; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19682 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19682
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionprotein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2
Genome locationctg4:4933329..4938040
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19682
SyntenyCucsat.G19682
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
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InterPro domainsIPR010402 - CCT domain


Homology Show/hide homology
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        RLFSKKIRY+VRK+NA+ RPRMKGRFV+R
Subjt:  RLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRR

Q8RWD0 Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 161.8e-1441.5Show/hide
Query:  KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIP---SSDTAGSDVNARVANIDLFTEG----GGLL-----
        K  + E +  +ES    +   KE+  K +       L+L+LNY++V   W  +G P+S   P     D +G    + V N    T      GG L     
Subjt:  KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIP---SSDTAGSDVNARVANIDLFTEG----GGLL-----

Query:  ----REASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRR
            REA V RY+EKRRTRLFSKKIRY+VRK+NA+ RPRMKGRFV+R
Subjt:  ----REASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRR

Q9C9A9 Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 78.1e-1547.86Show/hide
Query:  KLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEI-PSSDTAGSDVNARV-------------ANIDLFTEGGGL--LREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVR
        K + T L L+L+Y AV  AW + GSP+   I P     G+     V                    +GGG    REA VLRYKEKRRTRLFSKKIRY+VR
Subjt:  KLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEI-PSSDTAGSDVNARV-------------ANIDLFTEGGGL--LREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVR

Query:  KVNADGRPRMKGRFVRR
        K+NA+ RPR+KGRFV+R
Subjt:  KVNADGRPRMKGRFVRR

Q9LU68 Protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 28.2e-6844.76Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEILKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE +KS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
Subjt:  SPCIS---GGGRAYNFDLEILKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH

Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H  +   +  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N   G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APTPTPTP----TPAAVSTKK--KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVAN
        A +             +S +K  KKKK +K+TV  +    I   K   +     LK TG LLKL+Y+ V +AWS + SPF DEI  S+    DVNAR+A 
Subjt:  APTPTPTP----TPAAVSTKK--KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVAN

Query:  IDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNSS
        IDLF + G  +REASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRK+NAD RPRMKGRFVRRPN S
Subjt:  IDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNSS

Q9M9B3 Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 86.4e-1248.91Show/hide
Query:  KLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRR
        +LNYE V  AW  + SP   ++ ++ ++   V   +    + +E     REA V RY++KR+ RLF KKIRY+VRKVNAD RPRMKGRFVRR
Subjt:  KLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25990.1 CCT motif family protein2.1e-6643.46Show/hide
Query:  AYNFDLEILKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL
        AY+F+LE++KSP S     + T SPSST+SE+  N+   +ISTR+ RTPRKRPNQTY+EA  LLSTAYP +FS+K      +   ++    S + E+++L
Subjt:  AYNFDLEILKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL

Query:  LLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEKGNSTQDSCVNA
        LLP+  I+ + FL          N  I +K  +  E +  S     D + N   +  ++DFDAESILDEEIEEGIDS MG     N+E  +  +++C   
Subjt:  LLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEKGNSTQDSCVNA

Query:  NNHPRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PTPTPTPTPAAVSTKKKKKKVEKL-
                   +   +N +F  G G      R+++R  ++ NWW+FPTV+  +ISP++     A A          +   T   A    KKKKKK +K  
Subjt:  NNHPRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PTPTPTPTPAAVSTKKKKKKVEKL-

Query:  --TVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFS
             ESK + +     K E+   ++ P   LLKL+Y+ V +AWS + SPFSDEI  SD  G D + R+  IDLF E G  +REASVLRYKEKRR RLFS
Subjt:  --TVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFS

Query:  KKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNS
        KKIRYQVRK+NAD RPRMKGRFVRRPN+
Subjt:  KKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNS

AT4G25990.2 CCT motif family protein2.2e-6341.99Show/hide
Query:  AYNFDLEILKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL
        AY+F+LE++KSP S     + T SPSST+SE+  N+   +ISTR+ RTPRKRPNQTY+EA  LLSTAYP +FS+K      +   ++    S + E+++L
Subjt:  AYNFDLEILKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAEL

Query:  LLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEKGNSTQDSCVNA
        LLP+  I+ + FL          N  I +K  +  E +  S     D + N   +  ++DFDAESILDEEIEEGIDS MG     N+E  +  +++C   
Subjt:  LLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEKGNSTQDSCVNA

Query:  NNHPRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PTPTPTPTPAAVSTKKKKKKVEKL-
                   +   +N +F  G G      R+++R  ++ NWW+FPTV+  +ISP++     A A          +   T   A    KKKKKK +K  
Subjt:  NNHPRNWNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPA---------PTPTPTPTPAAVSTKKKKKKVEKL-

Query:  --TVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFS
             ESK + +     K E+   ++ P   LLKL+Y+ V +AWS + SPFSDEI  SD  G D + R+  IDLF E G  +REASVLRYKEKRR RLFS
Subjt:  --TVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFS

Query:  KKIRYQVRKVNADGRPRMK---------------GRFVRRPNS
        KKIRYQVRK+NAD RPRMK               GRFVRRPN+
Subjt:  KKIRYQVRKVNADGRPRMK---------------GRFVRRPNS

AT5G57180.1 chloroplast import apparatus 21.3e-6343.75Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEILKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE +KS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
Subjt:  SPCIS---GGGRAYNFDLEILKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH

Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H  +   +  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N   G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APTPTPTP----TPAAVSTKK--KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVAN
        A +             +S +K  KKKK +K+TV  +    I   K   +     LK TG LLKL+Y+ V +AWS + SPF DEI  S+    DVNAR+A 
Subjt:  APTPTPTP----TPAAVSTKK--KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVAN

Query:  IDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMK
        IDLF + G  +REASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRK+NAD RPRMK
Subjt:  IDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMK

AT5G57180.2 chloroplast import apparatus 25.9e-6944.76Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEILKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE +KS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
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Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H  +   +  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N   G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
Subjt:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP

Query:  APTPTPTP----TPAAVSTKK--KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVAN
        A +             +S +K  KKKK +K+TV  +    I   K   +     LK TG LLKL+Y+ V +AWS + SPF DEI  S+    DVNAR+A 
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Query:  IDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNSS
        IDLF + G  +REASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRK+NAD RPRMKGRFVRRPN S
Subjt:  IDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNSS

AT5G57180.3 chloroplast import apparatus 24.0e-4138.73Show/hide
Query:  SPCIS---GGGRAYNFDLEILKS-PSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSH
        S C+S   GG  AY+F+LE +KS P SS T T++ +SPSST+SESSN  + LAISTRK RT RKRPNQTYNEA  LLSTAYPN+FS    +N     K+H
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Query:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM
          S+S F         ++++LLLP+  I+   FL H  +   +  ++  S    +     C   GEI+      + +  ++FDAESILDE+IEEGIDSIM
Subjt:  DDSSSLFC--------ESAELLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIM

