; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G3965 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G3965
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationctg105:1006987..1013043
RNA-Seq ExpressionCucsat.G3965
SyntenyCucsat.G3965
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147177.1 uncharacterized protein LOC101211925 [Cucumis sativus]7.81e-21198.98Show/hide
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XP_008460715.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499480 [Cucumis melo]2.76e-20194.65Show/hide
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XP_022964280.1 uncharacterized protein LOC111464344 [Cucurbita moschata]9.77e-13872.28Show/hide
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XP_023000532.1 uncharacterized protein LOC111494773 [Cucurbita maxima]5.06e-13771.76Show/hide
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        L
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XP_038907133.1 uncharacterized protein LOC120092944 [Benincasa hispida]2.50e-16883.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKI3 Uncharacterized protein3.78e-21198.98Show/hide
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A0A1S3CD27 uncharacterized protein LOC1034994801.33e-20194.65Show/hide
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A0A5A7SNV9 Uncharacterized protein1.33e-20194.65Show/hide
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A0A6J1HKD0 uncharacterized protein LOC1114643444.73e-13872.28Show/hide
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        +ML
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A0A6J1KDX0 uncharacterized protein LOC1114947732.45e-13771.76Show/hide
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        MKAL  HP+  F  PWR+ FP  SS FRF+S   HYRP D NAE+F S  FRRR++  E       QQGFDPGIRF   RK RRRWWSD+PAP+F+++ S
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Query:  GNEEGNGKMGYGYQSWELGSNGGEVRNEGRNGNSFGGWEDLDGVGTERKPKPGVRARKQSSTT--MEKGKLNWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKM
        GN  G GKMGYGYQSWE+G+NGGEVR E R+G +FGGWEDLDGV      + GVR +K+SS++  ME+GKL+WREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWT+M
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Query:  L
        L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G33250.1 unknown protein3.5e-2535.06Show/hide
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        D+ +G+   + G R RK R  W    +D   D +D+  G             IL+E++D+VWI K FKSYG+ LP II+SL  ++GPKAFL++LA+ +G 
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Query:  SIIALALEKLWGTPERKPKRRTRSKTRKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNEEGNGKMGYGYQSWELGSNG-GEVRNEGRNGNSFGGWEDLDGVGTER
        S++  A +KL G  +R+                T  +     E++EEEV    E  + ++ Y   +     NG G  R+     + FGGW++LDG+GT  
Subjt:  SIIALALEKLWGTPERKPKRRTRSKTRKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNEEGNGKMGYGYQSWELGSNG-GEVRNEGRNGNSFGGWEDLDGVGTER

Query:  KPKPGVRARKQSSTTMEKGKLNWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML
          +P    +K+    + K K   REK ++ PLLLRLL+++FPFL ++T ML
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AT3G04310.1 unknown protein1.4e-2636.5Show/hide
Query:  PNAETFASHNFR--RRDQYSEPDFEDDEQQGFDPGIRFRKNRRRWWSDDPAPDFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIISLLLNSGPKAFLM
        PN  +  S + R  R   + E  F D+    F+ G   RK +R WW DD   D +D    + +E  D   +F+VF++  W L PI ISLLL +   A +M
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Query:  ALALPLGQSIIALALEKLWGTPERKPKRRTRSKT--RKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNEEGNGKMGYGYQSWELGSNGGEVRNEGRNGNSFGGWE
        ALA+PL QS+++L + K+W  P  +  +R+R  T  R     S RT + ++          GN  G    G GY+SW +G +     +    G  +GGW+
Subjt:  ALALPLGQSIIALALEKLWGTPERKPKRRTRSKT--RKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNEEGNGKMGYGYQSWELGSNGGEVRNEGRNGNSFGGWE

Query:  DLDGVGTERKPKP---GVRARKQSSTTMEKGKLNWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML
        DLD +   R   P    VR ++Q      K    WR K  + PLLLR+LIA FPFLGSWTK+L
Subjt:  DLDGVGTERKPKP---GVRARKQSSTTMEKGKLNWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGGCCCTGTTTCCTCATCCTTCTCATCCGTTTCCATTTCCATGGCGGACCTTCCCATCTTCTTCCTTCCGCTTCACTTCTACACTCCTCCACTACCGTCCTCCCGA
CCCCAATGCTGAAACCTTCGCCTCCCACAATTTCAGACGCAGAGATCAATACTCTGAACCCGACTTCGAAGACGATGAACAGCAGGGCTTCGATCCCGGTATTCGCTTCC
GTAAGAACCGTCGACGTTGGTGGTCCGATGACCCGGCGCCGGACTTCGAAGACCAACCTTCTGGGATCTTGGATGAAGTCATCGATAGTGTCTGGATTTTCAAGGTATTC
AAATCCTACGGCTGGACACTTCCACCCATAATCATCTCACTGCTGTTAAACTCAGGACCAAAAGCTTTTCTAATGGCGTTAGCCCTTCCACTAGGCCAATCAATCATAGC
TCTGGCACTAGAGAAGCTGTGGGGAACACCAGAAAGGAAGCCGAAACGCAGAACTAGAAGCAAGACCAGGAAGAGGCCATTTTACAGTACTAGGACTAGTCGGGTTCAAG
AGGAAGAAGATGACGAAGAAGAAGTAGCTAGAGGAAATGAGGAAGGTAATGGAAAGATGGGCTATGGATATCAGTCATGGGAACTTGGTAGCAATGGTGGTGAAGTTAGA
AATGAGGGCAGAAACGGGAACAGTTTTGGTGGATGGGAGGATCTTGATGGAGTTGGAACTGAGAGAAAGCCAAAACCTGGGGTTAGAGCCAGAAAACAAAGCAGTACAAC
AATGGAAAAGGGCAAGTTAAATTGGAGAGAAAAGAAAAGTGATACTCCCTTGTTGTTGAGATTGTTAATTGCTGTTTTTCCATTTTTGGGTTCATGGACTAAAATGCTTT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGGCCCTGTTTCCTCATCCTTCTCATCCGTTTCCATTTCCATGGCGGACCTTCCCATCTTCTTCCTTCCGCTTCACTTCTACACTCCTCCACTACCGTCCTCCCGA
CCCCAATGCTGAAACCTTCGCCTCCCACAATTTCAGACGCAGAGATCAATACTCTGAACCCGACTTCGAAGACGATGAACAGCAGGGCTTCGATCCCGGTATTCGCTTCC
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TCTGGCACTAGAGAAGCTGTGGGGAACACCAGAAAGGAAGCCGAAACGCAGAACTAGAAGCAAGACCAGGAAGAGGCCATTTTACAGTACTAGGACTAGTCGGGTTCAAG
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AG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKALFPHPSHPFPFPWRTFPSSSFRFTSTLLHYRPPDPNAETFASHNFRRRDQYSEPDFEDDEQQGFDPGIRFRKNRRRWWSDDPAPDFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVF
KSYGWTLPPIIISLLLNSGPKAFLMALALPLGQSIIALALEKLWGTPERKPKRRTRSKTRKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNEEGNGKMGYGYQSWELGSNGGEVR
NEGRNGNSFGGWEDLDGVGTERKPKPGVRARKQSSTTMEKGKLNWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML