; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19905 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19905
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationctg4:3054992..3056994
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19905
SyntenyCucsat.G19905
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048028.1 Rapid ALkalinization Factor [Cucumis melo var. makuwa]9.89e-7996.61Show/hide
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KAG7021083.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.60e-7591.53Show/hide
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KGN60987.2 hypothetical protein Csa_021272 [Cucumis sativus]3.48e-83100Show/hide
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XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]1.11e-7591.53Show/hide
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XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]9.89e-7995.76Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein1.04e-82100Show/hide
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A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor4.79e-7996.61Show/hide
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A0A6J1DA82 protein RALF-like 332.79e-7187.29Show/hide
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A0A6J1FH12 protein RALF-like 335.38e-7691.53Show/hide
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A0A6J1HQE4 protein RALF-like 333.12e-7590.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.0e-2969.07Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor4.3e-2757.89Show/hide
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 235.6e-2765.59Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITR
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Q9MA62 Protein RALF-like 224.7e-2655.26Show/hide
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        N+   + + A + ++ S   +T   G  +    A   +  S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GA
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.3e-2861.06Show/hide
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        T FL    + ++F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 19.4e-3061.06Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 194.5e-1655.56Show/hide
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        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+NNVPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGC+ IT
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AT3G05490.1 ralf-like 223.4e-2755.26Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 234.0e-2865.59Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITR
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AT4G15800.1 ralf-like 331.5e-3069.07Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAGTCTTGCATGGATTCCTAATCAATCTACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGGGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCAA
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CGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTCTTATCTTCAGCTGTTCCTCAACCACCGTCCACGCCGGTCTAGGGATCCAACA
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CGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RGCNAITRL