Query:  GNLSVDNLEKG--NSTQDSCVNANNHPRN------------WNWNPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAP
        G +   N   G   S     +N      +             +WN    GFN  F  G G      R+A+R  D+   W+  TVD  +ISP++       
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Query:  APTPTPTP----TPAAVSTKK--KKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGLLLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVN
        A +             +S +K  KKKK +K+TV  +    I   K   +     LK TG LLKL+Y+ V +AWS + SPF DEI  S+    DVN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTCCATGTATAAGTGGTGGTGGGAGGGCTTACAATTTCGATTTAGAGATTCTGAAATCTCCATCTTCTTCATGGACAAGAACTTCACAAACTTCATCGCCATC
TTCAACTTTATCAGAATCAAGCAACAATACAACACAGTTAGCAATCTCAACTCGAAAATTAAGAACACCGCGAAAGCGCCCAAATCAAACCTACAACGAAGCTACAGTTT
TGCTTTCAACGGCCTACCCAAATGTTTTTTCAACCAAACATCTTACCAATCCACGAAAATTCACCAAATCTCACGATGATTCTTCTTCTCTCTTCTGTGAATCTGCTGAA
TTGCTTTTGCCTTTTCGAGTAATCGATAGTTCTGGATTTCTCCTTCACCAACTGCTGCTCGAAGAAAAGCCTAATTCCCAAATTCATTCCAAATTGACCAATCTTTGGGA
AAATCGACCCTGTTCTAGTCCTGGAGAGATCGATTTCCAACCGAATTCCATGGAGATTGAAGAGATTGAAGATTTCGATGCGGAATCGATTCTTGACGAGGAAATCGAAG
AAGGAATCGACAGTATTATGGGTAATCTGAGTGTGGATAACCTAGAAAAAGGCAATTCAACGCAAGATTCTTGTGTGAATGCAAATAACCATCCACGGAATTGGAATTGG
AATCCAATCGGTTTAGGCTTCAACCAGAAATTCGAATCTGGCTTCGGATTCCGTAAGGGAATCGAACGAACAGCAATTCGAGGAGTCGATAATGGAAACTGGTGGCGATT
TCCGACTGTCGATGTAATCGAAATCTCTCCTAAACTAAATCCAAAACCACCAGCTCCAGCTCCAACTCCGACTCCGACTCCAACACCGGCAGCCGTCTCGACTAAGAAGA
AGAAAAAGAAAGTGGAGAAGCTTACAGTGATTGAATCAAAGAAAGCCGCAATTCCATTACAAAAGGAGAAATCAGAGAAGCCGATCCCGAAATTGAAACCTACTGGATTA
CTTCTGAAATTGAACTACGAAGCCGTCGCTGACGCTTGGTCTAGCCGGGGATCTCCATTTTCCGATGAGATTCCAAGTTCCGATACGGCGGGAAGTGATGTAAATGCCAG
GGTGGCGAATATAGATTTATTTACGGAGGGTGGAGGATTATTGAGAGAAGCCAGCGTGTTACGGTACAAAGAGAAAAGGCGGACTCGGTTGTTCTCGAAGAAGATAAGAT
ATCAAGTTAGGAAAGTCAATGCAGATGGACGGCCCAGAATGAAGGGGCGTTTTGTGAGGAGACCTAATTCAAGCGGCTATAGAAAGGAGACACACACTTCCCTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGAAAAAGAAAGTGGAGAAGCTTACAGTGATTGAATCAAAGAAAGCCGCAATTCCATTACAAAAGGAGAAATCAGAGAAGCCGATCCCGAAATTGAAACCTACTGGATTA
CTTCTGAAATTGAACTACGAAGCCGTCGCTGACGCTTGGTCTAGCCGGGGATCTCCATTTTCCGATGAGATTCCAAGTTCCGATACGGCGGGAAGTGATGTAAATGCCAG
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ATCAAGTTAGGAAAGTCAATGCAGATGGACGGCCCAGAATGAAGGGGCGTTTTGTGAGGAGACCTAATTCAAGCGGCTATAGAAAGGAGACACACACTTCCCTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSPCISGGGRAYNFDLEILKSPSSSWTRTSQTSSPSSTLSESSNNTTQLAISTRKLRTPRKRPNQTYNEATVLLSTAYPNVFSTKHLTNPRKFTKSHDDSSSLFCESAE
LLLPFRVIDSSGFLLHQLLLEEKPNSQIHSKLTNLWENRPCSSPGEIDFQPNSMEIEEIEDFDAESILDEEIEEGIDSIMGNLSVDNLEKGNSTQDSCVNANNHPRNWNW
NPIGLGFNQKFESGFGFRKGIERTAIRGVDNGNWWRFPTVDVIEISPKLNPKPPAPAPTPTPTPTPAAVSTKKKKKKVEKLTVIESKKAAIPLQKEKSEKPIPKLKPTGL
LLKLNYEAVADAWSSRGSPFSDEIPSSDTAGSDVNARVANIDLFTEGGGLLREASVLRYKEKRRTRLFSKKIRYQVRKVNADGRPRMKGRFVRRPNSSGYRKETHTSL