; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G3620 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G3620
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionRibosomal protein L37
Genome locationctg1047:176957..178430
RNA-Seq ExpressionCucsat.G3620
SyntenyCucsat.G3620
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001569 - Ribosomal protein L37e
IPR011331 - Ribosomal protein L37ae/L37e
IPR011332 - Zinc-binding ribosomal protein
IPR018267 - Ribosomal protein L37e, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141772.1 60S ribosomal protein L37-3 [Cucumis sativus]9.68e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

XP_021609554.1 60S ribosomal protein L37-3 [Manihot esculenta]9.68e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

XP_021654586.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Hevea brasiliensis]9.68e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

XP_021892871.1 60S ribosomal protein L37-1 [Carica papaya]2.69e-5198.77Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRH+PRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

XP_027344789.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Abrus precatorius]9.68e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K941 Ribosomal protein L374.69e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

A0A1S3CGU0 Ribosomal protein L374.69e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

A0A251LJK8 Ribosomal protein L374.69e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

A0A5D3BYC5 Ribosomal protein L374.69e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

A0A6A6LIP3 Ribosomal protein L374.69e-52100Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P49166 60S ribosomal protein L37-A1.0e-2871.6Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGT SFGKR NK+HTLC RCGRRSFH+QK  C++C +PAA+ R YNW  KA RR TTGTGRMRYL+HV RRFK+GF+ G
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

Q43292 60S ribosomal protein L37-23.6e-3790.12Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        M KGTGSFGKRRNK+HTLCVRCGRRSFH+QKSRC+ACA+PAARKR YNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLR+VPRRFK+GFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

Q8LEM8 60S ribosomal protein L37-34.2e-3891.36Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNK+HTLCVRCGRRSFH+QKSRC+ACA+PAARKR YNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLR+VPRRFK+GFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

Q8LFH7 60S ribosomal protein L37-14.7e-3790.12Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNK+HTLCVRCGRRSFH+QKSRC+ACA+PAARKR YNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLR+VPRRFK+ FREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

Q962S7 60S ribosomal protein L371.8e-2872.84Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        M KGT SFGKRRNKTHTLC RCGR S+H+QKS+CA C +PAA+ R Y+WSVKA RRKTTGTGRMR+L+ V RRF++GF+EG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15250.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein3.3e-3890.12Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNK+HTLCVRCGRRSFH+QKSRC+ACA+PAARKR YNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLR+VPRRFK+ FREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

AT1G52300.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein2.5e-3890.12Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        M KGTGSFGKRRNK+HTLCVRCGRRSFH+QKSRC+ACA+PAARKR YNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLR+VPRRFK+GFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG

AT3G16080.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein3.0e-3991.36Show/hide
Query:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG
        MGKGTGSFGKRRNK+HTLCVRCGRRSFH+QKSRC+ACA+PAARKR YNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLR+VPRRFK+GFREG
Subjt:  MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAAGGGTACGGGCAGTTTTGGTAAGAGGAGGAACAAGACCCATACTCTCTGTGTGCGGTGTGGCCGCCGCAGCTTCCATCTCCAGAAGAGTCGTTGTGCAGCATG
TGCTTTTCCTGCTGCTCGCAAGCGCAAATATAACTGGAGTGTGAAGGCAATTAGAAGAAAGACAACCGGAACTGGAAGGATGAGGTACTTGCGCCATGTTCCGCGTAGAT
TCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTATGATGATATTTTGTTCATTGTTTATTAATATTAGAGCACAGATTTTGTTATATCAATTAGAACAGAATAGCACACTTCAGTTCCAA
CTGATTTATCAAAAACTTTACTTATGCTCTAATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAAGGGTACGGGCAGTTTTGGTAAGAGGAGGAACAAGACCCATACTCTCTGTGTGCGGTGTGGCCGCCGCAGCTTCCATCTCCAGAAGAGTCGTTGTGCAGCATG
TGCTTTTCCTGCTGCTCGCAAGCGCAAATATAACTGGAGTGTGAAGGCAATTAGAAGAAAGACAACCGGAACTGGAAGGATGAGGTACTTGCGCCATGTTCCGCGTAGAT
TCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTATGATGATATTTTGTTCATTGTTTATTAATATTAGAGCACAGATTTTGTTATATCAATTAGAACAGAATAGCACACTTCAGTTCCAA
CTGATTTATCAAAAACTTTACTTATGCTCTAATGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCAACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYLRHVPRRFKSGFREGMMIFCSLFINIRAQILLYQLEQNSTLQFQ
LIYQKLYLCSND