; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19538 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19538
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionHistone H1-like
Genome locationctg4:1935911..1937293
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19538
SyntenyCucsat.G19538
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063593.1 histone H1-like [Cucumis melo var. makuwa]3.31e-12992.16Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKT+AKPKPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK A AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.25e-11384.76Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS       AAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKT+ KPKPKAVAKPK    AKSK VAKPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAA K AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_004139246.1 histone H1 [Cucumis sativus]9.14e-14599.24Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKT+AKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKKVAPKPKPAA KAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_008456174.1 PREDICTED: histone H1-like [Cucumis melo]5.46e-12891.79Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKT+AK KPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK A AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]1.50e-11284.39Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS       AAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKT+ KPKPKAVAKPK  + AKSK VAKPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAA K AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLA4 H15 domain-containing protein2.66e-12790.53Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
        HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKT+AKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAA

Query:  EKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKKVAPKPKPAA                       KA KVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A1S3C278 histone H1-like2.64e-12891.79Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKT+AK KPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK A AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A5D3D4H1 Histone H1-like1.60e-12992.16Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPAAA   VAQPAENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPAAA---VAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAA  PV  KKPVSSKLKA ASIKK AVAK KAKT+AKPKPKAVAKPKPKTV KSKTVAKPKTAAK
Subjt:  LLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKA-ASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK A AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1G2W2 histone H1-like7.27e-11384.39Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  AAVAQP ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS       AAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKT+ KPKPKAVAKPK  + AKSK VAKPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAA K AKVAKTLSRTSPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1KEC3 histone H1-like7.98e-11082.9Show/hide
Query:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL
        MSSAAD V  SDAPA  A VA P ENDSK+KKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MSSAADSVIISDAPA--AAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--
        LVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARS       AAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAK KAKT+ KPKPK VAKPK    AKSK V KPK  A  
Subjt:  LVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAA-SIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAA--

Query:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K KAAEKVKKVAPKPKPAA K AKVAKTLSR SPGK+AAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H11.6e-2949.61Show/hide
Query:  VAQPAENDSKAKKAAASKASKAK--KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVK
        + +P   + +  KA   K  KAK  KP  A K R+  +HP + +MI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLP+NF+KLLL +LKK VA+ KL+KVK
Subjt:  VAQPAENDSKAKKAAASKASKAK--KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVK

Query:  NSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS-KAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KTVAKPKT-AAKTKAAEKVKKVA
         S+KL +A                AKKP  +K KA   K AA AKS KAK +AKPK KAV KPK  + AK+      K  AKPKT AAKTK      K  
Subjt:  NSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKS-KAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KTVAKPKT-AAKTKAAEKVKKVA

Query:  PKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
         KPK +  K AKVAKT  +T+PGK+ A   K  AKKV  K  K K+VKSP +KV  ++
Subjt:  PKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK

P23444 Histone H13.4e-3252.45Show/hide
Query:  ADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLK
        A  V  + AP    A  A  D+ A  AA + A+KAKK +  KK R+SPTH P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL V LK
Subjt:  ADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLK

Query:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAE
        KLVA  KL KVKNSYKL SA     K  AA   P T  K           K  A AK KAKT AK KP    KP  KPK V K KT AKPK  AK  A  
Subjt:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAE

Query:  KVKKVAPKPKPAAAKA--AKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K K    KPKP A KA  AK AKT ++ +PGK+ APA KA    +KK  T   P RK  +RK KK
Subjt:  KVKKVAPKPKPAAAKA--AKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P26569 Histone H1.21.7e-3150.72Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS    A    AAPV  K  V +K K      AAVA +KAK +A    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAAK 
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT

Query:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K     A  K K VA KPK A  + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P37218 Histone H13.5e-3750.88Show/hide
Query:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE
        + +  AA      E +  AK   A K +KAKKP+  +K  ++PTHPP+ +MI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL  LKK VA+E
Subjt:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE

Query:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVK---
        KLVKVKNSYKLPS       +  AAAA    KKP ++K K A+  KAAV K KAK +AK KP A AKP  K K  AK+K  AK K AAK K   K K   
Subjt:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKP--KPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVK---

Query:  ------KVAPKPKPAAAK--------------AAKVAKTLSRTSPGKRAAP-ATKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
              K A KPK A AK               AKVAKT +RT+P ++AAP AT AKK   KK   K VKSPA+K   ++ +K
Subjt:  ------KVAPKPKPAAAK--------------AAKVAKTLSRTSPGKRAAP-ATKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK

Q9M5W4 Histone H18.6e-3655.73Show/hide
Query:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAK---KAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPT--HPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLK
        ++D P +A   P   + K+K   KAAA K  K KK    AKK +S  T  HP F +MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLPSNFRKLLL HLK
Subjt:  ISDAPAAAVAQPAENDSKAK---KAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPT--HPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLK

Query:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKV
        KLVA+ KLVKVKNS+KLPSAR        AA AP  AKKP   K K A+  K       AK  AKPK K  AK   KT A +KTVAK   AAK KA    
Subjt:  KLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKV

Query:  KKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARK
         K A KPK  AAK AKVAKT +  SPGK+       K V  KK KTVKSPA K
Subjt:  KKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.5e-2748.51Show/hide
Query:  SDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE
        +DAP    A   +  +K +K    K  K KK  + A K R+  +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP  FRKLLL++LK+LVA+ 
Subjt:  SDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKP-SGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAE

Query:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTKAAEKVKKV
        KLVKVK S+KLPSA    AKA++  AA   A+K   +K K A++   AV K+K K +A  K K     KPKT A  K  AK K       T AA K K V
Subjt:  KLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKTKAAEKVKKV

Query:  APKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
          KPK A A+ AK AKT   TSP K+A  ATK        KK   K   KPKTVKSPA++  +R VKK
Subjt:  APKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPATK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G18050.1 histone H1-33.1e-0937.43Show/hide
Query:  KKPSGAKKAR--SSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAA
        KK   AKK R   + THPP+ QMI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +          
Subjt:  KKPSGAKKAR--SSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAA

Query:  PVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA
         +T ++   +K K    +   + K    +S +PK K V+  K +   K K   +PK+   +   +K  K +
Subjt:  PVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA

AT2G18050.2 histone H1-38.0e-0535.57Show/hide
Query:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAV
        MI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +           +T ++   +K K    +   +
Subjt:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAV

Query:  AKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA
         K    +S +PK K V+  K +   K K   +PK+   +   +K  K +
Subjt:  AKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.2e-3250.72Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS    A    AAPV  K  V +K K      AAVA +KAK +A    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAAK 
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPK---TAAKT

Query:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K     A  K K VA KPK A  + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  K-----AAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPATK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein9.4e-2247.78Show/hide
Query:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV
        S AAD+ + S        +PA    K+KK   +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV
Subjt:  SSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAK-KPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLV

Query:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPK-AVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKA
        +LK+LVA+EKLVKVK S+K+PSARS    A    AAPV  K  V +K KA+   + +   S  K  A P  K AV K  P   AKS  V  P   A T+ 
Subjt:  HLKKLVAAEKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPK-AVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKA

Query:  AEK
        A+K
Subjt:  AEK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCCGCCGCTGATTCCGTCATCATCTCCGATGCTCCCGCTGCAGCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGACTCCAAGGCTAAGAAAGCTGCGGCATCGAAAGCATC
GAAGGCTAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCTAGATCTTCTCCGACTCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCGTTTCTCTGAAGGAGAGAACCGGCT
CGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCACTGAAGAGAAACACAAACAATTGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTTGTTCATCTCAAAAAACTTGTCGCCGCTGAAAAA
CTCGTTAAGGTTAAGAACTCCTATAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATTCAAGCAAAAGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTCACCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAA
ACTCAAAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCCGCCGTTGCCAAATCGAAAGCCAAAACTTCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTTGCTA
AATCCAAGACCGTCGCGAAACCAAAAACCGCCGCGAAGACGAAGGCAGCTGAGAAGGTTAAGAAGGTTGCTCCGAAGCCTAAACCAGCAGCAGCCAAGGCAGCGAAAGTA
GCGAAAACACTGTCGCGAACTTCGCCAGGAAAGAGAGCCGCACCGGCGACAAAGGCGAAGAAAGTGGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGT
CCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTTCCGCCGCTGATTCCGTCATCATCTCCGATGCTCCCGCTGCAGCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGACTCCAAGGCTAAGAAAGCTGCGGCATCGAAAGCATC
GAAGGCTAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCTAGATCTTCTCCGACTCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCGTTTCTCTGAAGGAGAGAACCGGCT
CGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCACTGAAGAGAAACACAAACAATTGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTTGTTCATCTCAAAAAACTTGTCGCCGCTGAAAAA
CTCGTTAAGGTTAAGAACTCCTATAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATTCAAGCAAAAGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCACCAGTCACCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAA
ACTCAAAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCCGCCGTTGCCAAATCGAAAGCCAAAACTTCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTTGCTA
AATCCAAGACCGTCGCGAAACCAAAAACCGCCGCGAAGACGAAGGCAGCTGAGAAGGTTAAGAAGGTTGCTCCGAAGCCTAAACCAGCAGCAGCCAAGGCAGCGAAAGTA
GCGAAAACACTGTCGCGAACTTCGCCAGGAAAGAGAGCCGCACCGGCGACAAAGGCGAAGAAAGTGGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGT
CCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAADSVIISDAPAAAVAQPAENDSKAKKAAASKASKAKKPSGAKKARSSPTHPPFLQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFTEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAAEK
LVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAAAAPVTAKKPVSSKLKAASIKKAAVAKSKAKTSAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKTVAKPKTAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAAKAAKV
AKTLSRTSPGKRAAPATKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK