; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19790 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19790
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionDUF4050 family protein
Genome locationctg4:1210053..1212702
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19790
SyntenyCucsat.G19790
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein3.98e-118100Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X29.38e-11798.76Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X16.67e-11494.64Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508502.98e-9581.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein9.2e-2042.06Show/hide
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AT1G15350.2 unknown protein9.2e-2042.06Show/hide
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AT3G15770.1 unknown protein1.7e-1843.31Show/hide
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        R PS+  SEDFW+ +T D++   +      S ISTTN   +  G   + +  ++FVNHG VLW QTR +WVG+     R        L+  +T E LL +
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AT5G25360.1 unknown protein3.8e-2642.07Show/hide
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        WI +L  C+G       KP   ++      G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  LW
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         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL +MVDFLV+ WE+EGLY
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AT5G25360.2 unknown protein3.8e-2642.07Show/hide
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        WI +L  C+G       KP   ++      G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  LW
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Query:  TQTRLRWVGNCVPAKRTKKNHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSDMVDFLVEEWEEEGLY
         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL +MVDFLV+ WE+EGLY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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