; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G5092 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G5092
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionDEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X1
Genome locationctg1227:3550240..3551479
RNA-Seq ExpressionCucsat.G5092
SyntenyCucsat.G5092
Gene Ontology termsGO:0006281 - DNA repair (biological process)
GO:0032508 - DNA duplex unwinding (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
GO:0043138 - 3'-5' DNA helicase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR039686 - FANCM/Mph1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652234.1 hypothetical protein Csa_022145 [Cucumis sativus]5.12e-10099.41Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFRTFPMATS+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

TYK06568.1 Fanconi anemia group M protein isoform X6 [Cucumis melo var. makuwa]2.45e-10094.58Show/hide
Query:  PMATSSREFTVDDNDDDD---DFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVE
        PMA S+REFTVDDNDDDD   DFDWEAAVKEIDVA LSGIHSASSHSLHPSLTESSDA AETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFI+NAKF+KKTMDVE
Subjt:  PMATSSREFTVDDNDDDD---DFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVE

Query:  KPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        KPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  KPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

XP_031736809.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X4 [Cucumis sativus]1.64e-9999.41Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFRTFPMATS+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

XP_031736810.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X5 [Cucumis sativus]1.20e-9999.41Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFRTFPMATS+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

XP_031736812.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X7 [Cucumis sativus]2.71e-10099.41Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFRTFPMATS+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPX7 Uncharacterized protein1.07e-11099.41Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFRTFPMATS+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

A0A1S3B2A7 Fanconi anemia group M protein isoform X42.90e-9595.27Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFR  PMA S+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVA LSGIHSASSHSLHPSLTESSDA AETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFI+NAKF+KKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

A0A1S3B2S2 Fanconi anemia group M protein isoform X62.60e-9595.27Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFR  PMA S+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVA LSGIHSASSHSLHPSLTESSDA AETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFI+NAKF+KKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

A0A1S4DTZ2 Fanconi anemia group M protein isoform X52.90e-9595.27Show/hide
Query:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM
        MAFR  PMA S+REFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVA LSGIHSASSHSLHPSLTESSDA AETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFI+NAKF+KKTM
Subjt:  MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTM

Query:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  DVEKPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

A0A5D3C5Y0 Fanconi anemia group M protein isoform X61.19e-10094.58Show/hide
Query:  PMATSSREFTVDDNDDDD---DFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVE
        PMA S+REFTVDDNDDDD   DFDWEAAVKEIDVA LSGIHSASSHSLHPSLTESSDA AETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFI+NAKF+KKTMDVE
Subjt:  PMATSSREFTVDDNDDDD---DFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVE

Query:  KPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        KPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  KPVQDPGLVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
I3XHK1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM7.9e-2752.87Show/hide
Query:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETP-ASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVE-D
        ++  ++D +FDWEAAVKEID+A L   +++SS S H            TP A+ P++    K    RQSTL +FI   + + +   V   V + G+ + D
Subjt:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETP-ASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVE-D

Query:  SVGLVDIDEEAAKTWIYPVN--VPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        +  LV ID EAAKTWIYPVN  VPLRDYQ AITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  SVGLVDIDEEAAKTWIYPVN--VPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

Q7SDF3 ATP-dependent DNA helicase mph11.6e-1168Show/hide
Query:  DIDEEAAKTWIYPVNV-PLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAA
        +ID E  KTW+YP+N+ P+RDYQ +I K  LF+NTLVALPTGLGKT IAA
Subjt:  DIDEEAAKTWIYPVNV-PLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAA

Q8BGE5 Fanconi anemia group M protein homolog1.8e-1071.11Show/hide
Query:  AAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        A   WIYP N P+RDYQL I+++ALF NTLV LPTGLGKT IAAV
Subjt:  AAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

Q8IYD8 Fanconi anemia group M protein2.3e-1071.11Show/hide
Query:  AAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        A   WIYP N P+RDYQL I++ ALF NTLV LPTGLGKT IAAV
Subjt:  AAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

Q9UT23 ATP-dependent DNA helicase fml11.2e-1166Show/hide
Query:  DIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        ++DE AA+ W+YP+NV  RDYQ  I + ALF N LVALPTGLGKT IAAV
Subjt:  DIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35530.1 DEAD/DEAH box RNA helicase family protein1.3e-2752.26Show/hide
Query:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETP-ASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVE-D
        ++  ++D +FDWEAAVKEID+A L   +++SS S H            TP A+ P++    K    RQSTL +FI   + + +   V   V + G+ + D
Subjt:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETP-ASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVE-D

Query:  SVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        +  LV ID EAAKTWIYP  VPLRDYQ AITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  SVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

AT1G35530.2 DEAD/DEAH box RNA helicase family protein1.3e-2752.26Show/hide
Query:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETP-ASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVE-D
        ++  ++D +FDWEAAVKEID+A L   +++SS S H            TP A+ P++    K    RQSTL +FI   + + +   V   V + G+ + D
Subjt:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETP-ASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVE-D

Query:  SVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
        +  LV ID EAAKTWIYP  VPLRDYQ AITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV
Subjt:  SVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV

AT1G36020.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DEAD/DEAH box RNA helicase family protein (TAIR:AT1G35530.1)3.2e-0735.65Show/hide
Query:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVEDSV
        ++  ++D +FDWEAAVKEID+A L       + + HP                P++E   K    RQSTL +FI   + + +   V    +  G   D+ 
Subjt:  VDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPGLVEDSV

Query:  GLVDIDEEAAKTWIY
         LV+ID EAAKTWIY
Subjt:  GLVDIDEEAAKTWIY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTTAGGACGTTTCCGATGGCAACAAGTAGTCGAGAATTCACTGTCGACGACAACGACGACGACGACGACTTCGACTGGGAAGCAGCCGTCAAAGAAATTGACGT
GGCCAGCCTATCAGGAATTCACTCTGCTTCATCACATTCACTTCATCCTTCCCTAACGGAATCCTCCGACGCCGCTGCAGAAACTCCAGCTTCATTTCCACTTTCCGAGG
AGAATGAAAAACGCGGAACTTCTCGCCAGTCTACACTTCACAGATTTATCGTGAATGCCAAGTTTCGAAAGAAAACAATGGACGTCGAAAAACCGGTTCAAGATCCCGGC
CTTGTTGAAGACTCGGTTGGTCTTGTTGACATAGATGAGGAGGCAGCTAAGACCTGGATATATCCAGTTAATGTTCCTCTTCGGGATTATCAGCTGGCTATTACAAAGAC
AGCACTATTTTCAAATACATTGGTGGCTTTGCCTACAGGACTTGGAAAGACTCTCATTGCTGCAGTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTTTAGGACGTTTCCGATGGCAACAAGTAGTCGAGAATTCACTGTCGACGACAACGACGACGACGACGACTTCGACTGGGAAGCAGCCGTCAAAGAAATTGACGT
GGCCAGCCTATCAGGAATTCACTCTGCTTCATCACATTCACTTCATCCTTCCCTAACGGAATCCTCCGACGCCGCTGCAGAAACTCCAGCTTCATTTCCACTTTCCGAGG
AGAATGAAAAACGCGGAACTTCTCGCCAGTCTACACTTCACAGATTTATCGTGAATGCCAAGTTTCGAAAGAAAACAATGGACGTCGAAAAACCGGTTCAAGATCCCGGC
CTTGTTGAAGACTCGGTTGGTCTTGTTGACATAGATGAGGAGGCAGCTAAGACCTGGATATATCCAGTTAATGTTCCTCTTCGGGATTATCAGCTGGCTATTACAAAGAC
AGCACTATTTTCAAATACATTGGTGGCTTTGCCTACAGGACTTGGAAAGACTCTCATTGCTGCAGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAFRTFPMATSSREFTVDDNDDDDDFDWEAAVKEIDVASLSGIHSASSHSLHPSLTESSDAAAETPASFPLSEENEKRGTSRQSTLHRFIVNAKFRKKTMDVEKPVQDPG
LVEDSVGLVDIDEEAAKTWIYPVNVPLRDYQLAITKTALFSNTLVALPTGLGKTLIAAV