; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G4738 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G4738
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptiontranscription factor HY5-like
Genome locationctg1227:2751001..2753817
RNA-Seq ExpressionCucsat.G4738
SyntenyCucsat.G4738
Gene Ontology termsGO:0010017 - red or far-red light signaling pathway (biological process)
GO:0010099 - regulation of photomorphogenesis (biological process)
GO:0010114 - response to red light (biological process)
GO:0010218 - response to far red light (biological process)
GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598576.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.91e-8896.84Show/hide
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NP_001284656.1 Transcription factor HY5-like [Cucumis melo]7.99e-91100Show/hide
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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]6.27e-8896.84Show/hide
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XP_023545723.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.80e-8796.84Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein3.87e-91100Show/hide
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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY53.87e-91100Show/hide
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A0A6J1BRS2 transcription factor HY5-like3.87e-91100Show/hide
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A0A6J1K7Q9 transcription factor HY5-like3.04e-8896.84Show/hide
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F1DQG1 BZIP23.87e-91100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24646 Transcription factor HY51.8e-5378.48Show/hide
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        SAQQARERKKAYL++LE RVKDLE KNSELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT ++R G
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Q54WN7 Probable basic-leucine zipper transcription factor F5.4e-0544.44Show/hide
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Q8TFU8 Transcriptional activator hacA1.6e-0439.24Show/hide
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        RKR ++  +KE +R++R+LRNR +AQ +RERK+  +  LE    D+E++N  L +RL+ ++ EN  L Q +   +A  R
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Q8W191 Transcription factor HY5-like5.0e-1950.69Show/hide
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Q9SM50 Transcription factor HY51.7e-5181.01Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog1.1e-1646.09Show/hide
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AT3G17609.2 HY5-homolog3.5e-2050.69Show/hide
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.6e-1752.63Show/hide
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AT3G17609.4 HY5-homolog3.7e-1746.09Show/hide
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        +  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein1.3e-5478.48Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTTCGGAAGCCGTCGGATCAAACAACATTTAACGGCGTGAATCCATCCTTCAGTCCTTGCTTTCTCAAAATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTCT
GCCTTCGAGCAGTGAAAGATCTTCCAGCTCTGCTCTTCACCTCGAAGTTAAAGAAGGAATGGAGAGCGATGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGGGAATCGG
CGGGAACATCGGCTTCCGGGAGGGATACTGGTTCGGTAGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGGAGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAA
AGCAAGAGACTCAAGAGATTGCTGAGGAATAGGGTATCGGCACAGCAAGCAAGGGAGAGAAAAAAGGCGTATTTGAATGATTTAGAGATAAGGGTGAAGGATTTGGAGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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