| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAE8647621.1 hypothetical protein Csa_003197 [Cucumis sativus] | 5.93e-164 | 100 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_016899368.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo] | 4.91e-157 | 97.13 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR+HANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG DRGS RYRGGG SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_022950652.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucurbita moschata] | 2.17e-139 | 92.28 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-EHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVE
MAD HRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSR PRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR E+ NNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVE
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-EHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVE
Query: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRG
PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG +RGS RYRGG SFREDYG+RRSPRRSPYRG
Subjt: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRG
Query: AREYSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
AREYSPRHSPP YGGGRSRRDHSRSP PYSP GGSPDRRYPRGSR
Subjt: AREYSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_031743118.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 7.89e-166 | 100 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 5.61e-147 | 94.29 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR+HA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD+GYRG DRGS RYRGGG SFR+DYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSP-RHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSP RHSPPYGG RSRRDHSRSPP PPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSP-RHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 3.82e-166 | 100 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.38e-157 | 97.13 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR+HANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG DRGS RYRGGG SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A6J1BUT3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 | 4.47e-138 | 91.84 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR+HA N GNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG DRG RY GGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYP-RGSR
REYSP PYGG RSRR+HSRSP PYSPPYG SPDRRYP RG+R
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYP-RGSR
|
|
| A0A6J1GFF0 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.05e-139 | 92.28 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-EHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVE
MAD HRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSR PRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR E+ NNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVE
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-EHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVE
Query: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRG
PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG +RGS RYRGG SFREDYG+RRSPRRSPYRG
Subjt: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRG
Query: AREYSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
AREYSPRHSPP YGGGRSRRDHSRSP PYSP GGSPDRRYPRGSR
Subjt: AREYSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A6J1INV2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.05e-139 | 92.28 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-EHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVE
MAD HRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSR PRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR E+ NNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVE
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-EHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVE
Query: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRG
PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG +RGS RYRGG SFREDYG+RRSPRRSPYRG
Subjt: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRG
Query: AREYSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
AREYSPRHSPP YGGGRSRRDHSRSP PYSP GGSPDRRYPRGSR
Subjt: AREYSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 2.5e-21 | 43.2 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
R SRS S ++ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL E FSK G
Subjt: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG S YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
Query: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
GG G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 2.5e-21 | 43.2 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
R SRS S ++ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL E FSK G
Subjt: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG S YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
Query: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
GG G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| P62997 Transformer-2 protein homolog beta | 2.5e-21 | 43.2 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
R SRS S ++ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL E FSK G
Subjt: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG S YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
Query: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
GG G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 2.5e-21 | 43.2 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
R SRS S ++ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL E FSK G
Subjt: RYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG S YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRGGDRG-------SSRYRGG
Query: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
GG G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 8.7e-35 | 48.74 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
M+ R RYS S SP+ + R RS SRS RS +RS S A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWKAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGGDRGSSRYRG----GGGSFREDYGYR
TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG YLGL++ R S R SR R G S+ YG R
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGGDRGSSRYRG----GGGSFREDYGYR
Query: -RSPRRSP-YRGAREYSPRHSP-PYGGGRSRRDHSRSP
RS SP YR R YSP SP P RRD S SP
Subjt: -RSPRRSP-YRGAREYSPRHSP-PYGGGRSRRDHSRSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-63 | 64.29 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVAS
MAD R+R SRSPSP K A SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PR S SRGRSRSRSRG E NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPR
CFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+RDS G Y R+DY RRSPR
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPR
Query: RSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
R+YSPR RS H RSP S +RRY PRGSR
Subjt: RSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.3e-65 | 64.29 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVAS
MAD R+R SRSPSP K A SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PR S SRGRSRSRSRGR NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPR
CFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+RDS G Y R+DY RRSPR
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGGDRGSSRYRGGGGSFREDYGYRRSPR
Query: RSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
R+YSPR RS H RSP S +RRY PRGSR
Subjt: RSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.0e-47 | 74.83 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVAS
MAD R+R SRSPSP K A SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PR S SRGRSRSRSRGR NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
CFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
|
| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.2e-43 | 67.9 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
MAD R+R SRSPSP K A SRSRSRSRSRSRP RSRSRS RP SPSR RSRSRSRG E NPG TLYVTGLSTRVT+
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
Query: RDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
+DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: RDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
|
| AT4G35785.5 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.2e-43 | 67.9 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
MAD R+R SRSPSP K A SRSRSRSRSRSRP RSRSRS RP SPSR RSRSRSRG E NPG TLYVTGLSTRVT+
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSPWK--APSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGREHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
Query: RDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
+DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: RDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
|
