; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cucsat.G5103 (gene) of Cucumber (B10) v3 genome

Gene IDCucsat.G5103
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. B10 (Cucumber (B10) v3)
DescriptionTranscription initiation factor IIA subunit 2
Genome locationctg1227:3785136..3792616
RNA-Seq ExpressionCucsat.G5103
SyntenyCucsat.G5103
Gene Ontology termsGO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0051123 - RNA polymerase II preinitiation complex assembly (biological process)
GO:0005672 - transcription factor TFIIA complex (cellular component)
GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
GO:0016251 - RNA polymerase II general transcription initiation factor activity (molecular function)
GO:0017025 - TBP-class protein binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A0A0LQ01 Transcription initiation factor IIA subunit 29.96e-70100Show/hide
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A0A1S3B2F6 Transcription initiation factor IIA subunit 23.91e-6796.23Show/hide
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A0A1S3B2V9 Transcription initiation factor IIA subunit 29.96e-70100Show/hide
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A0A6J1J100 Transcription initiation factor IIA subunit 21.59e-6695.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XZI2 Transcription initiation factor IIA subunit 23.9e-4888.68Show/hide
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O74948 Transcription initiation factor IIA subunit 24.2e-2652.53Show/hide
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Q0DLD3 Transcription initiation factor IIA subunit 23.9e-4888.68Show/hide
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Q39236 Transcription initiation factor IIA subunit 28.7e-4888.68Show/hide
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Q54ND1 Transcription initiation factor IIA subunit 24.7e-2555.88Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G24440.1 transcription initiation factor IIA gamma chain / TFIIA-gamma (TFIIA-S)6.2e-4988.68Show/hide
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AT4G24440.2 transcription initiation factor IIA gamma chain / TFIIA-gamma (TFIIA-S)6.2e-4988.68Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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