; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G3956 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G3956
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationctg105:761319..765125
RNA-Seq ExpressionCucsat.G3956
SyntenyCucsat.G3956
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047513.1 hypothetical protein E6C27_scaffold498G001420 [Cucumis melo var. makuwa]1.64e-4354.74Show/hide
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           FEPSR S +P+  ++ F +PMEDWS  ++  + K FSIES++F +I+TTF  YNEVDT
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KGN61523.1 hypothetical protein Csa_006491 [Cucumis sativus]8.24e-7871.35Show/hide
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TYK26483.1 hypothetical protein E5676_scaffold313G00490 [Cucumis melo var. makuwa]7.15e-4054.74Show/hide
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        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
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XP_031736681.1 uncharacterized protein LOC116402062 [Cucumis sativus]2.55e-9161.99Show/hide
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        L  FEPS PS LPL+ ELTF+ PMEDWS  QV+ +GK+FSIES++F +I+  FS + E +TILI S GS+++FS +P  E  + EESG CLI GDRE+ET
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KB76 Uncharacterized protein1.60e-6160.87Show/hide
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A0A0A0LIE0 Uncharacterized protein3.99e-7871.35Show/hide
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A0A1S3C8J1 uncharacterized protein LOC1034980102.44e-3735.75Show/hide
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        + +FE       PLHHEL   P +  +  QV   G  F++ S     I+    ++++ DT+ +T  GSQ+ FS +  +EII+ +E G C I+G + EVET
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A0A5A7TVD7 Uncharacterized protein7.96e-4454.74Show/hide
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A0A5D3DSC2 Uncharacterized protein3.46e-4054.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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