; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G3310 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G3310
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionR3H-assoc domain-containing protein
Genome locationctg1041:4959293..4963159
RNA-Seq ExpressionCucsat.G3310
SyntenyCucsat.G3310
Gene Ontology termsGO:0009058 - biosynthetic process (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003824 - catalytic activity (molecular function)
InterPro domainsIPR025952 - R3H-associated N-terminal domain
IPR036867 - R3H domain superfamily
IPR039629 - R3H domain-containing protein 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008451376.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492685 [Cucumis melo]2.06e-16297.01Show/hide
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XP_011659335.1 uncharacterized protein LOC101217014 isoform X2 [Cucumis sativus]1.11e-16696.28Show/hide
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XP_022150187.1 uncharacterized protein LOC111018421 isoform X1 [Momordica charantia]9.46e-14589.91Show/hide
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XP_023515083.1 R3H domain-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.90e-14584.71Show/hide
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        DMDKEAK+IGV ENSSA++KGHIDADKMAFLNAWRRIE RTREALRRSF   LVE +EECIRSFISD+  +DVL +RVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDS T
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        V ESK +GS KMTRITRKKKAMVE+PNITLTHFLKMSKEGTW
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XP_038896192.1 R3H domain-containing protein 4 [Benincasa hispida]2.65e-15192.27Show/hide
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        F   NDPLNGDTDSR MSIEKKIEFLESLTGKVTNRKSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGDDVRPTTFSMTNA DWDKFRSIDMDKEAKII
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        GVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAW RIECRTREALRRSF  EL+EG+EECIRSFIS+T K DVL++RVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTV ESKN GS
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        +KMTRITRKKKAMVEVPNITLTHFLKMSKEGTW
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5V5 R3H-assoc domain-containing protein5.38e-16796.28Show/hide
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A0A1S3BS51 uncharacterized protein LOC1034926859.97e-16397.01Show/hide
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A0A6J1DA21 uncharacterized protein LOC111018421 isoform X14.58e-14589.91Show/hide
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A0A6J1HB10 R3H domain-containing protein 4-like6.74e-14584.71Show/hide
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        DMDKEAK+IGV ENSSA+R+GHIDADKMAFLNAWRRIE RTREALRRSF   LVE +EECIRSFISD+  +DVL +RVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDS T
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        V ESK SG  KMTRITRKKKAMVE+PNITLTHFLKMSKEGTW
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A0A6J1KSN3 R3H domain-containing protein 4-like3.90e-14484.3Show/hide
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Query:  DMDKEAKIIGVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVT
        DMDKEAK+IGV +NSSA+RKGHI+ADKMAFLNAWRRIE RTREALRRSF   LVE +EECIRSFISD+  +DVL +RVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDS T
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        V ESK SG  KMTRITRKKKAMVE+PNITLTHFLKMSKEGTW
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2KIL7 R3H domain-containing protein 44.7e-0427.32Show/hide
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        L  K   RKS +R  N + L+ L+    A      G  APP           + T  E W+ F +   +++ +++   E+   S A+R+G    +     
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Query:  --AFL--NAWRRIECRTREALRRS-FRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTV-LESK
          A+     ++RI  R R  L+RS   +E +E +EE +  F S    + V    + + F RLLLH +C++ +L S +  LE K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03250.1 unknown protein6.8e-8364.38Show/hide
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        L  DP  GDT  SRG+S+EKKIE LESL G+V+NR+SRRWLNDR+LMELVPRL+A+EIRGLFAPPPWGDDV P+ FS+TN  +WDKFR+IDMDKEA I+ 
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Query:  VFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTVLESKNSGSM
            SS ++KG +D DK+A LNAWRRI+CRTR+ALRRSF  EL+EGYE CI  FI +  + DVL ++VQDPFHRLLLHGVCE++NL S T  E     +M
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        K T I  KK     E P+I+L HFL+MSKEG W
Subjt:  KMTRITRKKKA-MVEVPNITLTHFLKMSKEGTW

AT1G03250.2 unknown protein6.3e-8162.76Show/hide
Query:  LFNDPLNGDTD-SRGMSIEKKIEFLESLTGKVTNRKSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGDDVRPTTFSMTNAEDWDKFRSIDMDKE-----
        L  DP  GDT  SRG+S+EKKIE LESL G+V+NR+SRRWLNDR+LMELVPRL+A+EIRGLFAPPPWGDDV P+ FS+TN  +WDKFR+IDMDKE     
Subjt:  LFNDPLNGDTD-SRGMSIEKKIEFLESLTGKVTNRKSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGDDVRPTTFSMTNAEDWDKFRSIDMDKE-----

Query:  -AKIIGVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTVLES
         A I+     SS ++KG +D DK+A LNAWRRI+CRTR+ALRRSF  EL+EGYE CI  FI +  + DVL ++VQDPFHRLLLHGVCE++NL S T  E 
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Query:  KNSGSMKMTRITRKKKA-MVEVPNITLTHFLKMSKEGTW
            +MK T I  KK     E P+I+L HFL+MSKEG W
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTTGAACGAGAAGGGAATCGTTTCCCCTTTTCCCCTCTTTAACGATCCACTCAATGGTGATACGGATTCTCGGGGTATGTCAATCGAGAAGAAGATAGAATTCTT
GGAGAGCTTGACTGGGAAGGTTACCAATAGGAAGTCTCGCAGATGGTTAAACGATCGTCTTTTGATGGAACTTGTTCCTCGTTTGAATGCTGAGGAAATTAGAGGGCTGT
TTGCTCCACCACCTTGGGGTGATGATGTACGGCCCACAACGTTCTCCATGACTAATGCAGAAGACTGGGACAAGTTCAGGAGTATTGACATGGATAAAGAGGCTAAGATC
ATTGGAGTCTTCGAGAACTCATCTGCTAAGAGAAAGGGTCATATTGATGCAGATAAAATGGCTTTCTTGAATGCTTGGCGTAGAATTGAATGTCGAACAAGGGAGGCTCT
TCGCCGTAGTTTTCGTGTGGAGCTTGTTGAAGGTTATGAGGAGTGCATAAGATCTTTTATTTCAGACACTTGTAAAGAAGATGTCTTAATCATGCGAGTTCAAGATCCAT
TCCACAGATTATTGCTACATGGAGTTTGTGAGTTCTACAACTTGGACTCTGTGACCGTTCTCGAGTCGAAGAACAGTGGCTCTATGAAAATGACTCGGATAACAAGGAAG
AAGAAGGCCATGGTTGAGGTCCCAAATATAACTCTGACCCATTTCCTTAAAATGTCCAAAGAAGGAACATGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCTTGAACGAGAAGGGAATCGTTTCCCCTTTTCCCCTCTTTAACGATCCACTCAATGGTGATACGGATTCTCGGGGTATGTCAATCGAGAAGAAGATAGAATTCTT
GGAGAGCTTGACTGGGAAGGTTACCAATAGGAAGTCTCGCAGATGGTTAAACGATCGTCTTTTGATGGAACTTGTTCCTCGTTTGAATGCTGAGGAAATTAGAGGGCTGT
TTGCTCCACCACCTTGGGGTGATGATGTACGGCCCACAACGTTCTCCATGACTAATGCAGAAGACTGGGACAAGTTCAGGAGTATTGACATGGATAAAGAGGCTAAGATC
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AAGAAGGCCATGGTTGAGGTCCCAAATATAACTCTGACCCATTTCCTTAAAATGTCCAAAGAAGGAACATGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLNEKGIVSPFPLFNDPLNGDTDSRGMSIEKKIEFLESLTGKVTNRKSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGDDVRPTTFSMTNAEDWDKFRSIDMDKEAKI
IGVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFRVELVEGYEECIRSFISDTCKEDVLIMRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTVLESKNSGSMKMTRITRK
KKAMVEVPNITLTHFLKMSKEGTW