; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G19912 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G19912
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionF-box protein PP2-B13-like
Genome locationctg4:3142959..3144172
RNA-Seq ExpressionCucsat.G19912
SyntenyCucsat.G19912
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYJ96495.1 F-box protein PP2-B13-like [Cucumis melo var. makuwa]1.20e-8091.85Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        M  ISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASE+SG+APL SKREAFFRLCSPILV+EG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        K+IYMLSAREL ITWSSDPLCW+WKSHPQS FPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

XP_004144818.3 F-box protein PP2-B15 [Cucumis sativus]6.68e-8697.04Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        MAGISSIGVLPEDC+SAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASE+SG+APLRSKREAFFRLCSPILVDEG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

XP_008453983.1 PREDICTED: F-box protein PP2-B13-like [Cucumis melo]1.20e-8091.85Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        M  ISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASE+SG+APL SKREAFFRLCSPILV+EG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        K+IYMLSAREL ITWSSDPLCW+WKSHPQS FPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

XP_011648846.2 F-box protein PP2-B15 [Cucumis sativus]6.68e-8697.78Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        MAGISSIGVLPEDCVSAILSLT+PSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSG+APLRSKREAFFRLCSPILVDEG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

XP_023545312.1 F-box protein PP2-B15-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.07e-7279.17Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTP+DAGKL+LVSSMFRSAAESDVVW RFLP+NY EIVAAS++SG++PL SKREAFFRLCSPIL+D G KSFELE+ SG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKNSELV
        K+ Y LSAREL+ITWSSDPLCW+WKS PQS F EV   + S  V
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKNSELV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJT8 F-box domain-containing protein3.23e-8697.78Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        MAGISSIGVLPEDCVSAILSLT+PSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSG+APLRSKREAFFRLCSPILVDEG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

A0A0A0LLX5 F-box domain-containing protein1.13e-8697.78Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        MAGISSIGVLPEDC+SAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSG+APLRSKREAFFRLCSPILVDEG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

A0A1S3BXK2 F-box protein PP2-B13-like5.80e-8191.85Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        M  ISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASE+SG+APL SKREAFFRLCSPILV+EG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        K+IYMLSAREL ITWSSDPLCW+WKSHPQS FPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

A0A5A7U3A9 F-box protein PP2-B13-like5.80e-8191.85Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        M  ISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASE+SG+APL SKREAFFRLCSPILV+EG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        K+IYMLSAREL ITWSSDPLCW+WKSHPQS FPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

A0A5D3BDF0 F-box protein PP2-B13-like5.80e-8191.85Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG
        M  ISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASE+SG+APL SKREAFFRLCSPILV+EG KSFELEKLSG
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSG

Query:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        K+IYMLSAREL ITWSSDPLCW+WKSHPQS FPEV
Subjt:  KVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B157.0e-2647.62Show/hide
Query:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        +LPE CV+ ILS TTP+D    A VSS+FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S    +    SK+E +  LC  IL+D G K F++EKLSGK+ Y+LS+
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPE
        R+LSITWS     W+W     S F E
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPE

Q3E6P4 F-box protein At2g022404.4e-2849.25Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK
        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP  YE +V+ S +       SK+E +F LC +P+L+++G KSF LEK SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK

Query:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
           MLS++EL ITW S P  W W S P+S F ++
Subjt:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

Q6NPT8 F-box protein PP2-B13.9e-2445.26Show/hide
Query:  SSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVI
        S    LPEDC+S ++S T+P DA  +A VS   +SAA+SD+VW  FLP  Y  +V  S     A   SK+E F  L  + +LV+ G KSF +EK SGK  
Subjt:  SSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVI

Query:  YMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKN
        YMLSA EL+I W   P  W W + P+S F +V   +N
Subjt:  YMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKN

Q9ZVQ8 Putative F-box protein PP2-B85.0e-2441.61Show/hide
Query:  KMAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKL
        K  G++ +  LPE+CVS I+S T+P DA  LA VS  F SA +SD+VW +F+P  YE +++ S         SK+E +F LC   +L+D+G KS  +EK 
Subjt:  KMAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKL

Query:  SGKVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        + K   M+SA  L+I W + P  W W   PQ+ F  V
Subjt:  SGKVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

Q9ZVR5 Putative F-box protein PP2-B25.0e-2445.26Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLS
        ++G S    LPEDC+S I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP +Y  +V  S +       SK+E +F +C +P+LV++G KSF LEK +
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLS

Query:  GKVIYMLSARE-LSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        GK  +MLS ++ + ITW S P  W W S P++ F EV
Subjt:  GKVIYMLSARE-LSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B155.0e-2747.62Show/hide
Query:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA
        +LPE CV+ ILS TTP+D    A VSS+FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S    +    SK+E +  LC  IL+D G K F++EKLSGK+ Y+LS+
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSA

Query:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPE
        R+LSITWS     W+W     S F E
Subjt:  RELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPE

AT2G02230.1 phloem protein 2-B12.7e-2545.26Show/hide
Query:  SSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVI
        S    LPEDC+S ++S T+P DA  +A VS   +SAA+SD+VW  FLP  Y  +V  S     A   SK+E F  L  + +LV+ G KSF +EK SGK  
Subjt:  SSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGKVI

Query:  YMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKN
        YMLSA EL+I W   P  W W + P+S F +V   +N
Subjt:  YMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKN

AT2G02240.1 F-box family protein3.1e-2949.25Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK
        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP  YE +V+ S +       SK+E +F LC +P+L+++G KSF LEK SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLSGK

Query:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
           MLS++EL ITW S P  W W S P+S F ++
Subjt:  VIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

AT2G02250.1 phloem protein 2-B23.6e-2545.26Show/hide
Query:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLS
        ++G S    LPEDC+S I+S T+P DA   A VS  F SA  SD VW +FLP +Y  +V  S +       SK+E +F +C +P+LV++G KSF LEK +
Subjt:  MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKLS

Query:  GKVIYMLSARE-LSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        GK  +MLS ++ + ITW S P  W W S P++ F EV
Subjt:  GKVIYMLSARE-LSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV

AT2G02340.1 phloem protein 2-B83.6e-2541.61Show/hide
Query:  KMAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKL
        K  G++ +  LPE+CVS I+S T+P DA  LA VS  F SA +SD+VW +F+P  YE +++ S         SK+E +F LC   +L+D+G KS  +EK 
Subjt:  KMAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFRLC-SPILVDEGTKSFELEKL

Query:  SGKVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV
        + K   M+SA  L+I W + P  W W   PQ+ F  V
Subjt:  SGKVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AACCCCACTCGGCACTCACTTCAAGAGAGGAAATTCGGTGAGAAACAGAGAAAGGGAGAGATTTATATTTTCATATTTTTGTTTGTGTGTAAAATGGCCGGAATTTCGAG
CATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACAACTCCCTCCGACGCCGGGAAATTGGCCCTCGTGTCGTCCATGTTTCGGTCCGCGGCGGAAT
CCGACGTAGTTTGGGGGAGATTTTTGCCGGAAAACTACGAGGAAATTGTGGCAGCGTCTGAAATGTCCGGTAAGGCTCCGTTGAGATCGAAGAGAGAGGCTTTCTTCAGA
CTGTGCTCTCCGATCCTTGTGGACGAGGGTACAAAGAGTTTTGAATTGGAGAAGTTATCAGGGAAGGTTATATATATGTTATCAGCAAGGGAATTGAGTATCACATGGAG
TTCTGATCCTCTTTGTTGGACTTGGAAATCTCATCCTCAATCAACATTCCCAGAAGTGGGTGGAGCTAAGAACAGTGAGTTGGTTAGAGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCCCACTCGGCACTCACTTCAAGAGAGGAAATTCGGTGAGAAACAGAGAAAGGGAGAGATTTATATTTTCATATTTTTGTTTGTGTGTAAAATGGCCGGAATTTCGAG
CATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACAACTCCCTCCGACGCCGGGAAATTGGCCCTCGTGTCGTCCATGTTTCGGTCCGCGGCGGAAT
CCGACGTAGTTTGGGGGAGATTTTTGCCGGAAAACTACGAGGAAATTGTGGCAGCGTCTGAAATGTCCGGTAAGGCTCCGTTGAGATCGAAGAGAGAGGCTTTCTTCAGA
CTGTGCTCTCCGATCCTTGTGGACGAGGGTACAAAGAGTTTTGAATTGGAGAAGTTATCAGGGAAGGTTATATATATGTTATCAGCAAGGGAATTGAGTATCACATGGAG
TTCTGATCCTCTTTGTTGGACTTGGAAATCTCATCCTCAATCAACATTCCCAGAAGTGGGTGGAGCTAAGAACAGTGAGTTGGTTAGAGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NPTRHSLQERKFGEKQRKGEIYIFIFLFVCKMAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPSDAGKLALVSSMFRSAAESDVVWGRFLPENYEEIVAASEMSGKAPLRSKREAFFR
LCSPILVDEGTKSFELEKLSGKVIYMLSARELSITWSSDPLCWTWKSHPQSTFPEVGGAKNSELVRD