; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19599 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19599
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionF-box protein PP2-B13-like
Genome locationctg4:3135144..3136561
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19599
SyntenyCucsat.G19599
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYJ96495.1 F-box protein PP2-B13-like [Cucumis melo var. makuwa]1.32e-18185.53Show/hide
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XP_038890670.1 F-box protein PP2-B13-like [Benincasa hispida]4.57e-14970.97Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJT8 F-box domain-containing protein4.96e-21297.03Show/hide
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A0A0A0LLX5 F-box domain-containing protein1.88e-21699.01Show/hide
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A0A1S3BXK2 F-box protein PP2-B13-like2.23e-18285.86Show/hide
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A0A5A7U3A9 F-box protein PP2-B13-like2.23e-18285.86Show/hide
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A0A5D3BDF0 F-box protein PP2-B13-like6.38e-18285.53Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B152.4e-5842Show/hide
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        R+LSITWS     W+W     S F E V+L    WLEI GKI+T  LSPNT YGAYL+ K++ RAYGL+L+PA+ S+++                N E  
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        +   +     N +  +E + YG R +R    + +++H +  E      R+DGW+E+ELGEF T      +D+++ MS  E KG+QLK G+ I GI++RPK
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Q3E6P4 F-box protein At2g022401.5e-5240Show/hide
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           MLS++EL ITW S P  W W S P+S F ++ EL  V W EI GK   + LSP T+Y AY++FK  +R  GL  +P ++ L L              
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          +S+ +++                   G R  R  +      + ++    +QREDGW+E ELGEFF  +   ++  S +E K    KSGL+IQGI+ RP
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Q9C7J9 F-box protein PP2-B134.2e-5540.82Show/hide
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        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGWLE+ELGEF T +  D +++MS  E KG+QLK G++I GI++RP
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Q9C7K0 F-box protein VBF4.7e-5440.34Show/hide
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        R++SIT S     W+W +   S F E  EL     LEI GKI+T+ LS NT+YGAYL+ K+++ AYGL+L+PA+ S++          + N   + S  Y
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Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGW+E+ELGEF T +  D +++M+  E KG+QLK G+LI GI++RPK
Subjt:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK

Q9FLU7 Putative F-box protein PP2-B123.6e-4636.95Show/hide
Query:  LPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        LPE+CI+ ++S T+P DA +++ VS + RSAA+S+  W RFLP +Y   +            S ++ F R C SP+L+++G  SF +EK SGK  +MLSA
Subjt:  LPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEA
        R+L I W   P  W W S P S F EV  L  V W EI GKI T  LS  T Y AYL+FK  E  ++G E +P ++S +                     
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEA

Query:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK
                       +  + +Y NRR     F+++  Q         REDGWLE+ELGE++   +D+++ MS +ET+    K G+++QGI+IRPK
Subjt:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B151.7e-5942Show/hide
Query:  VLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        +LPE C++ ILS TTP+D    A VSS+FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S         SK+E +  LC  IL+D G K F++EKLSGK+ Y+LS+
Subjt:  VLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAY
        R+LSITWS     W+W     S F E V+L    WLEI GKI+T  LSPNT YGAYL+ K++ RAYGL+L+PA+ S+++                N E  
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAY

Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERAT--KFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFT----TQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +   +     N +  +E + YG R +R    + +++H +  E      R+DGW+E+ELGEF T      +D+++ MS  E KG+QLK G+ I GI++RPK
Subjt:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERAT--KFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFT----TQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK

AT1G56240.1 phloem protein 2-B133.0e-5640.82Show/hide
Query:  VLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        +LPE C++ IL+ T+P+DA   + VSS+FR A +SD VW +FLP +Y+ +++ S         SK+E +  LC  +L+D   K F++ K SGK+ Y+LSA
Subjt:  VLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAY
        R++SIT+S      +W +   S F E  EL T   LEI GKI+T  LSPNTKYGAYL+ K++  AYGL+L+PA+ S++          + N  +N +  Y
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAY

Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRP
        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGWLE+ELGEF T +  D +++MS  E KG+QLK G++I GI++RP
Subjt:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRP

AT1G56250.1 phloem protein 2-B143.3e-5540.34Show/hide
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        +LPE CI+ IL+ T+P+DA   + VSS+FR A +SD VW +FLP +Y+ +++ S       + SK+E +  LC  +L+D   K F++ K SGK+ Y+LSA
Subjt:  VLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAY
        R++SIT S     W+W +   S F E  EL     LEI GKI+T+ LS NT+YGAYL+ K+++ AYGL+L+PA+ S++          + N   + S  Y
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAY

Query:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK
        +    +   Q     ++ L YGNR ER    ++    + + R    R+DGW+E+ELGEF T +  D +++M+  E KG+QLK G+LI GI++RPK
Subjt:  VWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQ-NDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK

AT2G02240.1 F-box family protein1.1e-5340Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK
        G S   VLPEDCIS I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP  YE +V+ S +       SK+E +F LC +P+L+++G KSF LEK SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK

Query:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNN
           MLS++EL ITW S P  W W S P+S F ++ EL  V W EI GK   + LSP T+Y AY++FK  +R  GL  +P ++ L L              
Subjt:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNN

Query:  HNNSEAYVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRP
          +S+ +++                   G R  R  +      + ++    +QREDGW+E ELGEFF  +   ++  S +E K    KSGL+IQGI+ RP
Subjt:  HNNSEAYVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRP

AT5G24560.1 phloem protein 2-B122.6e-4736.95Show/hide
Query:  LPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        LPE+CI+ ++S T+P DA +++ VS + RSAA+S+  W RFLP +Y   +            S ++ F R C SP+L+++G  SF +EK SGK  +MLSA
Subjt:  LPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEA
        R+L I W   P  W W S P S F EV  L  V W EI GKI T  LS  T Y AYL+FK  E  ++G E +P ++S +                     
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISER-AYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEA

Query:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK
                       +  + +Y NRR     F+++  Q         REDGWLE+ELGE++   +D+++ MS +ET+    K G+++QGI+IRPK
Subjt:  YVWLHHKHHDQNNQSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTATTTCGGAGATTCTGTCACTCACAACTCCCTCCGACGCCGGGAAATTGGCCCTCGTGTCGTCCATGTT
TCGGTCCGCGGCGGAATCCGACGTAGTTTGGGGGAGATTTTTGCCGGAAAACTACGAGGAAATTGTGGCGGCGTCTGAACTGTCCGGTGAGGCTCCGTTGAGATCGAAGA
GAGAGGCTTTCTTCAGACTGTGCTCTCCGATCCTTGTGGACGAGGGTACAAAGAGTTTTGAATTGGAGAAGTTATCAGGGAAGGTTATATATATGTTATCAGCAAGGGAA
TTGAGTATCACATGGAGTTCTGATCCTCTTTGTTGGACTTGGAAATCTCATCCTCAATCAACATTCCCAGAAGTGGTGGAGCTAAGAACAGTGAGTTGGTTAGAGATTAA
TGGGAAAATAAGAACCAAAACGCTATCTCCAAACACAAAATATGGAGCTTATCTTCTGTTCAAGATTTCAGAGAGAGCTTATGGATTAGAATTGATGCCTGCTCAACTTT
CTCTTCAATTATTCCCAATTAATCAACCAAACACAAACAATTATAACAATAATCATAATAATTCAGAAGCCTACGTTTGGTTGCACCATAAACATCATGATCAAAATAAC
CAAAGTAATTTGGAGTCTTTGCTGTATGGTAATAGAAGGGAAAGAGCCACTAAATTCATACAGAATCATGTTCAGAATAAGGAATTTAGGGTTTTGAATCAAAGAGAAGA
TGGGTGGTTGGAGGTTGAATTGGGTGAATTTTTCACAACACAAAATGACCAACAACTCCATATGAGTTTCATGGAAACCAAAGGCTTTCAGCTCAAATCTGGTCTTCTTA
TTCAAGGCATTCAAATTAGACCTAAACATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTATTTCGGAGATTCTGTCACTCACAACTCCCTCCGACGCCGGGAAATTGGCCCTCGTGTCGTCCATGTT
TCGGTCCGCGGCGGAATCCGACGTAGTTTGGGGGAGATTTTTGCCGGAAAACTACGAGGAAATTGTGGCGGCGTCTGAACTGTCCGGTGAGGCTCCGTTGAGATCGAAGA
GAGAGGCTTTCTTCAGACTGTGCTCTCCGATCCTTGTGGACGAGGGTACAAAGAGTTTTGAATTGGAGAAGTTATCAGGGAAGGTTATATATATGTTATCAGCAAGGGAA
TTGAGTATCACATGGAGTTCTGATCCTCTTTGTTGGACTTGGAAATCTCATCCTCAATCAACATTCCCAGAAGTGGTGGAGCTAAGAACAGTGAGTTGGTTAGAGATTAA
TGGGAAAATAAGAACCAAAACGCTATCTCCAAACACAAAATATGGAGCTTATCTTCTGTTCAAGATTTCAGAGAGAGCTTATGGATTAGAATTGATGCCTGCTCAACTTT
CTCTTCAATTATTCCCAATTAATCAACCAAACACAAACAATTATAACAATAATCATAATAATTCAGAAGCCTACGTTTGGTTGCACCATAAACATCATGATCAAAATAAC
CAAAGTAATTTGGAGTCTTTGCTGTATGGTAATAGAAGGGAAAGAGCCACTAAATTCATACAGAATCATGTTCAGAATAAGGAATTTAGGGTTTTGAATCAAAGAGAAGA
TGGGTGGTTGGAGGTTGAATTGGGTGAATTTTTCACAACACAAAATGACCAACAACTCCATATGAGTTTCATGGAAACCAAAGGCTTTCAGCTCAAATCTGGTCTTCTTA
TTCAAGGCATTCAAATTAGACCTAAACATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGISSIGVLPEDCISEILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASELSGEAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSARE
LSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVVELRTVSWLEINGKIRTKTLSPNTKYGAYLLFKISERAYGLELMPAQLSLQLFPINQPNTNNYNNNHNNSEAYVWLHHKHHDQNN
QSNLESLLYGNRRERATKFIQNHVQNKEFRVLNQREDGWLEVELGEFFTTQNDQQLHMSFMETKGFQLKSGLLIQGIQIRPKH