CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G21361
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	Tubulin beta chain
Genome location	ctg910:1762352..1764454
RNA-Seq Expression	Cucsat.G21361
Synteny	Cucsat.G21361
Gene Ontology terms	GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process) GO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005874 - microtubule (cellular component) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function) GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function) GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000217 - Tubulin IPR002453 - Beta tubulin IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal IPR017975 - Tubulin, conserved site IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain IPR023123 - Tubulin, C-terminal IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily IPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain

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SwissProt top hits

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P93176 Tubulin beta chain

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Q41783 Tubulin beta-6 chain

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Q9ZRB1 Tubulin beta-2 chain

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Arabidopsis top hits

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AT5G23860.1 tubulin beta 8

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AT5G23860.2 tubulin beta 8

8.8e-241

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AT5G62690.1 tubulin beta chain 2

5.1e-241

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Subjt:  ICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTARGSQQYRALTIPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR

Query:  YLTASALFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLSMSSTFMGNSTSIQEMFRRVSEQFTVMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFT
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AT5G62700.1 tubulin beta chain 3

5.1e-241

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        YLTASA+FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKS+VCDIPPTGL M+STF+GNSTSIQEMFRRVSEQFT MFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFT
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        EAESNMNDLVSEYQQYQDA A++E + E++
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SEYQQYQDAVAEDEEEVEEDVL

Cucsat.G21361 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome