CuGenDBv2

Gene ID	Cucsat.G4038
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Description	Transposon, En/Spm-like protein
Genome location	ctg105:2763691..2766542
RNA-Seq Expression	Cucsat.G4038
Synteny	Cucsat.G4038
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0066411.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold21G004890 [Cucumis melo var. makuwa]

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KAE8651845.1 hypothetical protein Csa_006474 [Cucumis sativus]

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100

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TYJ99784.1 uncharacterized protein E5676_scaffold896G00240 [Cucumis melo var. makuwa]

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TYK00873.1 uncharacterized protein E5676_scaffold602G00300 [Cucumis melo var. makuwa]

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TYK19731.1 uncharacterized protein E5676_scaffold214G00370 [Cucumis melo var. makuwa]

6.00e-85

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TrEMBL top hits

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A0A5A7V207 Uncharacterized protein

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A0A5A7VLA9 Uncharacterized protein

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A0A5D3BL79 Uncharacterized protein

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A0A5D3BM74 Uncharacterized protein

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A0A5D3D835 Uncharacterized protein

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

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CDS sequence

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ATGTCCCCGACTTATAGGCGATGGACATTCCATGGAGATACAGTTGATCTTTCTCCATTTTTGAGATCTAAGTCGAGGTTTCTAGGTGCAACATTTTCCAATTTAAGTGA
ACATAGAGAAGAGAATGTAAATCTTAGAGAAAACATTGAAGCTAGAGATACTATGGATGATGAGATGCTAGAGATGATTCATGATCTACATGGGCCACTTTTCGAAGAAA
CTAAAAGAAAATCAAACGAGCAAGATGAGTCCGATAAAATAAGTGGAATATTTCCTGAAATAGAAGAAGAGTTATATCCGGGATATCTAAAGTTCACTTCGTTTAATTTT
TTAGTGAAACTTATGCACATTAGGGTGCTTAATTGTTGGAGCAACAAATCCTTTGATATGTTGCGTGAATCATTAAAAAAAGCCTTTCCAGATGGTGTGAAACTACATGC
CTCCTATTATGAGTCTAAGAAAAGACTACGTGATCGTTGGGAACGAGAAAACTTTAAGAGTAGATCTGAAGAAAATACCAAGGCATGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MSPTYRRWTFHGDTVDLSPFLRSKSRFLGATFSNLSEHREENVNLRENIEARDTMDDEMLEMIHDLHGPLFEETKRKSNEQDESDKISGIFPEIEEELYPGYLKFTSFNF
LVKLMHIRVLNCWSNKSFDMLRESLKKAFPDGVKLHASYYESKKRLRDRWERENFKSRSEENTKA

Cucsat.G4038 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome