; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G247 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G247
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationctg1:5580706..5583834
RNA-Seq ExpressionCucsat.G247
SyntenyCucsat.G247
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB2628373.1 ras-related protein RABD1-like [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]9.97e-11797.69Show/hide
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XP_004133726.1 ras-related protein RABD1 [Cucumis sativus]8.56e-11898.84Show/hide
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XP_016715138.2 ras-related protein RABD1 [Gossypium hirsutum]2.01e-11697.11Show/hide
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XP_021618525.1 ras-related protein RABD1-like [Manihot esculenta]2.01e-11697.69Show/hide
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XP_039015078.1 ras-related protein RABD1-like [Hibiscus syriacus]7.02e-11798.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein4.14e-11898.84Show/hide
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A0A4D9C0C5 Uncharacterized protein7.80e-11892.02Show/hide
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A0A5D2MSE2 Uncharacterized protein9.74e-11797.11Show/hide
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A0A5N5HP04 Ras-related protein RABD1-like4.83e-11797.69Show/hide
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A0A6A2ZI07 GTP-binding protein YPTM13.40e-11798.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM11.4e-8185.47Show/hide
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P62820 Ras-related protein Rab-1A3.5e-8078.65Show/hide
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        QWL EIDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVVD  TAK FAD LGIPFLETSAK++TNVEQ+F+TMAAEIKK +         EK N   QST
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P62821 Ras-related protein Rab-1A3.5e-8078.65Show/hide
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        QWL EIDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVVD  TAK FAD LGIPFLETSAK++TNVEQ+F+TMAAEIKK +         EK N   QST
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P62822 Ras-related protein Rab-1A3.5e-8078.65Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD13.1e-8485.96Show/hide
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        QWL+EIDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV T+T +A ADELGIPFLETSAKDS NVEQAFLT+A EIKK +  + N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 51.0e-7981.25Show/hide
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        QWL+EIDRYA+D+V KLLVGNK DL EN+ +  +TAKAFADE+GIPF+ETSAKD+TNVEQAF+ M+A IK+ +  +
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E8.9e-6365.52Show/hide
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +A ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+ + E
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein2.2e-8585.96Show/hide
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        QWL+EIDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV T+T +A ADELGIPFLETSAKDS NVEQAFLT+A EIKK +  + N
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C5.6e-8182.39Show/hide
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        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVV T+TAKAFADELGIPFLETSAK++TNVE+AF+ M A IK  +  +
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.4e-7981.82Show/hide
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        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV T+TAKAFADELGIPFLETSAK++TNVE+AF+ M A IK  +  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCAACGAATATGATTATTTGTTCAAGCTCTTGCTAATCGGCGACTCTTCCGTTGGAAAATCTTGCCTTCTTCTCAGATTTGCGGATGATTCTTATGTGGATAGCTA
TATAAGTACAATTGGAGTTGATTTCAAAATCAGAACTGTGGAACTGGATGGGAAGACCATTAAGCTCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAGGAGAGATTCAGGACTATAA
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AATGATAGTGTATGCAAGCTTTTAGTAGGAAATAAGTGTGATTTAGTTGAGAACAAGGTTGTTGACACGCAGACAGCGAAGGCATTTGCAGACGAGCTCGGAATCCCTTT
TCTAGAGACGAGTGCAAAAGACTCGACGAACGTGGAGCAAGCTTTCTTAACTATGGCTGCTGAAATAAAGAAAAACATCGTTGAGAAATTCAATAGGGTGTTTCAATCAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NDSVCKLLVGNKCDLVENKVVDTQTAKAFADELGIPFLETSAKDSTNVEQAFLTMAAEIKKNIVEKFNRVFQSTCLSGKWTFTIIGLMLNLSLIISFLTFQNVY