     K++   +++K     ++A   P + Q             + + DLIMWRD ++S L FG G +  + +CF  K  N S+ S IS++GLL+L  
Subjt:  EKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISLISLISHMGLLYLTT

Query:  IFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHW
         F+ +++  R++  +     L + E+D++R A+R++P  N  +     LF G+P+ T+KV   + + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +     
Subjt:  IFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHW

Query:  LKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD
        L     C       +W +C+HK+ V  +     WN +S   R  A FI++V  RY +++ + D
Subjt:  LKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20590.1 Reticulon family protein4.9e-3134.91Show/hide
Query:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK
        + + DL+MWRD ++S L FG G L  + SCF K +N S+ S +S++GL+ L   F+ +++  R+   +       V E+D++R A+R++P  N  +    
Subjt:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK

Query:  ALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF
         LF G+PS T+KV   L + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +   H +           G +W +CSHK+ +  +     WN +S   R++A F
Subjt:  ALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF

Query:  IVLVSFRYYQES
        I+LV FRY +++
Subjt:  IVLVSFRYYQES

AT2G20590.2 Reticulon family protein1.1e-2236.08Show/hide
Query:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK
        + + DL+MWRD ++S L FG G L  + SCF K +N S+ S +S++GL+ L   F+ +++  R+   +       V E+D++R A+R++P  N  +    
Subjt:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK

Query:  ALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCG
         LF G+PS T+KV   L + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +   H +   G
Subjt:  ALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCG

AT4G28430.1 Reticulon family protein4.0e-2526.45Show/hide
Query:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNSSPNKPVQVSGEKIERNSTRKKTDQSRKSAVGLTKPPTNGIGKTSSEKSFKESNECREKVISSSTSQDFFDAFEEEI
        SSP +  E    SP+P R+ R+  S    ++ +   +    ++ K  Q             NG+  + S ++F+ S    E ++ +  + +      +E 
Subjt:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNSSPNKPVQVSGEKIERNSTRKKTDQSRKSAVGLTKPPTNGIGKTSSEKSFKESNECREKVISSSTSQDFFDAFEEEI

Query:  EKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISLISLISHMGLLYLTT
        ++     K++   +++K     ++A   P + Q             + + DLIMWRD ++S L FG G +  + +CF  K  N S+ S IS++GLL+L  
Subjt:  EKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISLISLISHMGLLYLTT

Query:  IFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHW
         F+ +++  R++  +     L + E+D++R A+R++P  N  +     LF G+P+ T+KV   + + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +     
Subjt:  IFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHW

Query:  LKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD
        L     C       +W +C+HK+ V  +     WN +S   R  A FI++V  RY +++ + D
Subjt:  LKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD

AT5G58000.1 Reticulon family protein5.4e-5447.71Show/hide
Query:  FPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFV
        F  ++ KLQ+L+DL+MWRD SRS LVFG G  +II S +  ++N S IS++++MGL+YL  +FV  S+  R    +   + + V EED+ R  + ++P++
Subjt:  FPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFV

Query:  NELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSST
        NE L  L+ALF GDPS T+K+GV+LFVLA+ GS ITLWN+ K GF+G FT+PK+          +G  W++    +W+ C+HK+ V +A+F LVWN SS 
Subjt:  NELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSST

Query:  LYRVWAAFIVLVSFRYYQ
          RVWAAF++LV+FRYYQ
Subjt:  LYRVWAAFIVLVSFRYYQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTTAAGCCGGCGGAGAGCGGCGGTGGCGGCCAAAGGGAACGTGGTAGCTGGGTCTGTGTGGGAGAGTAGAATCAGGTTCGATGAAGTCAGAGGTGGGATTAAGGT
TTTTAATGGAGACGATGAAAATGTTGAATGTGGGATTCCGACAACCGCCGCTTCCGCGGGCAGCGGAAGGAGGAAGACGTGGAAATCTGATGAGGGTTTTAACCCGATTC
TCATTGCGGAGGAAAAACCAGAGTCGTCGCCCAGTAGCGGCGATGAACAGAGTCGGAAAAGTCCGACTCCTTCACGGAGATTGAGATCCAACAGTAGTCCGAACAAGCCA
GTTCAAGTTTCCGGCGAGAAAATAGAGAGAAACTCAACGAGGAAGAAGACTGATCAATCTCGTAAATCGGCTGTTGGGCTTACCAAACCACCGACGAATGGAATCGGAAA
AACCTCGTCGGAGAAAAGTTTCAAAGAGTCAAACGAATGCAGAGAGAAAGTGATTTCGTCTTCCACGTCTCAAGATTTCTTCGATGCATTTGAAGAAGAGATTGAGAAAG
AAAGCTTCGACGTTAAGGAAATCAATTTACCAGAACGGAAGAAAATCATTGCACAAACTTTCCCGGGAAACAAACAGAAATTACAGACATTAATGGATTTGATAATGTGG
AGAGATTTTTCAAGATCCGGTCTGGTTTTTGGAGTGGGAAATTTGGTTATAATCCTCTCTTGTTTTATCAAAAACATCAATATCAGCCTTATCAGTTTGATTTCGCATAT
GGGTCTTCTTTATCTGACTACCATTTTCGTCCATAGTTCCATTTTTGGGAGGAGAAAAAGGATTGATTCTAATGATGAAAATTTGGTGGTTGAAGAAGAAGATATGATCC
GATTTGCTAAACGGTTAGTTCCTTTTGTGAATGAATTGCTGCAAAATCTCAAGGCTCTGTTCCGTGGAGATCCCTCTGCCACCATGAAGGTGGGTGTGTTGCTGTTTGTA
TTGGCAAAGTGGGGTAGCTTCATAACCCTTTGGAATGTCCTCAAAATTGGATTCATCGGGGTTTTCACACTGCCCAAATTAATTACCCACGGTGAACACTGGTTGAAACT
TTGTGGGAGTTCTTGGAAGTTATGTTCCCACAAGAGAGGTGTGTTCATCGCCATCTTTTTTCTCGTATGGAATTTCTCATCGACTCTATATCGCGTATGGGCAGCTTTCA
TAGTGTTGGTTAGCTTTCGGTACTACCAGGAGTCTCCGGAGAGAGATGTTTGGGTTAAAAATGGAGAAGTAGCTTCAAGAAACAAGACCATGTCGACGAGTTCAAAGCTC
AAGAAACAATATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTTAAGCCGGCGGAGAGCGGCGGTGGCGGCCAAAGGGAACGTGGTAGCTGGGTCTGTGTGGGAGAGTAGAATCAGGTTCGATGAAGTCAGAGGTGGGATTAAGGT
TTTTAATGGAGACGATGAAAATGTTGAATGTGGGATTCCGACAACCGCCGCTTCCGCGGGCAGCGGAAGGAGGAAGACGTGGAAATCTGATGAGGGTTTTAACCCGATTC
TCATTGCGGAGGAAAAACCAGAGTCGTCGCCCAGTAGCGGCGATGAACAGAGTCGGAAAAGTCCGACTCCTTCACGGAGATTGAGATCCAACAGTAGTCCGAACAAGCCA
GTTCAAGTTTCCGGCGAGAAAATAGAGAGAAACTCAACGAGGAAGAAGACTGATCAATCTCGTAAATCGGCTGTTGGGCTTACCAAACCACCGACGAATGGAATCGGAAA
AACCTCGTCGGAGAAAAGTTTCAAAGAGTCAAACGAATGCAGAGAGAAAGTGATTTCGTCTTCCACGTCTCAAGATTTCTTCGATGCATTTGAAGAAGAGATTGAGAAAG
AAAGCTTCGACGTTAAGGAAATCAATTTACCAGAACGGAAGAAAATCATTGCACAAACTTTCCCGGGAAACAAACAGAAATTACAGACATTAATGGATTTGATAATGTGG
AGAGATTTTTCAAGATCCGGTCTGGTTTTTGGAGTGGGAAATTTGGTTATAATCCTCTCTTGTTTTATCAAAAACATCAATATCAGCCTTATCAGTTTGATTTCGCATAT
GGGTCTTCTTTATCTGACTACCATTTTCGTCCATAGTTCCATTTTTGGGAGGAGAAAAAGGATTGATTCTAATGATGAAAATTTGGTGGTTGAAGAAGAAGATATGATCC
GATTTGCTAAACGGTTAGTTCCTTTTGTGAATGAATTGCTGCAAAATCTCAAGGCTCTGTTCCGTGGAGATCCCTCTGCCACCATGAAGGTGGGTGTGTTGCTGTTTGTA
TTGGCAAAGTGGGGTAGCTTCATAACCCTTTGGAATGTCCTCAAAATTGGATTCATCGGGGTTTTCACACTGCCCAAATTAATTACCCACGGTGAACACTGGTTGAAACT
TTGTGGGAGTTCTTGGAAGTTATGTTCCCACAAGAGAGGTGTGTTCATCGCCATCTTTTTTCTCGTATGGAATTTCTCATCGACTCTATATCGCGTATGGGCAGCTTTCA
TAGTGTTGGTTAGCTTTCGGTACTACCAGGAGTCTCCGGAGAGAGATGTTTGGGTTAAAAATGGAGAAGTAGCTTCAAGAAACAAGACCATGTCGACGAGTTCAAAGCTC
AAGAAACAATATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLSRRRAAVAAKGNVVAGSVWESRIRFDEVRGGIKVFNGDDENVECGIPTTAASAGSGRRKTWKSDEGFNPILIAEEKPESSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNSSPNKP
VQVSGEKIERNSTRKKTDQSRKSAVGLTKPPTNGIGKTSSEKSFKESNECREKVISSSTSQDFFDAFEEEIEKESFDVKEINLPERKKIIAQTFPGNKQKLQTLMDLIMW
RDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISLISLISHMGLLYLTTIFVHSSIFGRRKRIDSNDENLVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDPSATMKVGVLLFV
LAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFIAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERDVWVKNGEVASRNKTMSTSSKL
KKQY