; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G2267 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G2267
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionHomeobox-leucine zipper protein
Genome locationctg1002:2512350..2514225
RNA-Seq ExpressionCucsat.G2267
SyntenyCucsat.G2267
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604097.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.66e-15086.89Show/hide
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KAG7034261.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT22 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.75e-15086.52Show/hide
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XP_004143421.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22 [Cucumis sativus]2.10e-18099.62Show/hide
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XP_008440442.1 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Cucumis melo]2.86e-17898.48Show/hide
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XP_038883701.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Benincasa hispida]4.49e-16893.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJS8 Homeobox-leucine zipper protein1.02e-18099.62Show/hide
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A0A1S3B144 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.38e-17898.48Show/hide
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A0A5A7T2R8 Homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.38e-17898.48Show/hide
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A0A6J1GGZ5 homeobox-leucine zipper protein HAT223.27e-15086.52Show/hide
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A0A6J1IM38 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like3.12e-14885.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XE76 Homeobox-leucine zipper protein HOX191.8e-5456.57Show/hide
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A2Z1U1 Homeobox-leucine zipper protein HOX119.4e-5172.92Show/hide
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P46603 Homeobox-leucine zipper protein HAT96.1e-7461.62Show/hide
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        LQKE+QELK LKL QP +M MPA+TLT CPSCERIGGG     G G              AKG FSI++KP F+  FT PSAAC
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P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT228.7e-8164.18Show/hide
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            EE  E    SRVSD  +DE+G +ARKKLRLTK+QSALLE++FKLHSTLNPKQKQALA +LNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCET
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Q8GRL4 Homeobox-leucine zipper protein HOX191.8e-5456.57Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22800.1 Homeobox-leucine zipper protein family4.3e-7561.62Show/hide
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        LQKE+QELK LKL QP +M MPA+TLT CPSCERIGGG     G G              AKG FSI++KP F+  FT PSAAC
Subjt:  LQKELQELKALKLAQPLFMQMPAATLTMCPSCERIGGGAATVNGDG-------------NAKGPFSIATKPRFYKAFTKPSAAC

AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 45.3e-4963.79Show/hide
Query:  SPHSAISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKAS-----SRVSDEDEDGSN---ARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQ
        SP+SA+SS SG++        G+E E E+AS          +DEDG N   +RKKLRL+K+Q+ +LEE+FK HSTLNPKQK ALA +LNLR RQVEVWFQ
Subjt:  SPHSAISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKAS-----SRVSDEDEDGSN---ARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQ

Query:  NRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQM-PAATLTMCPSCERIGGGAATV
        NRRARTKLKQTEVDCE+LKRCC+ LT+ENRRLQKE+ EL+ALKL+  L+M M P  TLTMCPSCER+   AATV
Subjt:  NRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQM-PAATLTMCPSCERIGGGAATV

AT4G16780.1 homeobox protein 26.3e-5066.67Show/hide
Query:  SPHSAISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKASSRVSDEDEDGSNARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKL
        SP+S +SS +G R +RE D        +   SR   +DEDG N+RKKLRL+K+QSA+LEE+FK HSTLNPKQKQALA +L LR RQVEVWFQNRRARTKL
Subjt:  SPHSAISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKASSRVSDEDEDGSNARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKL

Query:  KQTEVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQM-PAATLTMCPSCERI
        KQTEVDCEFL+RCCE LT+ENRRLQKE+ EL+ALKL+   +M M P  TLTMCPSCE +
Subjt:  KQTEVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQM-PAATLTMCPSCERI

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family6.2e-8264.18Show/hide
Query:  MGFDDLSNTSLLLGLGLT-LPSNPPHLISQKPKKPLDLLCFPPPESEPSLTLGLS----TVDTYPSETPDLSRQPSPHSAISSFSGSRVKRERDVSG---
        MG DD  NT L+LGLGL+  P+N  H I    KK    +       +PSLTL LS     + T       + RQ S HS ISSFS  RVKRER++SG   
Subjt:  MGFDDLSNTSLLLGLGLT-LPSNPPHLISQKPKKPLDLLCFPPPESEPSLTLGLS----TVDTYPSETPDLSRQPSPHSAISSFSGSRVKRERDVSG---

Query:  ----EEIEEEKASSRVSD--EDEDGSNARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCET
            EE  E    SRVSD  +DE+G +ARKKLRLTK+QSALLE++FKLHSTLNPKQKQALA +LNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCET
Subjt:  ----EEIEEEKASSRVSD--EDEDGSNARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCET

Query:  LTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQMPAATLTMCPSCERIGGGA----ATVNGDGNAKGPFSIATKPRFYKAFTKPSAAC
        LTDENRRLQKELQ+LKALKL+QP +M MPAATLTMCPSCER+GGG      T   +  AKG FSI TKPRFY  FT PSAAC
Subjt:  LTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQMPAATLTMCPSCERIGGGA----ATVNGDGNAKGPFSIATKPRFYKAFTKPSAAC

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana7.4e-5166.88Show/hide
Query:  ISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKASSRVSDEDEDGSN--ARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQT
        I S+   R   +RD+   + E E+++SR S+ED D  N   RKKLRL+K+QSA LE+SFK HSTLNPKQK ALA +LNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQT
Subjt:  ISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKASSRVSDEDEDGSN--ARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQT

Query:  EVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQMPAATLTMCPSCERIGGGAA
        EVDCE+LKRCCE+LT+ENRRLQKE++EL+ LK + P +MQ+PA TLTMCPSCER+   AA
Subjt:  EVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQMPAATLTMCPSCERIGGGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTTGATGATCTTTCTAATACAAGCCTTCTTCTTGGTTTGGGATTAACACTTCCCTCTAATCCTCCTCATCTAATTTCTCAAAAACCCAAGAAGCCACTCGATTT
GCTCTGTTTTCCCCCTCCTGAATCCGAGCCCTCCTTAACTTTGGGCCTTTCCACCGTCGATACCTACCCTTCTGAAACCCCTGATTTGTCTCGCCAACCCTCGCCTCACA
GTGCGATTTCTTCCTTCTCCGGAAGCAGGGTCAAACGTGAAAGAGATGTTTCCGGTGAAGAGATTGAAGAGGAGAAAGCTTCTTCTCGTGTCAGCGATGAAGATGAAGAT
GGTTCTAATGCTAGAAAAAAACTTAGACTAACTAAAGAACAATCGGCCCTATTGGAGGAGAGCTTTAAACTTCACAGTACTCTTAACCCTAAGCAAAAGCAAGCCTTAGC
TAGCGAGTTAAATCTCCGGCCTCGACAAGTTGAAGTTTGGTTCCAGAATAGGAGAGCCAGGACAAAGCTTAAGCAAACAGAGGTAGATTGCGAGTTTCTAAAGAGATGCT
GCGAAACGCTAACGGACGAAAACAGGAGGCTACAAAAAGAGCTACAAGAACTGAAAGCCTTGAAACTAGCGCAGCCACTGTTCATGCAAATGCCGGCGGCGACACTCACC
ATGTGCCCGTCTTGTGAGCGGATCGGCGGTGGCGCCGCCACGGTTAACGGCGACGGAAACGCCAAGGGCCCATTTTCGATAGCTACCAAGCCCCGGTTTTACAAAGCCTT
CACCAAGCCTTCGGCTGCTTGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTTTGATGATCTTTCTAATACAAGCCTTCTTCTTGGTTTGGGATTAACACTTCCCTCTAATCCTCCTCATCTAATTTCTCAAAAACCCAAGAAGCCACTCGATTT
GCTCTGTTTTCCCCCTCCTGAATCCGAGCCCTCCTTAACTTTGGGCCTTTCCACCGTCGATACCTACCCTTCTGAAACCCCTGATTTGTCTCGCCAACCCTCGCCTCACA
GTGCGATTTCTTCCTTCTCCGGAAGCAGGGTCAAACGTGAAAGAGATGTTTCCGGTGAAGAGATTGAAGAGGAGAAAGCTTCTTCTCGTGTCAGCGATGAAGATGAAGAT
GGTTCTAATGCTAGAAAAAAACTTAGACTAACTAAAGAACAATCGGCCCTATTGGAGGAGAGCTTTAAACTTCACAGTACTCTTAACCCTAAGCAAAAGCAAGCCTTAGC
TAGCGAGTTAAATCTCCGGCCTCGACAAGTTGAAGTTTGGTTCCAGAATAGGAGAGCCAGGACAAAGCTTAAGCAAACAGAGGTAGATTGCGAGTTTCTAAAGAGATGCT
GCGAAACGCTAACGGACGAAAACAGGAGGCTACAAAAAGAGCTACAAGAACTGAAAGCCTTGAAACTAGCGCAGCCACTGTTCATGCAAATGCCGGCGGCGACACTCACC
ATGTGCCCGTCTTGTGAGCGGATCGGCGGTGGCGCCGCCACGGTTAACGGCGACGGAAACGCCAAGGGCCCATTTTCGATAGCTACCAAGCCCCGGTTTTACAAAGCCTT
CACCAAGCCTTCGGCTGCTTGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFDDLSNTSLLLGLGLTLPSNPPHLISQKPKKPLDLLCFPPPESEPSLTLGLSTVDTYPSETPDLSRQPSPHSAISSFSGSRVKRERDVSGEEIEEEKASSRVSDEDED
GSNARKKLRLTKEQSALLEESFKLHSTLNPKQKQALASELNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCETLTDENRRLQKELQELKALKLAQPLFMQMPAATLT
MCPSCERIGGGAATVNGDGNAKGPFSIATKPRFYKAFTKPSAAC