; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G21368 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G21368
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionprotein LURP-one-related 4
Genome locationctg910:1881526..1882645
RNA-Seq ExpressionCucsat.G21368
SyntenyCucsat.G21368
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007612 - LURP-one-related
IPR025659 - Tubby-like, C-terminal
IPR038595 - LURP-one-related superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042775.1 protein LURP-one-related 4 [Cucumis melo var. makuwa]1.69e-12995.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNY3 Uncharacterized protein1.52e-140100Show/hide
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A0A6J1ELI2 protein LURP-one-related 4-like2.10e-11988.89Show/hide
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A0A6J1HYX0 protein LURP-one-related 4-like5.59e-11486.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Q8LG32 Protein LURP-one-related 23.3e-2737.21Show/hide
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          + E  + P F  +K     S +++ +      V  ++  L +++G    R   I     N +  AE KRK +   G+  G DV  L   S++E  + M
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53870.1 Protein of unknown function (DUF567)2.4e-2837.21Show/hide
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AT1G53880.1 Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein5.8e-2736.63Show/hide
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        ++
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AT1G53890.1 Protein of unknown function (DUF567)2.4e-2837.21Show/hide
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AT1G63410.1 Protein of unknown function (DUF567)6.0e-4045.85Show/hide
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        MA+V+PQ A+       SSP  S     TE ETFT+WMKSL+Y TNG T+++SNG+I YRV+NYD KCS+EV +MDL G +LFTIRKKK  + G W  YR
Subjt:  MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR

Query:  WMESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETSLVMALVTVY
           S  S +      ++ RS  R  +     E N   E F +++ D K AF+II+I+G ++A+ K K S NGI LG+DVL+L    +++ SLV+ LVT+ 
Subjt:  WMESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETSLVMALVTVY

Query:  GLIRR
        G +++
Subjt:  GLIRR

AT3G14260.1 Protein of unknown function (DUF567)3.8e-3441.98Show/hide
Query:  MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR
        M K++P    S +   +SSP  +     TE E+FTIWMKSL+++TNGCT+FDS G+I+YRVDNY+ K   EV+LMDL G VLFT+R++KF +   WEGYR
Subjt:  MAKVYPQTALSPSPSSSSSPSSSSLCSETETETFTIWMKSLIYHTNGCTIFDSNGDIVYRVDNYDRKCSSEVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR

Query:  WMES---ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETS
           +     +K   F VK        K + S+   +N G  R      + +V     LA  I +  G+++AE KRK S NG+ LGDDVL++   SQ++ S
Subjt:  WMES---ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETS

Query:  LVMALVTVYGLI
         ++ LV  + LI
Subjt:  LVMALVTVYGLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCGTCGTCTCCATCCTCTTCATCTCTCTGTTCCGAAACAGAAACCGAAACCTTCACTATTTG
GATGAAATCTCTAATTTACCACACAAATGGCTGCACAATCTTTGATTCTAATGGAGACATCGTTTATAGAGTTGATAACTACGACAGAAAATGCAGTAGCGAAGTATTTC
TCATGGATCTCAGAGGCAAAGTTCTCTTCACCATCAGAAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGTGGATGGGAAGGATACCGATGGATGGAATCAGAGAGAAGTAAGAAGCCT
AGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTATAGATCGGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGCGGTTTGTGAAATTAATGTAGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGG
AAAATTGGCTTTCAGAATAATCAACATCAATGGAGAAGTAGTTGCAGAGGCTAAAAGAAAAGTATCATGGAACGGAATATTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTGAATG
CAAATTCTCAGATCGAAACATCTTTGGTTATGGCTTTGGTTACTGTTTATGGATTAATCCGTCGCCAAATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCTGTCGCCGTCGCCGTCGTCCTCGTCGTCTCCATCCTCTTCATCTCTCTGTTCCGAAACAGAAACCGAAACCTTCACTATTTG
GATGAAATCTCTAATTTACCACACAAATGGCTGCACAATCTTTGATTCTAATGGAGACATCGTTTATAGAGTTGATAACTACGACAGAAAATGCAGTAGCGAAGTATTTC
TCATGGATCTCAGAGGCAAAGTTCTCTTCACCATCAGAAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGTGGATGGGAAGGATACCGATGGATGGAATCAGAGAGAAGTAAGAAGCCT
AGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTATAGATCGGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGCGGTTTGTGAAATTAATGTAGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGG
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CAAATTCTCAGATCGAAACATCTTTGGTTATGGCTTTGGTTACTGTTTATGGATTAATCCGTCGCCAAATGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SFGVKKLYRSGSRKRNQSAVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIETSLVMALVTVYGLIRRQM