; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G3031 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G3031
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationctg1041:6760653..6764034
RNA-Seq ExpressionCucsat.G3031
SyntenyCucsat.G3031
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase4.69e-232100Show/hide
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase1.05e-22196.7Show/hide
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase9.36e-22597.6Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase1.47e-18786.07Show/hide
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase6.73e-18685.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A7.3e-1638.94Show/hide
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        S       + RT+
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O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A8.9e-1431.16Show/hide
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        PSSSSS+ S+S  + +   P  +T           I         SS  +S+  + S+     D  +   + PLP  S   +LL S  F RL   ++  +
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         + +  + S    P +  K+++ A+P I++    L  D    CA+CK+ F+L+  A+++PC+H+YHPDCILPWL+  +SCP+CR +LP++D +D      
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Query:  SALLRARDLMHQEDS
        +A+    +   +EDS
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Q6AVN2 E3 ubiquitin-protein ligase SIRP11.2e-1540.5Show/hide
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        T+DD     Y+L +   L L QHLA+S  S        N   P  K +V A+PT+K+       + V+ C++C D   +  +AKQ+PC H +H  CILPW
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Query:  LSNHDSCPLCRFKLPSDDPSD
        L  H SCP+CRF+LPS++  D
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Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like4.3e-1629.68Show/hide
Query:  SATITATAAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSSLVCPHCLTDFIEHMDFTIPTSSSSISDNPNSSS---PPTD--------------S
        ++T +A AA E    ++C++C+ +VT+           S SSS+   CP C   F+E  ++  P  + S++ NPNSS    P  D              +
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Query:  DPSSFVF-------VDPLPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQHLADSSESD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--I
         PS   F       + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   
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Query:  KASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDRVRCRTS
        K+++ A+PT+KVT  +L  + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R + S
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Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF15.0e-1738.33Show/hide
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        P    L + L+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L       C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  SDDPSDRVRCRTSALLRARD
        S   S   +   +     R+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein9.4e-1944.23Show/hide
Query:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----DEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK++S++L     +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
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Query:  DPSD
           D
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AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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AT3G56580.3 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein9.0e-4641.09Show/hide
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        H DCI+PWLS+H+SCPLCRF+LP+         +   R+R    A + A     ++D  G+R  L  +ARRH  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTGTTTGCCCCCACTGCCTCACTGACTTCATCGAACACATGGATTTCACCATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTCCGACA
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CTCCGTCTTTTCCAGCACCTTGCAGATTCATCAGAGTCTGATTTCGTCCCATCTGTCCCTTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTAT
TAAAGTCACCTCCGCCTTGCTCGATGAAGACCCAGTTTTAATTTGTGCTATCTGTAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCTTGTTCTCATCTTT
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TGTGGATTCGTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTATGATGGAGAGTGGGGAACAGACCGACAGTGTTGAAACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTG
TAATTGTCAATAGCAATGGTGATGAAAATGGGTTTTTGGGAATGGATGGACCTATAACTGAGGATGCTGGGACTGTAGTTCAGGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTT
GTTTCTGCATAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ALLRARDLMHQEDSYGLRTTLELMARRHSSISSEGIHVDSFQSPTQFGVAMMESGEQTDSVETVSSVATDDGIVIVNSNGDENGFLGMDGPITEDAGTVVQDIGVSPSSF
VSA