; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G2753 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G2753
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionExtensin like
Genome locationctg1041:597864..599000
RNA-Seq ExpressionCucsat.G2753
SyntenyCucsat.G2753
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068050.1 hypothetical protein E6C27_scaffold4741G00020 [Cucumis melo var. makuwa]5.00e-4257.21Show/hide
Query:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPP----------PYKRKSP
        MQGK+GPP+M+SLVI+VLVVALSLSY TT QA++DSYSSTLTF DHD                             +KSPPPP          P KRKSP
Subjt:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPP----------PYKRKSP

Query:  PPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKS-----PPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSP
        PPPPPKR+EYLSPPPPP  KK      PPPPPK+  PP P+KSPPPPP +K DNKSPPPPPP+K +++ S PPPPPKK E++ Y               P
Subjt:  PPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKS-----PPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSP

Query:  PPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN
        PPPPP+KHKDKS LHHDPLTIN
Subjt:  PPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN

KAB2635235.1 extensin-3-like [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]1.10e-1763.77Show/hide
Query:  HYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKKS------PPPPPKK-----SPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEY
        HYKSPPPPP K+    KSPPPPPPK+  +   PPPPPPKK      SPPPPPKK       PPPPPKK     SPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  H  
Subjt:  HYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKKS------PPPPPKK-----SPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEY

Query:  SSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK
        S PPPPPKK  H Y SPPPPP K  H + SPPPPPPKK
Subjt:  SSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK

KAG8633302.1 hypothetical protein MANES_18G090116v8 [Manihot esculenta]3.09e-1760.58Show/hide
Query:  YKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDNK--SPPPPPPKKDEHEYSSP
        YKSPPPPP    YK KSPPPPP +  +Y SPPPPPP +    KSPPPPPK     KSPPPPPK     KSPPPPP K+  K  SPPPPP +K+ ++Y SP
Subjt:  YKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK----KSPPPPPK-----KSPPPPPK-----KSPPPPPKKQDNK--SPPPPPPKKDEHEYSSP

Query:  PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHK
        PPPPK+ EH  Y  PPPP K+ ++Y SPPPPPP  HK
Subjt:  PPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHK

XP_011659754.2 extensin-3-like [Cucumis sativus]3.28e-11699.03Show/hide
Query:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEY
        MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDH  DHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEY
Subjt:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEY

Query:  LSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH
        LSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH
Subjt:  LSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH

Query:  DPLTIN
        DPLTIN
Subjt:  DPLTIN

XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]6.59e-1965.25Show/hide
Query:  HHHYKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRD-EYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKKS------PPPPPKK-----SPPPPPKKQDNK--SPPPPPPKKDEH
        H+ YKSPPPPP    YK KSPPPPPPK+  EY SPPPPPP      KSPPPPPKK       PPPPPKK     SPPPPP K   K  SPPPPPPKK  +
Subjt:  HHHYKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRD-EYLSPPPPPPPK----KSPPPPPKKS------PPPPPKK-----SPPPPPKKQDNK--SPPPPPPKKDEH

Query:  EYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        EY SPPPPP K  +EY SPPPPP K  +EY SPPPPPPKKH
Subjt:  EYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251U7B1 Putative extensin 31.46e-1557.04Show/hide
Query:  YKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK------KSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDE--
        YKSPPPPP    Y  KSPPPPPPK       PPPPPPKKSPPPPPK        PPPPPKKSPPPPPK       PPPPP K+ + Y SPPPPP K    
Subjt:  YKSPPPPP----YKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK------KSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDE--

Query:  ------HEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH
              + Y SPPPPP K+ + Y SPPPPPPKK       HH
Subjt:  ------HEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHH

A0A2P5EUH3 Uncharacterized protein1.03e-1564.1Show/hide
Query:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK---KSPPPPPK--KSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPP
        Y SPPPPPY  KSPPPPPP   EY          KSPPPPPK    SPPPPP   KSPPPPP K   KSPPPPPPK D+++Y SPPPPP KD+++Y SPP
Subjt:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPK---KSPPPPPK--KSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPP

Query:  PPPKKDEHEYSSPPPPP
        PPPK D+++Y SPPPPP
Subjt:  PPPKKDEHEYSSPPPPP

A0A5A7VLF0 Uncharacterized protein2.42e-4257.21Show/hide
Query:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPP----------PYKRKSP
        MQGK+GPP+M+SLVI+VLVVALSLSY TT QA++DSYSSTLTF DHD                             +KSPPPP          P KRKSP
Subjt:  MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPP----------PYKRKSP

Query:  PPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKS-----PPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSP
        PPPPPKR+EYLSPPPPP  KK      PPPPPK+  PP P+KSPPPPP +K DNKSPPPPPP+K +++ S PPPPPKK E++ Y               P
Subjt:  PPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKS-----PPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSP

Query:  PPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN
        PPPPP+KHKDKS LHHDPLTIN
Subjt:  PPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN

A0A5N5I4V5 Extensin-3-like5.30e-1863.77Show/hide
Query:  HYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKKS------PPPPPKK-----SPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEY
        HYKSPPPPP K+    KSPPPPPPK+  +   PPPPPPKK      SPPPPPKK       PPPPPKK     SPPPPPKK  + KSPPPPPPKK  H  
Subjt:  HYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK------SPPPPPKKS------PPPPPKK-----SPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEY

