; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G4828 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G4828
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationctg1227:4316019..4317339
RNA-Seq ExpressionCucsat.G4828
SyntenyCucsat.G4828
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0053284.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]2.16e-15894.78Show/hide
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XP_008455958.1 PREDICTED: fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo]2.05e-16693.92Show/hide
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XP_038900968.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]1.41e-15790.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQV6 FAS1 domain-containing protein9.01e-179100Show/hide
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A0A1S3C2T8 fasciclin-like arabinogalactan protein 79.90e-16793.92Show/hide
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A0A5A7UDG5 Fasciclin-like arabinogalactan protein 71.05e-15894.78Show/hide
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A0A5D3CIW8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 73.22e-15894.76Show/hide
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A0A6J1CEN1 fasciclin-like arabinogalactan protein 76.55e-14484.09Show/hide
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        TD PPAPAPVP+P+VAPAAD+PSAETEG   PSS  SPSSSFR+ GG L  QLVLA+S G+LLF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 124.2e-2740.1Show/hide
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        P PA APAP G   ++  +L  AG F  F+  L+ST V      Q NNS+ GITIF P D++F+ LK  +L++LT +Q+  L+ FH +P Y + ++F  +
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        S  +P+ T AG+     + LN T +  T++I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ +F    P  PAP P P V     + S + +     SS
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Query:  TESPSSS
         +SP+ +
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 113.7e-2335.14Show/hide
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        APAP P+G   ++  +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q N +S  G+T+F P D AF+SLK  +L++L+  Q+  L+ FH LP   T+  F  +S 
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Query:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSSTE
         +P+ T AG+    ++ LN T +   ++I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   PAPAP     V+    + S   +G  S  S++
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Query:  SPSSSFRVGGGVLWIQLVLAIS
        +  + F  G  +  +  + A S
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 61.4e-2236.1Show/hide
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        APAP      ++L  +L     F   +  L +T+V      Q N+S++G+TIF P D AF+ LK  +L++LT  Q+  L+L+H +P YY+L+D   L   
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        +P+ T A    G  + LNFT    S  +++S+G   T++++++    P+AVY VD VLLPE +FGT   P  AP P    + + AD+P+A+ E   + SS
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Query:  TESPS
         +  S
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 77.6e-6957.41Show/hide
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        K+ +     +   ++CS+   A+TA+ P   +P+  P PAPAPAP  ++V+L +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QANN+EEGITIFVPKD AF 
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        + K P LSNLTKDQ K L+LFH LPHYY+L++F  LSQ  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
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Query:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S     G  +L   + + ISG + LF
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 92.4e-2237.44Show/hide
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        A+   A   APAP PAG  ++L  +L   G F  F+  L  T+V      Q N+S EG+T+F P D AF +LK  +L+ L+ D +  L+L+H  P YY++
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Query:  ADFNELSQKSPITTFAGEQ----YTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEG
         D   LS  +P+ T A  +    Y LNFT  +  I++S+G+  T++S+S+    P+AVY VD VLLP  +FG       AP P        D  S  T+ 
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Query:  SVSPSSTESPSSSFRVGGG
        + SPS  +S S   +VG G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03870.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 91.7e-2337.44Show/hide
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Query:  ADFNELSQKSPITTFAGEQ----YTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEG
         D   LS  +P+ T A  +    Y LNFT  +  I++S+G+  T++S+S+    P+AVY VD VLLP  +FG       AP P        D  S  T+ 
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Query:  SVSPSSTESPSSSFRVGGG
        + SPS  +S S   +VG G
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AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 75.4e-7057.41Show/hide
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        K+ +     +   ++CS+   A+TA+ P   +P+  P PAPAPAP  ++V+L +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QANN+EEGITIFVPKD AF 
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Query:  SLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQ K L+LFH LPHYY+L++F  LSQ  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
Subjt:  SLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD

Query:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S     G  +L   + + ISG + LF
Subjt:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF

AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 75.4e-7057.41Show/hide
Query:  KLHMIFLFGIWLTLLCSSPVCARTAAKPPAASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANNSEEGITIFVPKDTAFS
        K+ +     +   ++CS+   A+TA+ P   +P+  P PAPAPAP  ++V+L +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QANN+EEGITIFVPKD AF 
Subjt:  KLHMIFLFGIWLTLLCSSPVCARTAAKPPAASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANNSEEGITIFVPKDTAFS

Query:  SLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQ K L+LFH LPHYY+L++F  LSQ  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
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Query:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S     G  +L   + + ISG + LF
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AT5G03170.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 112.6e-2435.14Show/hide
Query:  APAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQAN-NSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQ
        APAP P+G   ++  +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q N +S  G+T+F P D AF+SLK  +L++L+  Q+  L+ FH LP   T+  F  +S 
Subjt:  APAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQAN-NSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQ

Query:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSSTE
         +P+ T AG+    ++ LN T +   ++I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   PAPAP     V+    + S   +G  S  S++
Subjt:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSSTE

Query:  SPSSSFRVGGGVLWIQLVLAIS
        +  + F  G  +  +  + A S
Subjt:  SPSSSFRVGGGVLWIQLVLAIS

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 123.0e-2840.1Show/hide
Query:  PVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNEL
        P PA APAP G   ++  +L  AG F  F+  L+ST V      Q NNS+ GITIF P D++F+ LK  +L++LT +Q+  L+ FH +P Y + ++F  +
Subjt:  PVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNEL

Query:  SQKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSS
        S  +P+ T AG+     + LN T +  T++I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ +F    P  PAP P P V     + S + +     SS
Subjt:  SQKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSS

Query:  TESPSSS
         +SP+ +
Subjt:  TESPSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACTTCATATGATTTTCTTGTTTGGTATTTGGCTGACGCTGCTGTGCTCTTCACCCGTATGTGCTCGAACTGCTGCTAAGCCTCCTGCAGCTAGTCCGATTCCTGC
ACCGGTACCAGCCCCAGCACCTGCACCAGCTGGCGATCATGTTGACCTTGCTGATTTGCTTACAGTAGCTGGTCCCTTCCACAAGTTCCTTGGCTACCTCGAATCCACCA
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CAGTTTACCAAGTTGATCACGTACTCCTTCCAGAGGCAATCTTTGGAACTGATTTCCCTCCTGCCCCAGCTCCAGTACCGACCCCTGACGTTGCTCCTGCTGCTGATACT
CCATCTGCTGAAACTGAGGGCAGTGTTTCTCCATCATCGACGGAGTCACCATCTTCTTCCTTTAGGGTTGGTGGAGGGGTACTCTGGATCCAGTTGGTTTTAGCAATTTC
AGGTGGACTGCTCCTATTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LTKDQRKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADT
PSAETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF