; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G21563 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G21563
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationctg944:166709..171915
RNA-Seq ExpressionCucsat.G21563
SyntenyCucsat.G21563
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.12e-18494.16Show/hide
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XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]7.63e-18897.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein6.94e-19399.64Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like2.71e-19098.18Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like2.71e-19098.18Show/hide
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A0A6J1EH94 transmembrane protein 56-like5.62e-18393.8Show/hide
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A0A6J1KGK7 transmembrane protein 56-like5.62e-18393.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B6.8e-1226.01Show/hide
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        L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST +AI  S +S+Y +++++   +          +S +S FI      YF+ D  +  +    L     ++
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        HHT++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L    +K    Y+ING++IF  +++ R+     T + V     HY  +    +I + + F
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          P +  ++NL W   I K + K
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Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B5.8e-1123.33Show/hide
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        V G  +  +L +  ++ ++S+ + + Y  L   +  +WN+R +ST HA+ + +  LY +++ D  ++        +    L    + I+ GY   DL L+
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           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B1.1e-1428.37Show/hide
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        L+  Q++EWN+R +S+FHA+ +    LY + + D  +         +    +    + ++ GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ I RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 46.6e-1527.91Show/hide
Query:  YVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + I RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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        MW  KI KG +K IS
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Q96MV1 TLC domain-containing protein 41.9e-1428.38Show/hide
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        FYF SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY   +     D+       +   +L+   + I+ GY ++DL +I+  +  +G   
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        +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + I RI  +L  Y F +     +  I++ V+  L
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               VL +MN+MW  KI KG +K IS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.2e-11271.96Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+P+TSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHH+LSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WF KIV+G+ KT++KR
Subjt:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.2e-11271.96Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+P+TSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHH+LSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WF KIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.1e-6550.42Show/hide
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        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG STFHA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  VWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WL+AR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  VWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISK
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK
Subjt:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISK

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein6.4e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+P+TSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
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Query:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        L  F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WF KIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein6.4e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+P+TSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRH-PG

Query:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        L  F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  LVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WF KIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCATTTTGTCCCATTCACTTCTGT
ACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGGTTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATGTTGGTCTTACAAAAATTCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTTTTCATGCAATCTATATCTCAATCATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATCCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCCTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACACTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTTCTCATTTCAGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGTATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGATACACATTCTATCACGTTTACTTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTTGCAAAGATTGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCATTTTGTCCCATTCACTTCTGT
ACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGGTTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATGTTGGTCTTACAAAAATTCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTTTTCATGCAATCTATATCTCAATCATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATCCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCCTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACACTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTTCTCATTTCAGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGTATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGATACACATTCTATCACGTTTACTTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTTGCAAAGATTGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYVGLTKIQRVEWNNRGMSTFHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHPGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHTLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFAKIVKGLMKTISKR