; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G2752 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G2752
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionExtensin
Genome locationctg1041:552597..554006
RNA-Seq ExpressionCucsat.G2752
SyntenyCucsat.G2752
Gene Ontology termsGO:0009664 - plant-type cell wall organization (biological process)
GO:0005199 - structural constituent of cell wall (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646187.1 hypothetical protein Csa_015739 [Cucumis sativus]9.40e-92100Show/hide
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KAG6592187.1 Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.78e-5876.61Show/hide
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        PPPP+Y SPPPPVY  PPPP+  H PPP VY SPPPPVY SPP P+Y SPPP VYHSPPPPVY SPPPPVY
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KAG6592189.1 hypothetical protein SDJN03_14535, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.28e-5878.05Show/hide
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XP_004139745.3 extensin-3 [Cucumis sativus]1.60e-5877.78Show/hide
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        SPPPPVY  PPPP+       + H PPP VY SPPPPVYKSPP P+Y SPPP VYHSPPPPVY SPPPPVY
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XP_011659118.2 LOW QUALITY PROTEIN: extensin-1 [Cucumis sativus]1.03e-90100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9I8 Uncharacterized protein1.19e-8092.73Show/hide
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        SPPPP+YS PPPP+  H PPP VYSSPPPPVYKSPP PIYSSPPP V+ HSPPPPVYSSPPPPVY
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A0A6D2HCM3 Extensin_2 domain-containing protein1.09e-5475.14Show/hide
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        SPPPP+Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPPVY SPPPP Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPPVY  KSPPPP+Y SPPPPV+        HSPPPPVY 
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        SPPPP+Y SPPPPVY  PPPP+  +  PPP VY SPPPPVY SPP P+Y SPPP VYHSPPPPVY SPPPPVY
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A0A6J1F6U4 extensin-1-like6.18e-5879.14Show/hide
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        SPPPP+Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPPVY SPPPP+Y SPPPP++ HSPPPPVY SPPPPVY SPPPP+Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPP+Y S
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        PPPPVY  PPPP+  H PPP VY SPPPPVY SPP P+Y SPPP VYHSPPPPVY SPPPPVY
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A0A6J1IP49 extensin-3-like8.82e-5781.71Show/hide
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Query:  SPPPPVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY
        SPPPPVYS PPPP+  +FPPP VY SPPPPVY SPP P+Y SPPP VY SPPPPVY SPPPPVY
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A0A7J6XCN3 Extensin2.02e-5776.88Show/hide
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        KSPPPP+Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPPVY SPPPP+Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPPVYKSPPPP+Y SPPPPV+ HSPPPPVY SPPPP+  
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        Y SPPPPVY  PPPP+       + H PPP VY SPPPPVYKSPP P+Y SPPP VYHSPPPPVY SPPPPVY
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38913 Extensin-12.9e-3463.64Show/hide
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        KSPPPP+Y SPPPPV  H  PPPVY SPPPPV    PPP+Y SPPPPV  H  PPPVY SPPPPV    PPP+Y SPPPPV  +S PPPVY SP      
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Query:  --PPPIYKSPPPPV--YSPP-----PPPLMCHFPPPLVYSSP--------PPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY
          PPP+YKSPPPPV  YSPP     PPP + H+ PP VY SP        PPPVYKSPP P++ SPPP+VYHSPPPPV+ SPPP VY
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Q9FS16 Extensin-38.5e-2660.32Show/hide
Query:  SPPPP----IYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPP----VYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPP----VYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDH---SP
        SPPPP    +Y SPPPPV  H  PPPVY SPPPP    VYKSPPPP+    PPPV+ HSPPPP    VY SPPPPV    PPP+Y SPPPP   +   SP
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Query:  PPPVYSSPPPPIYKSPPPP----VYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPP----VYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPP----VYSSPPPPV
        PPPV    PPP+Y SPPPP    VY  PPPP+  H+ PP VY SPPPP    VYKSPP P+    PP VYHSPPPP    VY SPPPPV
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Q9LJ64 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 11.6e-2768.9Show/hide
Query:  SPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKS
        SPPPP++ SPPPP+  HSPPPPVY SPPPPV+  PPPP++ SPPPPV  HSPPPPV+ SPPPPV+ SPPPP++ SPPPPV  HSPPPPV S PPPP++  
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Query:  PPP-PVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY
        PPP P+YSPPPPP+  H PPP V+S PPPPV+ SPP P++S PPP+  HSPPPPV+ SPPPPV+
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Q9M1G9 Extensin-21.5e-2259.28Show/hide
Query:  KSPPPP-IYSSPPPPVHDHS--------PPPPVYSSPPPPV--------YKSPPPP-IYSSPPPP-------VHDHSPPPP-VYSSPPPPVYKSPPPPIY
        KSPPPP +YSSPPPP +  S        PPP VYSSPPPP         YKSPPPP +YSSPPPP       V+  SPPPP VYSSPPPP Y   P   Y
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Query:  SSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKSPPPP-VYSPPPPPLMCHFPPPLVY--SSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPP-VYSSPPPPVY
         SPPPP    SPPPP YS  P   YKSPPPP VYS PPPP   + P P VY  S PPP VY SPP P YS  P + Y SPPPP VYSSPPPP Y
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Q9XIL9 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 31.1e-3070.24Show/hide
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        PPPP+YS  PPPPV+   PPPPVYS PPPP   SPPPP++ SPPPPVH      HSPPPPV+ SPPPPV+ SPPPP+YS PPPPV  HSPPPPV+ SPPP
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Query:  PIYKSPPPPVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY
        P++ SPPPPVYSPPPPP + H PPP V+ SPPPPV+ SPP P+YS PPP VY  PPPPV S PPPPVY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein1.8e-3168.18Show/hide
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        KSPPPP  +YSSPPPP  V+   PPPP VYSSPPPP  VYKSPPPP  +YSSPPPP  V+   PPPP VYSSPPPP  VYKSPPPP  +YSSPPPP  V+
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Query:  DHSPPPP-VYSSPPPP--IYKSPPPPVY---SPPPPPLMCHF--PPPLVYSSPPPP--VYKSPPLP--IYSSPP--PLVYHSPPPP--VYSSPPPPVY
           PPPP VYSSPPPP  +YKSPPPP Y   SPPPPP +     PPP VY+SPPPP  VYKSPP P  +YSSPP  P VY SPPPP  VYSSPPPP Y
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AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein3.4e-3064.06Show/hide
Query:  SPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPP--VYKSPPPP--IYSSPPPPVHDHSPPPP---VYSSPPPP--VYKSPPPP--IYSSPPPPVHDHSPPPP-
        SPPP +Y+SP PP + + PPP +YSSPPPP  VY SPPPP  +Y+SPPPP + +S PPP   VY SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP + +S PPP 
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Query:  --VYSSPPPP--IYKSPPPP--VYSPPPPPLMCHF---PPPLVYSSPPPP--VYKSPPLP--IYSS--PPPLVYHSPPPP--VYSSPPPPVY
          VYSSPPPP  +YKSPPPP  VYSPPPPP   +    PPP VYSSPPPP  VYKSPP P  +YSS  PPP VY SPPPP  VYSSPPPP Y
Subjt:  --VYSSPPPP--IYKSPPPP--VYSPPPPPLMCHF---PPPLVYSSPPPP--VYKSPPLP--IYSS--PPPLVYHSPPPP--VYSSPPPPVY

AT2G15880.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein8.1e-3270.24Show/hide
Query:  PPPPIYS-SPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHD-----HSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPP
        PPPP+YS  PPPPV+   PPPPVYS PPPP   SPPPP++ SPPPPVH      HSPPPPV+ SPPPPV+ SPPPP+YS PPPPV  HSPPPPV+ SPPP
Subjt:  PPPPIYS-SPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHD-----HSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPP

Query:  PIYKSPPPPVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY
        P++ SPPPPVYSPPPPP + H PPP V+ SPPPPV+ SPP P+YS PPP VY  PPPPV S PPPPVY
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AT2G43150.1 Proline-rich extensin-like family protein4.0e-3165.87Show/hide
Query:  PPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKSPPP
        P  YSSPPPP    SPPPPV S PPP  YKSPPPP+  SPPPP + HSPPPPV S PPP VY SPPPP+  SPPPP + HSPPPPV S PPP  Y SPPP
Subjt:  PPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKSPPP

Query:  PVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPV--------YSSPPPPV
        PV S PPPP   H PPP V S PPP  Y SPP P+ S PPP  YHSPPPPV        YSSPPPPV
Subjt:  PVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPV--------YSSPPPPV

AT3G19020.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.1e-2868.9Show/hide
Query:  SPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKS
        SPPPP++ SPPPP+  HSPPPPVY SPPPPV+  PPPP++ SPPPPV  HSPPPPV+ SPPPPV+ SPPPP++ SPPPPV  HSPPPPV S PPPP++  
Subjt:  SPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKS

Query:  PPP-PVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY
        PPP P+YSPPPPP+  H PPP V+S PPPPV+ SPP P++S PPP+  HSPPPPV+ SPPPPV+
Subjt:  PPP-PVYSPPPPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAATCTCCTCCACCACCTATTTATTCCTCTCCTCCACCTCCGGTGCATGATCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATAAATCTCCTCC
ACCACCTATTTATTCCTCTCCTCCACCTCCGGTGCATGATCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATAAATCTCCTCCACCACCTATTT
ATTCCTCTCCTCCACCTCCGGTGCATGATCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTATTTATAAATCTCCTCCACCACCTGTTTATTCCCCTCCT
CCACCTCCTCTGATGTGCCACTTTCCCCCTCCACTAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATAAATCTCCTCCACTACCTATTTATTCCTCTCCTCCACCTCTGGT
GTACCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATCTCCTCCACCACCTATTTATTCCTCTCCTCCACCTCCGGTGCATGATCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATAAATCTCCTCC
ACCACCTATTTATTCCTCTCCTCCACCTCCGGTGCATGATCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATAAATCTCCTCCACCACCTATTT
ATTCCTCTCCTCCACCTCCGGTGCATGATCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTATTTATAAATCTCCTCCACCACCTGTTTATTCCCCTCCT
CCACCTCCTCTGATGTGCCACTTTCCCCCTCCACTAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATAAATCTCCTCCACTACCTATTTATTCCTCTCCTCCACCTCTGGT
GTACCACTCTCCTCCTCCACCAGTCTACTCATCTCCTCCACCTCCTGTTTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
KSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPVYKSPPPPIYSSPPPPVHDHSPPPPVYSSPPPPIYKSPPPPVYSPP
PPPLMCHFPPPLVYSSPPPPVYKSPPLPIYSSPPPLVYHSPPPPVYSSPPPPVY