Query:  SSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK
        S PPPPPKK  H Y SPPPPP K  H + SPPPPPPKK
Subjt:  SSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKK

A0A7I8JE52 Hypothetical protein2.45e-1560.42Show/hide
Query:  HHHYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRDEYL-SPPPPPPPK-----KSPPPPPKKS--------PPPPPK-----KSPPPPPKKQDN--KSPPPPPPKK
        H++YKSPPPPP K+    KSPPPPPPK+  Y  SPPPPPPPK     KSPPPPP K         PPPPPK     KSPPPPP K+    KSPPPPPP K
Subjt:  HHHYKSPPPPPYKR----KSPPPPPPKRDEYL-SPPPPPPPK-----KSPPPPPKKS--------PPPPPK-----KSPPPPPKKQDN--KSPPPPPPKK

Query:  DEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        + + Y SPPPPP K  + Y SPPPPP   EH YS PPPPPPK+H
Subjt:  DEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.8e-0459.46Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD
        SPPPP Y   SPPPPPP      SPPPPPPP   PPPPP  SPPPPP   PPPPP       SPPPPPP      YS PPPPP       YSPPPPP   
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD

Query:  EHEYSSPPPPP
           YSSPPPPP
Subjt:  EHEYSSPPPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein2.5e-0659.5Show/hide
Query:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY
        Y SPPPPPY  KSPPPPP     Y SPPPPP   KSPPPPP    SPPPPP   KSPPPPP      SPPPPP     P    + YSSPPPPP    + Y
Subjt:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY

Query:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP
         SPPPPP    + YSSPPPPP
Subjt:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein2.5e-0659.5Show/hide
Query:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY
        Y SPPPPPY  KSPPPPP     Y SPPPPP   KSPPPPP    SPPPPP   KSPPPPP      SPPPPP     P    + YSSPPPPP    + Y
Subjt:  YKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPP--KKSPPPPP--KKSPPPPPKKQDNKSPPPPP-----PKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEY

Query:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP
         SPPPPP    + YSSPPPPP
Subjt:  YSPPPPPKKDEHEYSSPPPPP

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.3e-0559.46Show/hide
Query:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD
        SPPPP Y   SPPPPPP      SPPPPPPP   PPPPP  SPPPPP   PPPPP       SPPPPPP      YS PPPPP       YSPPPPP   
Subjt:  SPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPP-KKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKD

Query:  EHEYSSPPPPP
           YSSPPPPP
Subjt:  EHEYSSPPPPP

AT5G07740.1 actin binding9.0e-0454.92Show/hide
Query:  HHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK---SPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSP
        H   SPPPP Y   SPPPPPP    Y SPPPPPPP     SPPPPP   PPPP   SPPPPP    +  SPPPPPP    H  S PPPPP    H   +P
Subjt:  HHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPKK---SPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDN-KSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSP

Query:  PPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH
        PPPP    H  + PPPPPP  H
Subjt:  PPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGAAAAATGGGTCCTCCTGTAATGCTATCTCTTGTTATTGCAGTTTTGGTGGTGGCTCTAAGCCTATCGTATACAACAACTGCTCAAGCCCACCGGGATTCCTA
CTCTTCAACACTTACTTTCAACGATCACGATCATGACCACGATCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGATCACGATCACGATCACGATCACGATC
ATCACCATTACAAGTCTCCACCCCCACCTCCATACAAACGGAAATCCCCCCCTCCACCACCACCAAAGAGAGACGAATATCTCTCACCTCCACCACCTCCACCACCAAAA
AAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCACCACCACCACCAAAAAAGCAGGATAACAAGTCACCACCTCCACCGCCACCAAA
GAAAGACGAGCATGAGTACTCCTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTACTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAACATGAGTACTCCTCTC
CTCCACCACCACCGCCAAAGAAGCATAAGGACAAGTCAGCCCTCCACCACGATCCCCTCACGATTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAGGAAAAATGGGTCCTCCTGTAATGCTATCTCTTGTTATTGCAGTTTTGGTGGTGGCTCTAAGCCTATCGTATACAACAACTGCTCAAGCCCACCGGGATTCCTA
CTCTTCAACACTTACTTTCAACGATCACGATCATGACCACGATCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGACCACGATCACGATCACGATCACGATCACGATC
ATCACCATTACAAGTCTCCACCCCCACCTCCATACAAACGGAAATCCCCCCCTCCACCACCACCAAAGAGAGACGAATATCTCTCACCTCCACCACCTCCACCACCAAAA
AAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCTCCACCACCGCCAAAAAAGTCTCCACCACCACCACCAAAAAAGCAGGATAACAAGTCACCACCTCCACCGCCACCAAA
GAAAGACGAGCATGAGTACTCCTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAGCATGAGTACTACTCTCCTCCACCGCCACCAAAGAAAGACGAACATGAGTACTCCTCTC
CTCCACCACCACCGCCAAAGAAGCATAAGGACAAGTCAGCCCTCCACCACGATCCCCTCACGATTAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGKMGPPVMLSLVIAVLVVALSLSYTTTAQAHRDSYSSTLTFNDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHDHHHYKSPPPPPYKRKSPPPPPPKRDEYLSPPPPPPPK
KSPPPPPKKSPPPPPKKSPPPPPKKQDNKSPPPPPPKKDEHEYSSPPPPPKKDEHEYYSPPPPPKKDEHEYSSPPPPPPKKHKDKSALHHDPLTIN